本研究旨在探討黔北麻羊解耦聯(lián)蛋白2（uncoupling protein 2,UCP2）基因的遺傳多態(tài)性及其與生長性狀的關(guān)聯(lián)性,以期為黔北麻羊的育種改良提供理論依據(jù)。以200頭6月齡黔北麻羊為研究對象,采用直接測序法檢測黔北麻羊UCP2基因的SNP位點,并將其與黔北麻羊生長性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析;實時熒光定量PCR檢測UCP2基因在黔北麻羊不同組織中的表達(dá)水平。結(jié)果顯示,UCP2基因存在4個SNPs位點,分別為:g.29614172 A>G、g.29619320 G>T、g.29619721 C>T和g.29620037 A>G,均產(chǎn)生3種基因型,其中g(shù).29619320 G>T和g.29620037 A>G為錯義突變,g.29619320 G>T突變導(dǎo)致甘氨酸（Gly）變?yōu)榘腚装彼幔–ys）,g.29620037 A>G突變導(dǎo)致蘇氨酸（Thr）突變?yōu)楸彼幔ˋla）。多態(tài)信息含量顯示,4個SNPs位點均表現(xiàn)為中度多態(tài)（0.25<PIC<0.5）。χ²檢驗結(jié)果表明,g.29614172 A>G、g.296... 

【文章來源】：中國畜牧獸醫(yī). 2020,47(07)北大核心

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【部分圖文】：

UCP2基因PCR擴增結(jié)果

進(jìn)行單個樣本直接測序,測序結(jié)果經(jīng)DNAStar軟件比對分析發(fā)現(xiàn),在黔北麻羊UCP2基因上存在4個SNPs位點,分別為:g.29614172 A>G、g.29619320 G>T、g.29619721 C>T和g.29620037 A>G,其中g(shù).29614172 A>G位于5′UTR區(qū)域,產(chǎn)生3種基因型:AA、AG和GG;g.29619320 G>T位于外顯子5,產(chǎn)生3種基因型:GG、GT和TT;g.29619721 C>T位于內(nèi)含子6,產(chǎn)生3種基因型:CC、CT和TT;g.29620037 A>G位于外顯子7,產(chǎn)生3種基因型:AA、AG和GG(圖2)。g.29619320 G>T和g.29620037 A>G均為錯義突變位點,g.29619320 G>T位點編碼甘氨酸(Gly)突變?yōu)榘腚装彼?Cys),g.29620037 A>G位點蘇氨酸(Thr)突變?yōu)楸彼?Ala)。2個突變會導(dǎo)致該氨基酸位點與其他氨基酸分子間作用力及空間距離發(fā)生改變,從而影響蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)。2.3 UCP2基因多態(tài)位點遺傳學(xué)分析

表4 黔北麻羊UCP2基因4個SNPs位點連鎖不平衡分析Table 4 Linkage disequilibrium analysis of UCP2 gene 4 SNPs in Qianbei Ma goats SNPs g.29614172 A>G g.29619320 G>T g.29619721 C>T g.29620037 A>G g.29614172 A>G - 1.000 1.000 0.479 g.29619320 G>T 0.168 - 1.000 0.514 g.29619721 C>T 0.211 0.796 - 0.544 g.29620037 A>G 0.066 0.155 0.218 - 對角線上方為D’值，D’=1為完全連鎖，D’=0為無連鎖或連鎖平衡；對角線下方為r2值，r2=1為完美連鎖，r2>0.33為強連鎖，r2=0為無連鎖或連鎖平衡D’value is above the diagonal,D’=1means full linkage,D’=0means no linkage or linkage equilibrium;r2 value is below the diagonal,r2=1means perfect linkage,r2>0.33means strong linkage,r2=0means no linkage or linkage equilibrium2.5 UCP2基因多態(tài)性與黔北麻羊生長性狀的關(guān)聯(lián)分析


本文編號：3010083