為系統(tǒng)探討不同品種肉牛瘤胃內(nèi)的微生物多樣性及其功能,試驗利用16S rRNA基因高通量測序技術檢測分析草原紅牛、中國西門塔爾牛、安格斯牛瘤胃液樣本菌群結構并進行PICRUSt功能預測。結果顯示:草原紅�；陂T的組成,厚壁菌門（Firmicutes）和擬桿菌門（Bacteroidetes）為優(yōu)勢菌群,所占比例分別為54.15%和37.34%;基于屬的組成,依次為普雷沃菌屬₁（Prevotella₁）:9.01%、理研菌科_RC9菌群（Rikenellaceae_RC9_gut_group）:8.19%、瘤 胃 菌 科 UCG-005（Ruminococcaceae_UCG-005）:7.37%、未知屬 f 型擬桿菌目 BS11 菌群（norank_fBacteroidales_BS11_gut_group）:5.19%等;16S rRNA 基因組... 

【文章來源】：內(nèi)蒙古民族大學內(nèi)蒙古自治區(qū)

【文章頁數(shù)】：46 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１基于門水平的萆原紅牛瘤胃微生物群落結構??

８?不同品種肉牛瘤胃菌群結構及其功能預測研究???德於??３：?－???Ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ?ｏｆ?Ｏｔｈｅｒ?Ｓｅｃｏｎｄａｒｙ?Ｍｅｔａｂｏｌｉｔｅｓ??％〇％％．?，一?其他次生代ｗ產(chǎn)物的生物含成〇．９？??＼?１！?／?ｆ??Ｖ輕?Ｐ?／，．??獅／｜?ｚ…??＾?＿?ｔ＿ｔ?＿??Ｅｎｅｒｇｙ?Ｍｅｔａｂｏｌｉｓａ?％?＾ｒ．?＾?＾??仙代謝５？微?＾??｜?＼公??＇、－、、？—￣￣■?Ｏｒｇａｎｉｓａａｌ?Ｓｒｉｔｅｕ?有機體系終ａ?７９％??—Ｈｕａａｎ?Ｄｉｓｅａｓｅｓ?人類疾病?０．７５％??圖４草原紅牛ＫＥＧＧ?—級和二級代謝通路??３．２基于１６Ｓ?ｒＲＮＡ高通量測序技術分析西門塔爾牛瘤胃微生物多樣性和功能預測??３．?２．?１西門塔爾牛樣本序列信息??由表３得知，兩個西門塔爾牛樣本中，ＸＮ１有效序列數(shù)量為３３７５８條，優(yōu)質(zhì)序列??數(shù)量為３０９００條，優(yōu)化比例為９１．?５３％，序列長度為４３４ｂｐ，操作分類單元數(shù)目為８７４，??序列豐度大于１％的操作分類單元數(shù)目為１９；?ＸＮ２有效序列數(shù)量為３８８９８條，優(yōu)質(zhì)序列??數(shù)量為３５８１２條，優(yōu)化比例為９２．?０７％，序列長度為４３３ｂｐ，操作分類單元數(shù)目為９２３，??序列豐度大于１％的操作分類單元數(shù)目為２２。由圖５可知：Ｓｈａｎｎｏｎ指數(shù)和Ｓｏｂｓ指數(shù)??可看出，兩個西門塔爾牛的瘤胃菌群多樣性指數(shù)均超過５，實際０ＴＵ數(shù)目均大于７５０，??且稀釋曲線趨于平緩，測序數(shù)據(jù)達到飽和，能夠覆蓋西門塔爾牛的瘤胃菌群的絕大部??分物種。??

ｒｖＭ?…ＸＮ１??ＳｈａｎｎｏｎＢＵ????一?ＸＮ２??．．．ｗ，??????，■產(chǎn)?－如??ｆ?７５０?？??丨Ｉ?丨卜??ｊ?Ｉ?Ｉｆ?／??］ｆ；?ｈ??０??，?１?，??〇??１?！??１???１０．０００?２０．０００?］〇〇〇〇?１０?０００?２０?０００?３０．０００??一二一?一；，一??圖５西門塔爾牛瘤胃樣本稀釋曲線及Ｓｈａｎｎｏｎ曲線分析??３．２．２基子門水平的微生物群落結構分析??從圖６可以得知，基于門水平的西門塔爾牛瘤胃微生物群落主要由厚壁菌門??（Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ）、擬桿菌門（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ）、藍藻門（Ｃｙａｎｏｂａｃｔｅｒｉａ）等組成。除??此之外西門塔爾牛瘤胃內(nèi)還含有變形菌門（Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ?）、迷蹤菌門??（Ｅｌｕｓｉｍｉｃｒｏｂｉａ）、撫微菌門（Ｖｅｒｒｕｃｏｍｉｃｒｏｂｉａ）、其他（Ｏｔｈｅｒｓ）和螺旋體菌門??（Ｓａｃｃｈａｒｉｂａｃｔｅｒｉａ）。其中厚壁菌門（Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ）所占比例最大為６２．４６％，撫微??菌門（Ｖｅｒｒｕｃｏｍｉｃｒｏｂｉａ）所占比例最小為１．４９％。??ｌｌａｉｆｆＢｉ＇］?ＵｃｃｒＭｒｉｂａｃｔ＞ｒｉａ：２．９２Ｓ?〇ｔｈ＊ｒ？?２．９２Ｓ??■門?Ｐｒｏｔ＊ｏｂ？ｃ？ｒｔｉ２．４２＾）?ａｆＳＨ?Ｃｙ＊ｎ〇ｂ＊ｃｔ？ｒＵ．３．９０％??ｔｆＯＴＢＨ?Ｅｌｕ＊ｔｍｌｃＴ〇Ｗ＊：１３１％??ｍｍｍｎ??Ｖ＾ｒｒｕｃｏｍｉｃｒｏｂｔａ－Ｌ＾＾ｏ??ＶＳＢ?１?Ｆｌｎｎｌｃｕ？Ｍ：６２．４？Ｓ??圖６基子門水平的西門塔爾牛瘤胃微生物群落結構??


本文編號：3002747