BMPER和FABP2基因啟動子區(qū)變異與豬肌內脂肪含量相關性研究
發(fā)布時間:2021-02-25 02:01
肌內脂肪含量(IMF)是影響豬肉品質最關鍵的因之一。一般認為,IMF越低,肌肉的多汁性、嫩度、風味及總體可接受度越低。IMF的提高能夠很好的改善豬肉的感觀品質和食用品質,因此,提高IMF已成為當今畜牧業(yè)、尤其是遺傳育種領域的研究熱點。本研究在前期SNP芯片分析的基礎上,選擇BMPER和FABP2基因作為候選基因,研究其啟動子區(qū)變異與豬肌內脂肪含量的相關性,并對突變位點的功能進行驗證和分析。實驗一驗證了BMPER基因啟動子區(qū)兩個SNP位點與IMF的相關性。首先通過構建DNA池及BMPER啟動子區(qū)序列的PCR擴增結合測序分析發(fā)現c.-1344 A>C與α-1423 A>G兩個SNP位點;采用PCR-SSCP技術對這兩個位點進行基因分型,結果顯示這兩個位點為連鎖的單倍型,且在三元雜交外種豬群體中只有AA/AA和GC/GC兩種基因型。其次通過對不同基因型個體的BMPER表達水平的分析、與IMF含量的關聯分析以及兩種單倍型的熒光活性分析結果顯示,AAA/AA基因型表達水平和IMF含量都顯著高于GC/GC基因型(p<0.05),且AA單倍型啟動子活性也顯著高于GC單倍型(p<...
【文章來源】:南京農業(yè)大學江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數】:63 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略詞
引言
第一章 文獻綜述
1 SNP研究概況
1.1 SNP特點
1.2 SNP檢測方法
2 肌內脂肪研究概況
3 肌內脂肪沉積相關基因
3.1 PPARγ基因簡介
3.2 ADD1基因簡介
3.3 HSL基因簡介
3.4 Leptin基因簡介
3.5 LPL基因簡介
4 BMPER研究概況
5 FABP2研究概況
第二章 BMPER基因啟動子區(qū)變異與豬肌內脂肪含量相關性研究
1. 實驗材料
1.1 實驗動物
1.2 實驗試劑
1.3 儀器設備
1.4 網絡資源及軟件
2 實驗方法
2.1 BMPER基因啟動子區(qū)SNP位點的篩選
2.2 BMPER基因啟動子表達載體構建
2.3 細胞實驗
3 實驗結果
3.1 BMPER基因調控區(qū)SNP位點的篩選
3.2 PCR-SSCP進行基因分型
3.3 突變位點與肌內脂肪含量的相關性
3.4 BMPER基因不同單倍型啟動子表達載體構建
3.5 兩種單倍型載體活性分析
3.6 轉錄結合因子的預測
4 討論
第三章 FABP2基因啟動子區(qū)變異與豬肌內脂肪含量相關性研究
1. 實驗材料
1.1 實驗動物
1.2 試劑
1.3 儀器設備
1.4 網絡資源及軟件
2 實驗方法
2.1 FABP2調控區(qū)SNP位點的篩選
2.2 FABP2基因啟動子表達載體構建
2.3 細胞實驗
3 實驗結果
3.1 FABP2基因調控區(qū)SNP位點的篩選
3.2 FABP2基因不同單倍型啟動子表達載體構建
3.3 FABP2基因不同單倍型啟動子表達載體活性分析
3.4 轉錄結合因子的預測
4 討論
全文結論
參考文獻
致謝
碩士期間發(fā)表論文
【參考文獻】:
期刊論文
[1]單核苷酸多態(tài)性的研究情況及應用[J]. 鄭磊,霍金龍,馬芳菲,曾養(yǎng)志. 上海畜牧獸醫(yī)通訊. 2009(01)
[2]單核苷酸多態(tài)性檢測方法的研究進展[J]. 汪維鵬,倪坤儀,周國華. 遺傳. 2006(01)
[3]單核苷酸多態(tài)性檢測方法的評價[J]. 周晨慧,彭惠民. 現代醫(yī)藥衛(wèi)生. 2005(02)
[4]基于生物信息學的SNP候選位點搜尋方法[J]. 陳煒,張戈,張思仲. 遺傳. 2001(02)
本文編號:3050263
【文章來源】:南京農業(yè)大學江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數】:63 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略詞
引言
第一章 文獻綜述
1 SNP研究概況
1.1 SNP特點
1.2 SNP檢測方法
2 肌內脂肪研究概況
3 肌內脂肪沉積相關基因
3.1 PPARγ基因簡介
3.2 ADD1基因簡介
3.3 HSL基因簡介
3.4 Leptin基因簡介
3.5 LPL基因簡介
4 BMPER研究概況
5 FABP2研究概況
第二章 BMPER基因啟動子區(qū)變異與豬肌內脂肪含量相關性研究
1. 實驗材料
1.1 實驗動物
1.2 實驗試劑
1.3 儀器設備
1.4 網絡資源及軟件
2 實驗方法
2.1 BMPER基因啟動子區(qū)SNP位點的篩選
2.2 BMPER基因啟動子表達載體構建
2.3 細胞實驗
3 實驗結果
3.1 BMPER基因調控區(qū)SNP位點的篩選
3.2 PCR-SSCP進行基因分型
3.3 突變位點與肌內脂肪含量的相關性
3.4 BMPER基因不同單倍型啟動子表達載體構建
3.5 兩種單倍型載體活性分析
3.6 轉錄結合因子的預測
4 討論
第三章 FABP2基因啟動子區(qū)變異與豬肌內脂肪含量相關性研究
1. 實驗材料
1.1 實驗動物
1.2 試劑
1.3 儀器設備
1.4 網絡資源及軟件
2 實驗方法
2.1 FABP2調控區(qū)SNP位點的篩選
2.2 FABP2基因啟動子表達載體構建
2.3 細胞實驗
3 實驗結果
3.1 FABP2基因調控區(qū)SNP位點的篩選
3.2 FABP2基因不同單倍型啟動子表達載體構建
3.3 FABP2基因不同單倍型啟動子表達載體活性分析
3.4 轉錄結合因子的預測
4 討論
全文結論
參考文獻
致謝
碩士期間發(fā)表論文
【參考文獻】:
期刊論文
[1]單核苷酸多態(tài)性的研究情況及應用[J]. 鄭磊,霍金龍,馬芳菲,曾養(yǎng)志. 上海畜牧獸醫(yī)通訊. 2009(01)
[2]單核苷酸多態(tài)性檢測方法的研究進展[J]. 汪維鵬,倪坤儀,周國華. 遺傳. 2006(01)
[3]單核苷酸多態(tài)性檢測方法的評價[J]. 周晨慧,彭惠民. 現代醫(yī)藥衛(wèi)生. 2005(02)
[4]基于生物信息學的SNP候選位點搜尋方法[J]. 陳煒,張戈,張思仲. 遺傳. 2001(02)
本文編號:3050263
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/dongwuyixue/3050263.html
最近更新
教材專著