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豬圓環(huán)病毒3型重組質(zhì)粒的構(gòu)建與遺傳進化分析

發(fā)布時間:2021-01-23 14:16
  豬圓環(huán)病毒3型(PCV3)是2015年發(fā)現(xiàn)的一個新型病毒,到目前為止PCV3在全球呈流行趨勢,而患有繁殖障礙的母豬經(jīng)常被該病毒感染,并且在患有某些疾病中可以檢測的到該病毒,出現(xiàn)了共感染的現(xiàn)象。PCV3對全球的養(yǎng)豬產(chǎn)業(yè)造成了一定的經(jīng)濟損失,并且到目前為止PCV3無法在傳代細胞中進行分離培養(yǎng)。為了減少PCV3對我國養(yǎng)豬產(chǎn)業(yè)造成的經(jīng)濟損失,并對其致病機理的研究提供支持,本研究利用河北株(GenBank登錄號:MK105924)PCV3的全基因組序列構(gòu)建感染性克隆,并將其轉(zhuǎn)染到傳代細胞中進行增殖。對河北株和全球的PCV3基因組進行序列分析,以進一步了解該病毒的結(jié)構(gòu)特征、致病機理及其分布與地域之間的關(guān)系,為該病的防控提供理論基礎(chǔ)。在華北地區(qū)采集到的病料中,發(fā)現(xiàn)了一株新的PCV3毒株。為了擴增這株新PCV3毒株的整個基因組序列,利用兩對引物對其進行擴增,將所得到的產(chǎn)物進行基因組的序列測定后,獲得了 PCV3的全基因組序列,并將其命名為河北株P(guān)CV3。對這一全基因組序列構(gòu)建感染性克隆,獲得了重組質(zhì)粒,將構(gòu)建的重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)染到PK-15細胞中,并連續(xù)傳15代。繪制了河北株的基因圖譜,選取9株河北省PCV... 

【文章來源】:河北農(nóng)業(yè)大學(xué)河北省

【文章頁數(shù)】:72 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

豬圓環(huán)病毒3型重組質(zhì)粒的構(gòu)建與遺傳進化分析


圖1病變淋巴結(jié)的PCV3檢測結(jié)果??Fig.?1?Detection?results?of?PCV3?in?diseased?lymph?nodes??

產(chǎn)物,菌落,白色,電泳


?amplified??pair?of?primers;?2:?negative?control??fragment?of?the?first?pair?of?primers;?2:?negative?control??3.1.3感染性克隆陽性菌液的鑒定??為了檢驗白色菌落是否為陽性菌落,運用PCV3鑒定引物通過PCR對培養(yǎng)的兩個陽性菌液進??行檢測,電泳結(jié)果顯示(閣3)在陽性尚液中檢測到了?PCV3,證明PCV3感染性克隆構(gòu)建成功。??M?1?2?3??418bp??I,??圖3陽性菌液的PCR產(chǎn)物??Fig.?3?PCR?product?of?positive?bacteria?liquid???;i::?M:丨)丨.2000?DNA?Marker:?1:陽件菌液I;?2:陽性菌液2:?3:空白對照。??Note:?M?DL2000?DNA?Marker:?1?positive?bacterial?solution?1.2:?positive?bacterial?solution?1;?3:?blank?control.??23??

序列,質(zhì)粒,河北,內(nèi)切酶


?河北農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位(畢業(yè))論文???3.1.4?PCV3質(zhì)粒的酶切鑒定??為了檢驗感染性克隆是否成功,利用Xhol內(nèi)切酶對pcDNA3.]?(?+?)-PCV3進行酶切鑒定,??鑒定結(jié)果如圖4。??M?1?2??12000bp???SOOObp-——pt秦瓣尋_;?:_觸??T〇^?.?h??4000bp?齡“??識屬趣々讀H??;?一一?'廣??2000bp——;:iJ§。;;^;??1500bp ̄;?]??_bp—隊?I??75〇bp—?rgr-??25。卜?Ei:?—」??圖4酶切鑒定PCV3質(zhì)粒??Fig.?4?PCV3?plasmid?identification?by?enzyme?digestion??注:M:?DL12000?DNAMarker;?1:?pcDNA3.1?(?+?)?-PCV3?被?Xhol?內(nèi)切酶進行酶切:2:?pcDNA3.1?(?+?)?-PCV3〇??Note:?M:?DL2000?DNA?Marker;?I:?PcDNA3?1?(+)-PCV3?was?cleaved?by?Xhol?endonuclease;?2:?PcDNA3.1?(+)-PCV3.??3.1.5?PCV3河北株序列特征分析??為了進一步的了解PCV3河北株(GenBank登錄號:MK105924)基因序列的特征,繪制了??基因圖譜(圖5)并對其進行分析。從圖中我們可以看到有3個開放閱讀框(ORFs),分別為??ORF1、0RF2和0RF3,每個開放閱讀框編碼的蛋白質(zhì)都大于200個氨基酸,0RF1和ORF2的??編碼方向相反,而ORF]和ORF3的編碼方向相同

【參考文獻】:
期刊論文
[1]Molecular Epidemiology of Porcine Circovirus Type 3 Infection in Swine Herds in China[J]. Xiangdong Li,Chaolin Zhang,Mingming Qiao,Jiangsong Guo,Guangyuan Xing,Chunxia Jin,Juan Wang,Ming Sun,Kegong Tian.  Virologica Sinica. 2018(04)
[2]不同接毒方法對豬圓環(huán)病毒2型增殖的影響[J]. 陳玉文.  福建畜牧獸醫(yī). 2017(04)
[3]斷奶豬多系統(tǒng)衰弱綜合征血清抗體檢測[J]. 郎洪武,張廣川,吳發(fā)權(quán),張創(chuàng)貴.  中國獸醫(yī)科技. 2000(03)



本文編號:2995366

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