雞不同F(xiàn)SHR表達水平的小黃卵泡全轉錄組分析
發(fā)布時間:2021-01-23 02:54
卵泡選擇是當前家禽繁殖生物學的熱點,研究卵泡選擇的分子機制有助于充分開發(fā)母雞卵巢內豐富的卵泡資源,提高母雞的產(chǎn)蛋和繁殖性能。卵泡的選擇主要依賴垂體分泌的FSH調控以及受體FSHR的表達,FSHR表達量高的卵泡響應FSH的刺激。近幾年研究發(fā)現(xiàn),lncRNA、miRNA等非編碼RNA在調控細胞分化,轉錄激活與轉錄干擾等生物學過程中起到了不可忽視的作用,但對于其如何影響動物卵巢卵泡的發(fā)育還知之甚少,特別是對禽類卵巢卵泡發(fā)育和選擇的影響鮮有報道。本研究對產(chǎn)蛋高峰期濟寧百日雞不同F(xiàn)SHR表達量的小黃卵泡進行了全轉錄組測序,對隨機選擇的30個mRNA、lncRNA和miRNA進行了定量驗證,對篩選出的mRNA,lncRNA和miRNA以及它們的靶基因進行了初步研究和生物信息學分析。結果如下:1.雞小黃卵泡的全轉錄組測序數(shù)據(jù)的基本統(tǒng)計。樣本SY1獲得99105865個高質量讀數(shù),占原始數(shù)據(jù)的98.87%,檢測到42794個mRNA、8011個ncRNA和200個miRNA。樣本SY2獲得10605080個高質量讀數(shù),占原始數(shù)據(jù)的98.83%,檢測到42850個mRNA、8138個ncRNA和229個...
【文章來源】:山東農業(yè)大學山東省
【文章頁數(shù)】:74 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
雞不同發(fā)育時期的各級卵泡(Johnson,2014)
長的原始卵泡中,一部分卵泡受到未知信號刺激后開始緩慢生長;第卵泡被優(yōu)勢化選擇發(fā)育為等級卵泡時。一旦卵泡生長至等級卵泡時,率則非常低(Gilbert et al., 1983)。最大的等級卵泡 F1 排卵后,F(xiàn)2在發(fā)育 24-26 小時后發(fā)生排卵。膜細胞和顆粒細胞育的初期階段,卵母細胞周圍的體細胞分化并緊密結合在一起,發(fā)育由此原始卵泡開始形成。當原始卵泡被選擇發(fā)育為初級卵泡后,間質層。顆粒細胞和膜細胞被非細胞成分組成的基膜隔開,有效阻止了血接接觸。白卵泡初期只有一層顆粒細胞,發(fā)育到后期分為兩層,到黃變?yōu)槎鄬,而發(fā)育為等級卵泡時又逐漸變?yōu)橐粚蛹毎。而單層膜細胞功能具有明顯差別的各具多層細胞的內外兩層膜(袁振杰,2016)。
者們已經(jīng)不滿足于單個基因研究,而將眼光聚焦于能的信使 RNA 和非編碼 RNA 的表達水平。飛速發(fā)展和大數(shù)據(jù)時代的來臨和,研究者的這種需通量測序技術,具有數(shù)據(jù)量大,測序深度廣,靈敏進行分析等優(yōu)點(祁云霞 等, 2011)。第三代測序錄本拼接短、信息不完整的問題。能夠超長讀長,信息,并能夠發(fā)現(xiàn)未被注釋的序列,并能夠精確地lm et al., 2008)。Diaz 等人對于母雞小卵泡轉錄組研基因 StAR、CYP11A1 和 HSD3B 在 1mm 卵泡中的m 卵泡中進一步增加(Diaz et al., 2011)。2019 年黎非編碼 RNAlncIRS1 調控肌肉生長發(fā)育的分子機理iR-15 家族,促進 IRS1 基因表達,激活 IGF1-PI3K胞的增殖和分化(Li et al.,2019)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]轉錄組研究新技術:RNA-Seq及其應用[J]. 祁云霞,劉永斌,榮威恒. 遺傳. 2011(11)
[2]禽類下丘腦-垂體-性腺軸的內分泌調節(jié)[J]. 劉紅云,張才喬. 中國獸醫(yī)雜志. 2006(09)
碩士論文
[1]miR-26a-5p在雞卵泡細胞中的表達、作用及其調控分析[D]. 吳海珍.山東農業(yè)大學 2018
[2]PTHLH在雞卵泡發(fā)育中的功能、表達調控及其與產(chǎn)蛋性能的關系[D]. 郭曉莉.山東農業(yè)大學 2017
[3]長鏈非編碼RNA調控小鼠卵巢發(fā)育的初步研究[D]. 李加宇.華南農業(yè)大學 2016
本文編號:2994406
【文章來源】:山東農業(yè)大學山東省
【文章頁數(shù)】:74 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
雞不同發(fā)育時期的各級卵泡(Johnson,2014)
長的原始卵泡中,一部分卵泡受到未知信號刺激后開始緩慢生長;第卵泡被優(yōu)勢化選擇發(fā)育為等級卵泡時。一旦卵泡生長至等級卵泡時,率則非常低(Gilbert et al., 1983)。最大的等級卵泡 F1 排卵后,F(xiàn)2在發(fā)育 24-26 小時后發(fā)生排卵。膜細胞和顆粒細胞育的初期階段,卵母細胞周圍的體細胞分化并緊密結合在一起,發(fā)育由此原始卵泡開始形成。當原始卵泡被選擇發(fā)育為初級卵泡后,間質層。顆粒細胞和膜細胞被非細胞成分組成的基膜隔開,有效阻止了血接接觸。白卵泡初期只有一層顆粒細胞,發(fā)育到后期分為兩層,到黃變?yōu)槎鄬,而發(fā)育為等級卵泡時又逐漸變?yōu)橐粚蛹毎。而單層膜細胞功能具有明顯差別的各具多層細胞的內外兩層膜(袁振杰,2016)。
者們已經(jīng)不滿足于單個基因研究,而將眼光聚焦于能的信使 RNA 和非編碼 RNA 的表達水平。飛速發(fā)展和大數(shù)據(jù)時代的來臨和,研究者的這種需通量測序技術,具有數(shù)據(jù)量大,測序深度廣,靈敏進行分析等優(yōu)點(祁云霞 等, 2011)。第三代測序錄本拼接短、信息不完整的問題。能夠超長讀長,信息,并能夠發(fā)現(xiàn)未被注釋的序列,并能夠精確地lm et al., 2008)。Diaz 等人對于母雞小卵泡轉錄組研基因 StAR、CYP11A1 和 HSD3B 在 1mm 卵泡中的m 卵泡中進一步增加(Diaz et al., 2011)。2019 年黎非編碼 RNAlncIRS1 調控肌肉生長發(fā)育的分子機理iR-15 家族,促進 IRS1 基因表達,激活 IGF1-PI3K胞的增殖和分化(Li et al.,2019)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]轉錄組研究新技術:RNA-Seq及其應用[J]. 祁云霞,劉永斌,榮威恒. 遺傳. 2011(11)
[2]禽類下丘腦-垂體-性腺軸的內分泌調節(jié)[J]. 劉紅云,張才喬. 中國獸醫(yī)雜志. 2006(09)
碩士論文
[1]miR-26a-5p在雞卵泡細胞中的表達、作用及其調控分析[D]. 吳海珍.山東農業(yè)大學 2018
[2]PTHLH在雞卵泡發(fā)育中的功能、表達調控及其與產(chǎn)蛋性能的關系[D]. 郭曉莉.山東農業(yè)大學 2017
[3]長鏈非編碼RNA調控小鼠卵巢發(fā)育的初步研究[D]. 李加宇.華南農業(yè)大學 2016
本文編號:2994406
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