環(huán)狀RNA（circular RNA,circRNA）是由反向剪接（back-splicing）過程產(chǎn)生的共價(jià)閉合環(huán)狀RNA。具有在真核生物中含量豐富,進(jìn)化上保守,呈現(xiàn)組織特異性表達(dá),高度穩(wěn)定,可在神經(jīng)組織中隨衰老而累積等特點(diǎn)。circRNA可以通過競(jìng)爭(zhēng)剪接方式與其對(duì)應(yīng)的線性RNA產(chǎn)物進(jìn)行順式調(diào)節(jié)。棘球蚴�。╡chinococcosis）俗稱包蟲�。╤ydatidosis/hydatid disease）,是由棘球?qū)伲‥chinocococcus）絳蟲的幼蟲寄生于人和動(dòng)物的肝臟、肺臟等組織器官而引起的一種重要的人獸共患寄生蟲病。由多房棘球絳蟲（E.multilocularis,Em）的幼蟲即多房棘球蚴引起的疾病稱多房棘球蚴�。╝lveolar echinococcosis,AE）又名泡型棘球蚴病或泡型包蟲病,是一種廣泛分布于北半球的人獸共患寄生蟲病,為自然疫源性疾病。每年大約新增患者17,400例,其中大部分發(fā)生在中國。多房棘球蚴可以寄生于中間宿主的肝、肺等組織器官,像惡性腫瘤一樣,從組織器官向體腔內(nèi)蔓延生長(zhǎng),故多房棘球蚴病又稱為“蟲癌”。它危害宿主的方式主要是通過奪取宿主營養(yǎng)物質(zhì)、機(jī)... 

【文章來源】：中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市

【文章頁數(shù)】：51 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

circRNA芯片質(zhì)控箱線圖

中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文第二章多房棘球蚴感染小鼠肝臟差異表達(dá)circRNA的篩選與驗(yàn)證243-43-5圖2-4.circRNA芯片掃描圖Fig.2-4ScanningimagesofcircRNAmicroarray2.3.5差異circRNA的篩選將原始數(shù)據(jù)導(dǎo)入GeneSpring軟件（version14.8,AgilentTechnologies），將原始數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化便于后續(xù)的數(shù)據(jù)分析，篩選標(biāo)準(zhǔn)：P<0.05及l(fā)og2(foldchange)>2或log2(foldchange)<2。結(jié)果表明，感染多房棘球蚴30d的小鼠肝與對(duì)照組比較，差異circRNA上調(diào)表達(dá)的有201個(gè)，下調(diào)表達(dá)的有9個(gè)，總差異circRNA共計(jì)210個(gè)，差異circRNA的基因長(zhǎng)度主要集中在1000bp以內(nèi)（見圖2-2）。繪制散點(diǎn)圖(scatterplot)，用于評(píng)估兩組數(shù)據(jù)總體分布集中趨勢(shì)（見圖2-3）。落在圖形中y=x直線（圖上的中位線）上的點(diǎn)，代表差異倍數(shù)是1，中位線兩側(cè)的點(diǎn)，其代表這個(gè)探針點(diǎn)在兩張芯片中信號(hào)值差異FoldChange>2,中位線上側(cè)區(qū)代表2倍上調(diào)基因；中位線下側(cè)區(qū)代表2倍下調(diào)基因。

中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文第二章多房棘球蚴感染小鼠肝臟差異表達(dá)circRNA的篩選與驗(yàn)證25圖2-2兩組差異circRNA轉(zhuǎn)錄本大小分布Fig.2-2Size(nt)distributionoftranscriptswithdifferentiallyexpressedcircRNAs圖2-3兩組差異circRNA散點(diǎn)圖Fig.2-3ScatterplotofdifferentiallyexpressedcircRNA2.3.6circRNA的差異表達(dá)分析與qPCR驗(yàn)證隨機(jī)選取6個(gè)circRNA進(jìn)行qPCR驗(yàn)證，結(jié)果（見圖2-5）顯示，6個(gè)circRNA變化趨勢(shì)與芯片結(jié)果一致，4個(gè)上調(diào)基因和2個(gè)下調(diào)基因都有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P＜0.05），表明芯片測(cè)序結(jié)果可58514556010203040506070小于300nt300-500nt500-1000nt大于1000nt數(shù)量numbercircRNA分子大小SizeofcircRNAs


本文編號(hào)：2979858