豬P311基因PCR-SSCPs及其與肉質(zhì)性狀關(guān)系的研究
發(fā)布時(shí)間:2021-01-25 16:36
神經(jīng)蛋白3.1(neuronal protein3.1, P311)又稱PTZ17,由定位于豬2號(hào)染色體的P311基因負(fù)責(zé)編碼,由Studler等于1993年首次發(fā)現(xiàn)于小鼠胚胎的腦組織中。研究表明P311蛋白廣泛存在于多種組織細(xì)胞中,且是一種細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì),主要存在于胞漿中,在細(xì)胞核內(nèi)亦有少量定位。P311基因mRNA序列中包含三個(gè)開放閱讀框(open reading frame,ORF),但僅第一個(gè)開放閱讀框負(fù)責(zé)編碼蛋白質(zhì)。本實(shí)驗(yàn)室前期通過抑制性消減雜交發(fā)現(xiàn)該基因在萊蕪豬及大白豬中的表達(dá)量差異顯著。本試驗(yàn)主要通過PCR-SSCP方法鑒定了54頭萊蕪豬和40頭魯萊黑豬該基因第一內(nèi)含子及3’側(cè)翼區(qū)共5處多態(tài)位點(diǎn),并對(duì)各基因型個(gè)體的表達(dá)水平及另外4個(gè)相關(guān)基因SPARC、MYL1、ACADM、ACSL的表達(dá)水平進(jìn)行檢測。主要結(jié)果如下:1對(duì)94頭試驗(yàn)豬的肉質(zhì)測定數(shù)據(jù)進(jìn)行描述性統(tǒng)計(jì)分析及品種內(nèi)和總?cè)后w的肉質(zhì)數(shù)據(jù)間的相關(guān)性分析。萊蕪豬平均肌內(nèi)脂肪含量為8.96%,pH1為6.54,pHμ為5.82,肉色評(píng)分為3.37,大理石紋評(píng)分為4.02,滴水損失為1.13%,失水率為19.91%,烹飪損失為17...
【文章來源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
滴水損失測定肉樣懸掛示意圖
3.2 P311 基因多態(tài)性的 PCR-SSCP 檢測3.2.1 試驗(yàn)豬耳組織基因組的提取所提取基因組的瓊脂糖凝膠電泳圖譜如圖2所示。由電泳圖可以看出,利用試劑盒所提取的基因組DNA,條帶輪廓清晰,無拖尾,說明所提取的DNA沒有講解,點(diǎn)樣孔處也無亮帶,說明所提取的DNA無蛋白質(zhì)等雜質(zhì)的污染。所提取的基因組DNA完全符合PCR擴(kuò)增的要求,可用于下一步的操作。本試驗(yàn)所用DNA Marker為DL 2000 DNAMarker,共有六條不同大小的分子條帶,從大到小依次為2000 bp、1000 bp、750 bp、500 bp、250 bp、100 bp,其中750 bp大小條帶最亮。圖2 實(shí)驗(yàn)豬基因組瓊脂糖凝膠電泳圖譜Figure2 the electrophoretogram of the porcine genomic DNA注:6:DL 2000 DNAMarker
5對(duì)引物的擴(kuò)增效果均較理想,條帶大小與預(yù)期相同且無雜帶,引物擴(kuò)增的特異性較好,亮度均一,可以進(jìn)行下一步的聚丙烯酰胺凝膠電泳SSCP檢測。圖3 引物SNP1F和SNP1R擴(kuò)增產(chǎn)物的凝膠電泳圖譜Figure3 the electrophoretogram of the PCR products amplified by the primers SNP1F and SNP1R注:1~6:PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物,7:DL 2000 DNAMarker。Notes: 1~6: PCR products, 7: DL 2000 DNA Marker.
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]豬肌內(nèi)脂肪沉積的影響因素及其研究進(jìn)展[J]. 王小舟. 中國豬業(yè). 2013(05)
[2]調(diào)控真核基因表達(dá)的非編碼序列[J]. 聶玉敏,劉宏德,孫嘯. 生物物理學(xué)報(bào). 2013(04)
[3]貴州小香羊GH基因5’端側(cè)翼區(qū)多態(tài)性與生長性能的關(guān)系[J]. 石照應(yīng),曲月秀,陳蓉,朱紅剛,田興貴. 貴州農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(12)
[4]中國荷斯坦牛乳鐵蛋白基因5′側(cè)翼區(qū)的遺傳多態(tài)性與體細(xì)胞評(píng)分的關(guān)聯(lián)分析[J]. 王小龍,楊章平,陳仁金,毛永江,冀德君. 中國畜牧雜志. 2012(15)
[5]P311蛋白與金屬硫蛋白ⅡA相互作用位點(diǎn)的計(jì)算機(jī)預(yù)測[J]. 薛曉怡,馮鐵男,王群群,王翼飛. 上海大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2011(06)
[6]豬TLR4基因可變剪接體的鑒定[J]. 楊秀芹,翟春媛,李海濤,劉娣. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2011(08)
[7]PGC-1β和SREBP-1c在豬脂肪細(xì)胞分化過程中的相互作用[J]. 高曉娟,吉紅,常志光,劉月光,楊秋梅,楊公社. 中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào). 2011(06)
[8]GHRL基因5’側(cè)翼區(qū)多態(tài)性對(duì)雞生長和屠體性狀的影響[J]. 方梅霞,徐海平,謝亮,梁偉濤,賴澤穎,張德祥,聶慶華,張細(xì)權(quán). 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(12)
[9]不同微生物發(fā)酵飼料對(duì)魯萊黑豬肉質(zhì)及生產(chǎn)性能的影響[J]. 徐云華,魏海峰,田恩杰,孫延曉,劉珊珊,沈彥鋒,盛清凱. 豬業(yè)科學(xué). 2011(05)
[10]皮下脂肪和肌內(nèi)脂肪對(duì)豬肉風(fēng)味的作用[J]. 黃業(yè)傳,賀稚非,李洪軍,秦剛,王庭,馬明輝. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(10)
博士論文
[1]豬肌內(nèi)脂肪沉積相關(guān)基因的篩選鑒定及其特征分析[D]. 陳其美.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[2]豬IGF-Ⅱ基因變異對(duì)豬生長性狀及肌肉發(fā)育相關(guān)基因表達(dá)的影響[D]. 虞德兵.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[3]豬肌內(nèi)脂肪代謝信息傳導(dǎo)途徑相關(guān)因子研究[D]. 廉紅霞.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[4]雞PRL、PRLR和POU1F1基因變異對(duì)繁殖及POU1F1對(duì)生長性狀的遺傳效應(yīng)[D]. 姜潤深.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
[5]豬背最長肌差異表達(dá)基因的克隆鑒定及其特征分析[D]. 徐德全.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
碩士論文
[1]豬肌肉糖酵解潛力及幾個(gè)重要代謝調(diào)控基因的表達(dá)與肉質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)性分析[D]. 朱康平.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[2]線粒體DNA基因變異與延邊地區(qū)2型糖尿病的相關(guān)性研究[D]. 楊秀麗.延邊大學(xué) 2012
[3]豬DGAT基因的克隆、SNP檢測及與生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 楊春華.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[4]奶牛HSP70基因5’-側(cè)翼區(qū)PCR-SSCP分析及其與生產(chǎn)性能的關(guān)系[D]. 陳強(qiáng).南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[5]ABCA1基因全編碼區(qū)SNP篩選及外顯子7、16 SNP意義的研究[D]. 查政.第一軍醫(yī)大學(xué) 2006
本文編號(hào):2999544
【文章來源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
滴水損失測定肉樣懸掛示意圖
3.2 P311 基因多態(tài)性的 PCR-SSCP 檢測3.2.1 試驗(yàn)豬耳組織基因組的提取所提取基因組的瓊脂糖凝膠電泳圖譜如圖2所示。由電泳圖可以看出,利用試劑盒所提取的基因組DNA,條帶輪廓清晰,無拖尾,說明所提取的DNA沒有講解,點(diǎn)樣孔處也無亮帶,說明所提取的DNA無蛋白質(zhì)等雜質(zhì)的污染。所提取的基因組DNA完全符合PCR擴(kuò)增的要求,可用于下一步的操作。本試驗(yàn)所用DNA Marker為DL 2000 DNAMarker,共有六條不同大小的分子條帶,從大到小依次為2000 bp、1000 bp、750 bp、500 bp、250 bp、100 bp,其中750 bp大小條帶最亮。圖2 實(shí)驗(yàn)豬基因組瓊脂糖凝膠電泳圖譜Figure2 the electrophoretogram of the porcine genomic DNA注:6:DL 2000 DNAMarker
5對(duì)引物的擴(kuò)增效果均較理想,條帶大小與預(yù)期相同且無雜帶,引物擴(kuò)增的特異性較好,亮度均一,可以進(jìn)行下一步的聚丙烯酰胺凝膠電泳SSCP檢測。圖3 引物SNP1F和SNP1R擴(kuò)增產(chǎn)物的凝膠電泳圖譜Figure3 the electrophoretogram of the PCR products amplified by the primers SNP1F and SNP1R注:1~6:PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物,7:DL 2000 DNAMarker。Notes: 1~6: PCR products, 7: DL 2000 DNA Marker.
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[4]中國荷斯坦牛乳鐵蛋白基因5′側(cè)翼區(qū)的遺傳多態(tài)性與體細(xì)胞評(píng)分的關(guān)聯(lián)分析[J]. 王小龍,楊章平,陳仁金,毛永江,冀德君. 中國畜牧雜志. 2012(15)
[5]P311蛋白與金屬硫蛋白ⅡA相互作用位點(diǎn)的計(jì)算機(jī)預(yù)測[J]. 薛曉怡,馮鐵男,王群群,王翼飛. 上海大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2011(06)
[6]豬TLR4基因可變剪接體的鑒定[J]. 楊秀芹,翟春媛,李海濤,劉娣. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2011(08)
[7]PGC-1β和SREBP-1c在豬脂肪細(xì)胞分化過程中的相互作用[J]. 高曉娟,吉紅,常志光,劉月光,楊秋梅,楊公社. 中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào). 2011(06)
[8]GHRL基因5’側(cè)翼區(qū)多態(tài)性對(duì)雞生長和屠體性狀的影響[J]. 方梅霞,徐海平,謝亮,梁偉濤,賴澤穎,張德祥,聶慶華,張細(xì)權(quán). 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(12)
[9]不同微生物發(fā)酵飼料對(duì)魯萊黑豬肉質(zhì)及生產(chǎn)性能的影響[J]. 徐云華,魏海峰,田恩杰,孫延曉,劉珊珊,沈彥鋒,盛清凱. 豬業(yè)科學(xué). 2011(05)
[10]皮下脂肪和肌內(nèi)脂肪對(duì)豬肉風(fēng)味的作用[J]. 黃業(yè)傳,賀稚非,李洪軍,秦剛,王庭,馬明輝. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(10)
博士論文
[1]豬肌內(nèi)脂肪沉積相關(guān)基因的篩選鑒定及其特征分析[D]. 陳其美.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[2]豬IGF-Ⅱ基因變異對(duì)豬生長性狀及肌肉發(fā)育相關(guān)基因表達(dá)的影響[D]. 虞德兵.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[3]豬肌內(nèi)脂肪代謝信息傳導(dǎo)途徑相關(guān)因子研究[D]. 廉紅霞.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[4]雞PRL、PRLR和POU1F1基因變異對(duì)繁殖及POU1F1對(duì)生長性狀的遺傳效應(yīng)[D]. 姜潤深.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
[5]豬背最長肌差異表達(dá)基因的克隆鑒定及其特征分析[D]. 徐德全.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
碩士論文
[1]豬肌肉糖酵解潛力及幾個(gè)重要代謝調(diào)控基因的表達(dá)與肉質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)性分析[D]. 朱康平.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[2]線粒體DNA基因變異與延邊地區(qū)2型糖尿病的相關(guān)性研究[D]. 楊秀麗.延邊大學(xué) 2012
[3]豬DGAT基因的克隆、SNP檢測及與生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 楊春華.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[4]奶牛HSP70基因5’-側(cè)翼區(qū)PCR-SSCP分析及其與生產(chǎn)性能的關(guān)系[D]. 陳強(qiáng).南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[5]ABCA1基因全編碼區(qū)SNP篩選及外顯子7、16 SNP意義的研究[D]. 查政.第一軍醫(yī)大學(xué) 2006
本文編號(hào):2999544
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