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豬Sirt2、PPARδ、Suv39h1/2基因的SNPs檢測及性狀關(guān)聯(lián)分析

發(fā)布時間:2021-02-10 12:35
  分子標(biāo)記輔助選擇(marker assisted selection, MAS)糅合傳統(tǒng)育種方法,在動物遺傳育種過程中得到了廣泛應(yīng)用。這種方法使得豬遺傳改良的進(jìn)程加快,在豬育種工作中占據(jù)愈加重要的作用。尋找并選擇與豬的生產(chǎn)或繁殖性狀相關(guān)的主效基因,是分子標(biāo)記輔助選擇的基礎(chǔ)。本研究選取了NAD+依賴性去乙酰酶沉默信息調(diào)節(jié)因子-2(NAD+-dependent deacetylase sirtuin-2, Sirt2)、過氧化物酶體增殖物激活受體δ(Peroxisome proliferator activated receptors δ, PPARδ)、花斑抑制因子同源物1/2(suppressor of variegation3-9homolog1/2, Suv39h1/2)個候選基因進(jìn)行了研究。實驗中,以豬毛囊為試驗材料提取了537份長白豬、50份約克夏基因組DNA,另有實驗室保存的36份杜洛克豬、24份嵊縣花豬和50份嘉興黑豬的基因組DNA,設(shè)計引物,通過PCR擴(kuò)增得到各個基因位于外顯子的部分序列,測序比對篩選各基因SNPs并對其等位基因頻率和基因型頻率以及Hardy-Weinbe... 

【文章來源】:浙江農(nóng)林大學(xué)浙江省

【文章頁數(shù)】:57 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

豬Sirt2、PPARδ、Suv39h1/2基因的SNPs檢測及性狀關(guān)聯(lián)分析


豬毛囊提取的基因組DNA電泳結(jié)果(0.8%瓊脂糖凝膠)

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圖 2-1 豬毛囊提取的基因組 DNA 電泳結(jié)果(0.8%瓊脂糖凝膠)Fig. 2-1 Genomic DNA isolated from pig hair follicles (0.8% agarose gel)1-5:5 個豬基因組 DNA 樣品1-5: 5 genomic samples of pig因組 DNA 的濃度和純度的測定分分光光度計測得所提取的基因組 DNA 的濃度適中,OD260 n-1.8 之間,表明所提取的基因組 DNA 的濃度較好,可用于后續(xù)增實驗。1 2 3 4 5基因

PCR檢測,嘉興黑豬,目的,約克夏豬


組 DNA 的 PCR 擴(kuò)增效果的檢測組 DNA 進(jìn)行 PCR 擴(kuò)增效果進(jìn)行檢測,其瓊脂糖凝膠電泳結(jié)目的片段清晰且單一,可知所提取的基因組 DNA PCR 擴(kuò)增驗候選基因目的片段的擴(kuò)增。 基因的 PCR 擴(kuò)增與序列分析 340 份長白豬、50 份約克夏豬、50 份嘉興黑豬、36 份杜洛因組 DNA 樣品為模板,以引物 SIR-F 和 SIR-R 對 Sirt2 基經(jīng) 1%瓊脂糖凝膠電泳檢測,可見單一清晰條帶,目的片段 bp,其 PCR 擴(kuò)增結(jié)果如圖 2-3,經(jīng) PCR 產(chǎn)物凝膠回收試劑盒

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]利用改進(jìn)的酚-氯仿法從豬毛囊中提取基因組DNA[J]. 王繼英,俞英,馮利霞,王懷中,張勤.  遺傳. 2010(07)
[2]RNA干擾SMYD3基因表達(dá)對誘導(dǎo)肝癌細(xì)胞凋亡的影響[J]. 徐鋆耀,陳立波,徐鋆陽,楊鎮(zhèn),魏海燕,許榮華.  癌癥. 2006(05)



本文編號:3027367

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