利用生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)及軟件,對(duì)綿羊羥色胺受體4基因（hydroxytryptamine receptor4,HTR4）進(jìn)行生物信息學(xué)分析,以初步了解其結(jié)構(gòu)并進(jìn)行功能預(yù)測(cè)。結(jié)果表明,綿羊HTR4基因所含最大長(zhǎng)度的開(kāi)放閱讀框?yàn)? 317 bp,編碼438個(gè)氨基酸殘基。HTR4基因編碼的蛋白分子質(zhì)量為49 437.09 KDa,理論等電點(diǎn)（pI）為8.32。亞細(xì)胞定位結(jié)果表明其編碼產(chǎn)物主要定位于質(zhì)膜（60.9%）,且不屬于分泌蛋白。HTR4蛋白不存在信號(hào)肽序列,存在7段跨膜結(jié)構(gòu)且無(wú)低復(fù)雜性段區(qū)域,該蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)以α螺旋為主,且三級(jí)結(jié)構(gòu)主要由α折疊纏繞形成。 

【文章來(lái)源】：甘肅農(nóng)業(yè)科技. 2020,(10)

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【部分圖文】：

綿羊HTR4基因序列的ORF分析

綿羊HTR4基因編碼的蛋白氨基酸組成

HTR4基因在多個(gè)物種中都有表達(dá)。采用DNAMAN對(duì)兔、牛、綿羊、山羊、貓、馬、人、豚鼠、豬、狗和雞HTR4蛋白多序列比對(duì)的結(jié)果如圖3所示，可以看出，HTR4基因在這11個(gè)物種中均有表達(dá)，且綿羊與牛和山羊的HTR4氨基酸序列同源性較高，這也說(shuō)明了它們?cè)谶M(jìn)化過(guò)程具有較近的親緣關(guān)系。HTR4編碼產(chǎn)物同源樹(shù)證明，在分析中選取的11個(gè)物種中，綿羊、山羊和牛的同源性最高（圖4）。圖4 11個(gè)物種的HTR4基因編碼產(chǎn)物序列的同源樹(shù)

【參考文獻(xiàn)】：
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碩士論文
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本文編號(hào)：3055260