旋毛蟲(chóng)不同發(fā)育時(shí)期差異蛋白組學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-01-26 04:13
旋毛蟲(chóng)(Trichinella spiralis)是一種細(xì)胞內(nèi)寄生性線蟲(chóng),其生活史主要包括成蟲(chóng)(Ad)、新生幼蟲(chóng)(NBL)和感染性肌幼蟲(chóng)(ML)3個(gè)時(shí)期。旋毛蟲(chóng)成蟲(chóng)寄生在宿主小腸上皮細(xì)胞,肌幼蟲(chóng)寄生在橫紋肌細(xì)胞。為了與其寄生生活相適應(yīng),旋毛蟲(chóng)在不同發(fā)育時(shí)期表達(dá)的蛋白質(zhì)是不同的,研究其期特異性蛋白對(duì)于闡明旋毛蟲(chóng)發(fā)育調(diào)控、與宿主的相互作用等一系列生物學(xué)問(wèn)題具有重要意義。本研究利用iTRAQ技術(shù)對(duì)旋毛蟲(chóng)三個(gè)發(fā)育時(shí)期(Ad3期、NBL期和ML期)的蟲(chóng)體蛋白質(zhì)進(jìn)行了檢測(cè),共鑒定出4691個(gè)蛋白質(zhì)。分析了旋毛蟲(chóng)三個(gè)不同發(fā)育時(shí)期差異表達(dá)的蛋白,通過(guò)比對(duì)發(fā)現(xiàn)旋毛蟲(chóng)不同發(fā)育時(shí)期存在大量差異表達(dá)蛋白,鑒定出大量在蟲(chóng)體發(fā)育和蟲(chóng)體入侵過(guò)程起重要的蛋白質(zhì)。通過(guò)GO分析發(fā)現(xiàn)鑒定出的蛋白質(zhì)主要參與“細(xì)胞過(guò)程和代謝過(guò)程”、“細(xì)胞和細(xì)胞成分”以及“結(jié)合和催化活性”。對(duì)差異表達(dá)蛋白進(jìn)行Pathway富集分析,結(jié)果表明差異蛋白主要參與代謝通路、細(xì)胞進(jìn)程以及生物機(jī)體系統(tǒng)通路。通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量(qRT-PCR)對(duì)部分旋毛蟲(chóng)部分基因在其三個(gè)不同發(fā)育階段的mRNA轉(zhuǎn)錄水平進(jìn)行了驗(yàn)證,實(shí)驗(yàn)結(jié)果與差異蛋白組學(xué)分析結(jié)果一致,表明運(yùn)用iT...
【文章來(lái)源】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁(yè)數(shù)】:71 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
旋毛蟲(chóng)不同發(fā)育時(shí)期表達(dá)蛋白質(zhì)統(tǒng)計(jì)
B_VS_D圖2-2 差異表達(dá)蛋白及期特異性表達(dá)蛋白的分布Fig.2-2 Distribution of genes commonly and stagc-specitically expressed in the three developmental stagesA:肌幼蟲(chóng)時(shí)期;B:三日齡成蟲(chóng)期;1):新生幼蟲(chóng)期A: ML; B: Ad3; 1): NUL2.2.2與蟲(chóng)體發(fā)育和蟲(chóng)體入傻相關(guān)的蛋白質(zhì)的差異表達(dá)研究表明,旋毛蟲(chóng)最主要的兩種排池分泌蛋由為:DNascll家族和絲氨酸蛋白酶家族,其在旋毛蟲(chóng)與宿i相互作用中起著十分重要的作用。在旋毛蟲(chóng)三個(gè)不同發(fā)育時(shí)期,DNascil家族蛋白質(zhì)和絲氣酸蛋白酶家族成員在表達(dá)上存在顯著差異。經(jīng)過(guò)分析表明,一共有77個(gè)DNase 11家族蛋A質(zhì)在三個(gè)時(shí)期存在差異表達(dá),有大約3/4的DNase 11家族蛋由質(zhì)在肌幼蟲(chóng)時(shí)期表達(dá)上調(diào),只有極少數(shù)該家族蛋白質(zhì)在3日齡成蟲(chóng)和新生幼蟲(chóng)時(shí)期表達(dá)上調(diào)。其中差異表達(dá)僅發(fā)生在肌幼蟲(chóng)和3丨:1齡成蟲(chóng)時(shí)期的該家族蛋白有兩種,E5SGG7和E5SEY4
細(xì)胞位S (Cellular Component)> 基因的分子功能(Molecular Fimction)。對(duì)鑒定到的4691個(gè)蛋白質(zhì)進(jìn)行GO分類注釋(圖2-3),在這三個(gè)本體分析中,分別以“細(xì)胞過(guò)程和代謝過(guò)程”、“細(xì)胞和細(xì)胞成分”以及“結(jié)合和催化活性”最為顯著。100- -欄…————h ri— I^ biologiciil_procM* cellulai_coinponeiit “ molervlai^laxuaa圖2-3旋毛蟲(chóng)蛋白質(zhì)GO功能注釋Fig. 2-3 GO categories of the identilled proteins oi"I . spiralis2.2.5差異蛋白Pathway分析對(duì)差異表達(dá)蛋tliit行Pathway分析,結(jié)果表明,在肌幼蟲(chóng)和3 H齡成蟲(chóng)時(shí)期共有283個(gè)差異蛋白品著富集,在肌幼蟲(chóng)和新生幼蟲(chóng)時(shí)期共有340個(gè)差異蛋白顯著富集,在3日齡成蟲(chóng)和新生幼蟲(chóng)時(shí)期共有258個(gè)差異蛋白顯著富集。差異蛋白主要參與代謝通路、細(xì)胞進(jìn)程以及生物機(jī)體系統(tǒng)通路,如:溶酶體、嘌呤代謝、補(bǔ)體及凝血級(jí)聯(lián)反應(yīng)、谷朧甘肽代謝通路、P53信號(hào)通路、丙酸脂代謝、胰島素信號(hào)通路、卵母細(xì)胞減數(shù)分裂、趨化因子信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路、肌動(dòng)蛋白細(xì)胞骨架調(diào)節(jié)、血管平沿肌、突觸囊泡循環(huán)、半乳糖代謝、丐信號(hào)傳導(dǎo)通路。其屮與媽信號(hào)傳導(dǎo)通路和血管平滑肌相關(guān)的蛋白質(zhì)在新生幼蟲(chóng)時(shí)期出現(xiàn)明顯富集。而卵母細(xì)胞減數(shù)分裂相關(guān)蛋由在3日齡成蟲(chóng)時(shí)期11
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]大片吸蟲(chóng)硫氧還蛋白過(guò)氧化物酶基因的原核表達(dá)及免疫原性分析[J]. 鮑玉芳,李伍杰,王華俊,石云良,王俊寧,黃維義. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2012(06)
[2]檉柳硫氧還蛋白過(guò)氧化物酶(ThPrx1)基因轉(zhuǎn)入酵母的抗逆能力分析[J]. 賀琳,蔣麗麗,王玉成. 東北林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2011(04)
[3]細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)硫氧還蛋白過(guò)氧化物酶基因的表達(dá)及抗原性分析[J]. 李航,李文卉,李永光,茍惠天,王艷華,張德林,賈萬(wàn)忠,史大中,付寶權(quán). 中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2008(08)
[4]二維液相色譜切換技術(shù)及其應(yīng)用[J]. 王智聰,張慶合,趙中一,張維冰,李彤. 分析化學(xué). 2005(05)
博士論文
[1]腸-淋巴液途徑在大鼠膿毒癥發(fā)病機(jī)制中的作用及淋巴液差異蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D]. 張萍.第二軍醫(yī)大學(xué) 2013
碩士論文
[1]鹽對(duì)慢性腎衰大鼠腎臟磷酸化蛋白質(zhì)組及孤束核RAS的影響[D]. 何漢昌.南方醫(yī)科大學(xué) 2013
[2]基于iTRAQ技術(shù)的大鼠肝再生差異表達(dá)蛋白鑒定與作用研究[D]. 耿小芳.河南師范大學(xué) 2013
[3]旋毛蟲(chóng)半胱氨酸蛋白酶抑制因子TsCystatin1的克隆、表達(dá)及鑒定[D]. 姚菊霞.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2011
本文編號(hào):3000453
【文章來(lái)源】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市
【文章頁(yè)數(shù)】:71 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
旋毛蟲(chóng)不同發(fā)育時(shí)期表達(dá)蛋白質(zhì)統(tǒng)計(jì)
B_VS_D圖2-2 差異表達(dá)蛋白及期特異性表達(dá)蛋白的分布Fig.2-2 Distribution of genes commonly and stagc-specitically expressed in the three developmental stagesA:肌幼蟲(chóng)時(shí)期;B:三日齡成蟲(chóng)期;1):新生幼蟲(chóng)期A: ML; B: Ad3; 1): NUL2.2.2與蟲(chóng)體發(fā)育和蟲(chóng)體入傻相關(guān)的蛋白質(zhì)的差異表達(dá)研究表明,旋毛蟲(chóng)最主要的兩種排池分泌蛋由為:DNascll家族和絲氨酸蛋白酶家族,其在旋毛蟲(chóng)與宿i相互作用中起著十分重要的作用。在旋毛蟲(chóng)三個(gè)不同發(fā)育時(shí)期,DNascil家族蛋白質(zhì)和絲氣酸蛋白酶家族成員在表達(dá)上存在顯著差異。經(jīng)過(guò)分析表明,一共有77個(gè)DNase 11家族蛋A質(zhì)在三個(gè)時(shí)期存在差異表達(dá),有大約3/4的DNase 11家族蛋由質(zhì)在肌幼蟲(chóng)時(shí)期表達(dá)上調(diào),只有極少數(shù)該家族蛋白質(zhì)在3日齡成蟲(chóng)和新生幼蟲(chóng)時(shí)期表達(dá)上調(diào)。其中差異表達(dá)僅發(fā)生在肌幼蟲(chóng)和3丨:1齡成蟲(chóng)時(shí)期的該家族蛋白有兩種,E5SGG7和E5SEY4
細(xì)胞位S (Cellular Component)> 基因的分子功能(Molecular Fimction)。對(duì)鑒定到的4691個(gè)蛋白質(zhì)進(jìn)行GO分類注釋(圖2-3),在這三個(gè)本體分析中,分別以“細(xì)胞過(guò)程和代謝過(guò)程”、“細(xì)胞和細(xì)胞成分”以及“結(jié)合和催化活性”最為顯著。100- -欄…————h ri— I^ biologiciil_procM* cellulai_coinponeiit “ molervlai^laxuaa圖2-3旋毛蟲(chóng)蛋白質(zhì)GO功能注釋Fig. 2-3 GO categories of the identilled proteins oi"I . spiralis2.2.5差異蛋白Pathway分析對(duì)差異表達(dá)蛋tliit行Pathway分析,結(jié)果表明,在肌幼蟲(chóng)和3 H齡成蟲(chóng)時(shí)期共有283個(gè)差異蛋白品著富集,在肌幼蟲(chóng)和新生幼蟲(chóng)時(shí)期共有340個(gè)差異蛋白顯著富集,在3日齡成蟲(chóng)和新生幼蟲(chóng)時(shí)期共有258個(gè)差異蛋白顯著富集。差異蛋白主要參與代謝通路、細(xì)胞進(jìn)程以及生物機(jī)體系統(tǒng)通路,如:溶酶體、嘌呤代謝、補(bǔ)體及凝血級(jí)聯(lián)反應(yīng)、谷朧甘肽代謝通路、P53信號(hào)通路、丙酸脂代謝、胰島素信號(hào)通路、卵母細(xì)胞減數(shù)分裂、趨化因子信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路、肌動(dòng)蛋白細(xì)胞骨架調(diào)節(jié)、血管平沿肌、突觸囊泡循環(huán)、半乳糖代謝、丐信號(hào)傳導(dǎo)通路。其屮與媽信號(hào)傳導(dǎo)通路和血管平滑肌相關(guān)的蛋白質(zhì)在新生幼蟲(chóng)時(shí)期出現(xiàn)明顯富集。而卵母細(xì)胞減數(shù)分裂相關(guān)蛋由在3日齡成蟲(chóng)時(shí)期11
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]大片吸蟲(chóng)硫氧還蛋白過(guò)氧化物酶基因的原核表達(dá)及免疫原性分析[J]. 鮑玉芳,李伍杰,王華俊,石云良,王俊寧,黃維義. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2012(06)
[2]檉柳硫氧還蛋白過(guò)氧化物酶(ThPrx1)基因轉(zhuǎn)入酵母的抗逆能力分析[J]. 賀琳,蔣麗麗,王玉成. 東北林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2011(04)
[3]細(xì)粒棘球絳蟲(chóng)硫氧還蛋白過(guò)氧化物酶基因的表達(dá)及抗原性分析[J]. 李航,李文卉,李永光,茍惠天,王艷華,張德林,賈萬(wàn)忠,史大中,付寶權(quán). 中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2008(08)
[4]二維液相色譜切換技術(shù)及其應(yīng)用[J]. 王智聰,張慶合,趙中一,張維冰,李彤. 分析化學(xué). 2005(05)
博士論文
[1]腸-淋巴液途徑在大鼠膿毒癥發(fā)病機(jī)制中的作用及淋巴液差異蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D]. 張萍.第二軍醫(yī)大學(xué) 2013
碩士論文
[1]鹽對(duì)慢性腎衰大鼠腎臟磷酸化蛋白質(zhì)組及孤束核RAS的影響[D]. 何漢昌.南方醫(yī)科大學(xué) 2013
[2]基于iTRAQ技術(shù)的大鼠肝再生差異表達(dá)蛋白鑒定與作用研究[D]. 耿小芳.河南師范大學(xué) 2013
[3]旋毛蟲(chóng)半胱氨酸蛋白酶抑制因子TsCystatin1的克隆、表達(dá)及鑒定[D]. 姚菊霞.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2011
本文編號(hào):3000453
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/dongwuyixue/3000453.html
最近更新
教材專著