綿羊HTR4基因的生物信息學(xué)分析
發(fā)布時間:2021-02-28 03:38
利用生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫及軟件,對綿羊羥色胺受體4基因(hydroxytryptamine receptor4,HTR4)進(jìn)行生物信息學(xué)分析,以初步了解其結(jié)構(gòu)并進(jìn)行功能預(yù)測。結(jié)果表明,綿羊HTR4基因所含最大長度的開放閱讀框為1 317 bp,編碼438個氨基酸殘基。HTR4基因編碼的蛋白分子質(zhì)量為49 437.09 KDa,理論等電點(pI)為8.32。亞細(xì)胞定位結(jié)果表明其編碼產(chǎn)物主要定位于質(zhì)膜(60.9%),且不屬于分泌蛋白。HTR4蛋白不存在信號肽序列,存在7段跨膜結(jié)構(gòu)且無低復(fù)雜性段區(qū)域,該蛋白的二級結(jié)構(gòu)以α螺旋為主,且三級結(jié)構(gòu)主要由α折疊纏繞形成。
【文章來源】:甘肅農(nóng)業(yè)科技. 2020,(10)
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
綿羊HTR4基因序列的ORF分析
綿羊HTR4基因編碼的蛋白氨基酸組成
HTR4基因在多個物種中都有表達(dá)。采用DNAMAN對兔、牛、綿羊、山羊、貓、馬、人、豚鼠、豬、狗和雞HTR4蛋白多序列比對的結(jié)果如圖3所示,可以看出,HTR4基因在這11個物種中均有表達(dá),且綿羊與牛和山羊的HTR4氨基酸序列同源性較高,這也說明了它們在進(jìn)化過程具有較近的親緣關(guān)系。HTR4編碼產(chǎn)物同源樹證明,在分析中選取的11個物種中,綿羊、山羊和牛的同源性最高(圖4)。圖4 11個物種的HTR4基因編碼產(chǎn)物序列的同源樹
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]5-羥色胺4受體激動劑的促腸道動力作用研究[J]. 李曉麗,吳博威. 中國藥物與臨床. 2018(08)
[2]綿羊PTGER3基因生物信息學(xué)分析[J]. 隋景巍. 鄉(xiāng)村科技. 2017(11)
[3]綿羊ANXA10基因生物信息學(xué)分析[J]. 張小雪,李發(fā)弟,王維民. 甘肅農(nóng)業(yè)科技. 2016(06)
[4]綿羊ESR基因生物信息學(xué)分析[J]. 張小雪,潘香羽,李發(fā)弟,王維民. 甘肅農(nóng)業(yè)科技. 2014(09)
[5]5-羥色胺受體對記憶的調(diào)節(jié)作用[J]. 于平,尹文娟,于萍. 首都師范大學(xué)學(xué)報(社會科學(xué)版). 2009(S4)
[6]5-HTR4和GABRG2基因多態(tài)性與精神分裂癥關(guān)系[J]. 劉麗波,鞠桂芝,史杰萍,于雅琴,尉軍. 中國公共衛(wèi)生. 2007(12)
[7]5-羥色胺4受體對消化道運動的作用及臨床意義[J]. 魏蘭福. 醫(yī)學(xué)綜述. 2002(11)
[8]信號肽假說的提出及證實——1999年諾貝爾生理學(xué)醫(yī)學(xué)獎獲得者Günter Blobel簡介[J]. 葉方寅. 國外醫(yī)學(xué)(分子生物學(xué)分冊). 1999(06)
碩士論文
[1]基于二級結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)預(yù)測[D]. 孔繁良.濟(jì)南大學(xué) 2016
[2]雞FATP1基因cDNA的克隆、組織表達(dá)及其生物信息學(xué)分析[D]. 羅軼.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
本文編號:3055260
【文章來源】:甘肅農(nóng)業(yè)科技. 2020,(10)
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
綿羊HTR4基因序列的ORF分析
綿羊HTR4基因編碼的蛋白氨基酸組成
HTR4基因在多個物種中都有表達(dá)。采用DNAMAN對兔、牛、綿羊、山羊、貓、馬、人、豚鼠、豬、狗和雞HTR4蛋白多序列比對的結(jié)果如圖3所示,可以看出,HTR4基因在這11個物種中均有表達(dá),且綿羊與牛和山羊的HTR4氨基酸序列同源性較高,這也說明了它們在進(jìn)化過程具有較近的親緣關(guān)系。HTR4編碼產(chǎn)物同源樹證明,在分析中選取的11個物種中,綿羊、山羊和牛的同源性最高(圖4)。圖4 11個物種的HTR4基因編碼產(chǎn)物序列的同源樹
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]5-羥色胺4受體激動劑的促腸道動力作用研究[J]. 李曉麗,吳博威. 中國藥物與臨床. 2018(08)
[2]綿羊PTGER3基因生物信息學(xué)分析[J]. 隋景巍. 鄉(xiāng)村科技. 2017(11)
[3]綿羊ANXA10基因生物信息學(xué)分析[J]. 張小雪,李發(fā)弟,王維民. 甘肅農(nóng)業(yè)科技. 2016(06)
[4]綿羊ESR基因生物信息學(xué)分析[J]. 張小雪,潘香羽,李發(fā)弟,王維民. 甘肅農(nóng)業(yè)科技. 2014(09)
[5]5-羥色胺受體對記憶的調(diào)節(jié)作用[J]. 于平,尹文娟,于萍. 首都師范大學(xué)學(xué)報(社會科學(xué)版). 2009(S4)
[6]5-HTR4和GABRG2基因多態(tài)性與精神分裂癥關(guān)系[J]. 劉麗波,鞠桂芝,史杰萍,于雅琴,尉軍. 中國公共衛(wèi)生. 2007(12)
[7]5-羥色胺4受體對消化道運動的作用及臨床意義[J]. 魏蘭福. 醫(yī)學(xué)綜述. 2002(11)
[8]信號肽假說的提出及證實——1999年諾貝爾生理學(xué)醫(yī)學(xué)獎獲得者Günter Blobel簡介[J]. 葉方寅. 國外醫(yī)學(xué)(分子生物學(xué)分冊). 1999(06)
碩士論文
[1]基于二級結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)預(yù)測[D]. 孔繁良.濟(jì)南大學(xué) 2016
[2]雞FATP1基因cDNA的克隆、組織表達(dá)及其生物信息學(xué)分析[D]. 羅軼.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
本文編號:3055260
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