無角牦牛crtc3基因多態(tài)性及其與生長性狀的相關(guān)分析
發(fā)布時間:2021-01-17 21:20
為探究crtc3基因在無角牦牛群體中的遺傳多態(tài)性,開展其與生長性狀間的關(guān)聯(lián)性。利用PCR-SSCP技術(shù)結(jié)合DNA測序?qū)?54頭無角牦牛crtc3基因進行多態(tài)性分析,并運用SPSS 20.0軟件對各基因型間不同月齡(6,12和18月齡)的體質(zhì)量、體高、體斜長和胸圍等生長性狀指標進行關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果表明,在牦牛crtc3基因的第14內(nèi)含子的第86 041處發(fā)生C→T單個堿基突變,結(jié)合PCR-SSCP結(jié)果分析后,分為CC、CT和TT 3種基因型。關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn),在6月齡,CC基因型個體體高顯著高于TT基因型個體, CC基因型個體胸圍顯著高于CT基因型個體;在12月齡,CC基因型和CT基因型個體體高極顯著高于TT基因型個體,CC基因型個體胸圍極顯著高于TT基因型個體;在18月齡,CC基因型個體體質(zhì)量和體高顯著高于TT基因型個體。綜上所述,在牦牛crtc3基因上檢測到第14內(nèi)含子的第86 041處發(fā)生C→T單個堿基突變,該突變位點對無角牦牛各時期的體質(zhì)量、體高和胸圍等生長性狀等有顯著影響,可以作為一種遺傳標記用于輔助選擇。
【文章來源】:中國獸醫(yī)學報. 2020,40(06)北大核心
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
crtc3基因PCR擴增結(jié)果
crtc3基因的PCR擴增產(chǎn)物經(jīng)10%聚丙烯酰胺凝膠電泳后,銀染法顯示條帶,結(jié)果共檢測到2個等位基因,3種基因型,分別命名為CC型、CT型和TT型(圖2)。2.3 crtc3基因序列分析結(jié)果
無角牦牛crtc3基因多態(tài)位點的優(yōu)勢基因型和等位基因分別是CC和C,其頻率分別是0.559 3和0.745 8(表1)。該位點的多態(tài)信息含量是0.452 8,處于中度多態(tài)(0.25<PIC<0.50,表2),說明該位點在牦牛群體中多態(tài)性較高,遺傳變異較豐富。經(jīng)卡方適合性檢驗可知,該位點未達到Hardy-Weinberg平衡(表2)。表1 無角牦牛crtc3基因的基因型頻率和等位基因頻率 基因 基因型頻率(樣本數(shù)) 等位基因頻率 CC(198) CT(132) TT(24) C T crtc3 0.559 3 0.372 9 0.067 8 0.745 8 0.254 2
【參考文獻】:
期刊論文
[1]CRTC3基因多態(tài)性及基因型組合與秦川牛生長性狀的關(guān)聯(lián)分析[J]. 徐懷超,昝林森,王洪寶,寧越. 畜牧獸醫(yī)學報. 2016(11)
[2]牦牛INHBA基因的克隆及序列分析[J]. 穆曉琨,字向東,畢琳. 西南民族大學學報(自然科學版). 2014(02)
[3]秦川牛PYGM基因的表達及其遺傳變異對胴體和體尺性狀的影響[J]. 牛富彪,王麗君,楊菁,陳玲,王洪亮,賀花,劉小林. 西北農(nóng)林科技大學學報(自然科學版). 2013(09)
[4]中國牦牛業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀及對策分析[J]. 郭憲,閻萍,梁春年,裴杰,曾玉峰,包鵬甲. 中國牛業(yè)科學. 2009(02)
碩士論文
[1]CRTC家族3個基因SNP檢測及其與秦川肉牛生長性狀和胴體性狀的關(guān)聯(lián)性分析[D]. 徐懷超.西北農(nóng)林科技大學 2016
本文編號:2983612
【文章來源】:中國獸醫(yī)學報. 2020,40(06)北大核心
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
crtc3基因PCR擴增結(jié)果
crtc3基因的PCR擴增產(chǎn)物經(jīng)10%聚丙烯酰胺凝膠電泳后,銀染法顯示條帶,結(jié)果共檢測到2個等位基因,3種基因型,分別命名為CC型、CT型和TT型(圖2)。2.3 crtc3基因序列分析結(jié)果
無角牦牛crtc3基因多態(tài)位點的優(yōu)勢基因型和等位基因分別是CC和C,其頻率分別是0.559 3和0.745 8(表1)。該位點的多態(tài)信息含量是0.452 8,處于中度多態(tài)(0.25<PIC<0.50,表2),說明該位點在牦牛群體中多態(tài)性較高,遺傳變異較豐富。經(jīng)卡方適合性檢驗可知,該位點未達到Hardy-Weinberg平衡(表2)。表1 無角牦牛crtc3基因的基因型頻率和等位基因頻率 基因 基因型頻率(樣本數(shù)) 等位基因頻率 CC(198) CT(132) TT(24) C T crtc3 0.559 3 0.372 9 0.067 8 0.745 8 0.254 2
【參考文獻】:
期刊論文
[1]CRTC3基因多態(tài)性及基因型組合與秦川牛生長性狀的關(guān)聯(lián)分析[J]. 徐懷超,昝林森,王洪寶,寧越. 畜牧獸醫(yī)學報. 2016(11)
[2]牦牛INHBA基因的克隆及序列分析[J]. 穆曉琨,字向東,畢琳. 西南民族大學學報(自然科學版). 2014(02)
[3]秦川牛PYGM基因的表達及其遺傳變異對胴體和體尺性狀的影響[J]. 牛富彪,王麗君,楊菁,陳玲,王洪亮,賀花,劉小林. 西北農(nóng)林科技大學學報(自然科學版). 2013(09)
[4]中國牦牛業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀及對策分析[J]. 郭憲,閻萍,梁春年,裴杰,曾玉峰,包鵬甲. 中國牛業(yè)科學. 2009(02)
碩士論文
[1]CRTC家族3個基因SNP檢測及其與秦川肉牛生長性狀和胴體性狀的關(guān)聯(lián)性分析[D]. 徐懷超.西北農(nóng)林科技大學 2016
本文編號:2983612
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