豬鏈球菌真核樣絲氨酸/蘇氨酸激酶stk基因功能的實(shí)驗(yàn)研究
發(fā)布時(shí)間:2021-01-07 11:18
豬鏈球菌(Streptococcus suis,S.suis)是一種重要的人獸共患病病原菌,根據(jù)其表面莢膜多糖(Capsular polysaccharide, CPS)的抗原性,可以分為1/2、1-31和33共33個(gè)血清型,其中2型豬鏈球菌(Streptococcus suis serotype2,S.suis2)毒力最強(qiáng),臨床檢出率最高。近年來(lái)多次出現(xiàn)S.suis2感染人事件,尤其是1998年和2005年,分別在江蘇海安和四川資陽(yáng)暴發(fā)了大規(guī)模的S.suis2感染人疫情,患者出現(xiàn)高比例的、國(guó)內(nèi)外罕見的鏈球菌中毒性休克綜合癥(streptococcal toxic shock syndrome, STSS)癥狀,病情兇險(xiǎn),致死率高。然而豬鏈球菌的致病機(jī)制仍不清楚。信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng)是有機(jī)體對(duì)不斷變化的外界環(huán)境做出反應(yīng)的一個(gè)重要機(jī)制。在細(xì)菌中,磷酸化信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng)在這一過(guò)程中發(fā)揮著重要作用。對(duì)其深入的研究主要集中在二元信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng)(two-component signal transduction system,TCSTS)中,即組氨酸和天冬氨酸殘基的磷酸化。隨著基因組學(xué)研究的不斷深入和分子生物...
【文章來(lái)源】:南京師范大學(xué)江蘇省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:61 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
革蘭氏陽(yáng)性細(xì)菌中的絲氨酸/蘇氨酸激酵丨
UA159、化膿鏈球菌SF370具有同源性。其中豬鏈球菌stk與上述四種菌編碼基因的序列一致性分別為76%,73%, 74%,72%。噸與上述四種菌編碼基因的序列一致性分別為69%,69%, 67%,66%。將STP/STK氨基在Pfam蛋白質(zhì)家族數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì),結(jié)果表明豬鏈球菌STK為單次跨膜蛋N端激酶結(jié)構(gòu)域和C端4個(gè)青霉素結(jié)合蛋白和絲氧酸/蘇氨酸激酶相關(guān)結(jié)enicillin-binding protein and Ser/Thr kinase-associated domains, PASTA)。S內(nèi)蛋白,屬于金屬依賴型磷酸_(metal-dependent phosphatase, PPM)家C亞家族(圖2.2)。分別將STP、STK進(jìn)行多重序列比對(duì),從一級(jí)結(jié)構(gòu)上出STP的氨基酸序列具有相似性,因此該蛋白具有一定的保守性。STK序列的相似程度很高,說(shuō)明該蛋白的激酶結(jié)構(gòu)域具有高度的保守性(圖2.表2.2 stplstk基因注釋結(jié)果CDS name CDS length GC in CDS (%) Strand Annotation05SSU0427 810 42.22 + Serine/threonine phosphat05SSU0428 1992 43.38 + Serine/threonine kinase
第2章2型豬鏈球菌stp-stk轉(zhuǎn)錄操縱子鑒定及STP活性鑒定ZYH33基因組對(duì);操縱子的啟動(dòng)子區(qū)預(yù)測(cè)結(jié)果ROM在線工具預(yù)測(cè)stp和stk的啟動(dòng)子存在的可能基因區(qū)域。我們425上游150 bp片段內(nèi)可能存在啟動(dòng)子區(qū)域。-對(duì)A:基因操縱子的實(shí)驗(yàn)鑒定別提取05ZYH33全基因組DNA,RNA, RT-PCR將RNA逆轉(zhuǎn)錄為cDF1/R1,F(xiàn)2/R2, F3/R3引物對(duì)進(jìn)行PCR擴(kuò)增。以基因組DNA為模出相應(yīng)大小的DNA片段。以全菌RNA為模板,則擴(kuò)增不出相應(yīng)條取的RNA沒有基因組DNA的污染。以RNA反轉(zhuǎn)錄得到的cDNA為增出相應(yīng)條帶,則證明了於P和以及上游的兩個(gè)基因(分別編碼NA-甲醜基轉(zhuǎn)移酶和胞啼徒-C5-甲基化酶)處于同一個(gè)轉(zhuǎn)錄操縱子內(nèi)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]真核樣絲氨酸/蘇氨酸激酶在鏈球菌中的研究進(jìn)展[J]. 杜驍杰,潘秀珍. 中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2014(03)
[2]2型豬鏈球菌絲氨酸/蘇氨酸磷酸酶重組蛋白的制備及鑒定[J]. 杜驍杰,郭靜靜,王晶,李敏,王玲,王長(zhǎng)軍,潘秀珍. 醫(yī)學(xué)研究生學(xué)報(bào). 2014(02)
[3]豬鏈球菌真核樣絲氨酸/蘇氨酸激酶stk基因敲除株的構(gòu)建[J]. 杜驍杰,王玲,鄭峰,李敏,王晶,胡丹,李先富,王長(zhǎng)軍,潘秀珍. 中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2013(12)
[4]2型豬鏈球菌中國(guó)強(qiáng)毒株05ZYH33 sao基因敲除突變株的構(gòu)建及其生物學(xué)功能[J]. 劉文靜,潘秀珍,李先富,王長(zhǎng)軍,唐家琪. 微生物學(xué)通報(bào). 2010(12)
[5]豬鏈球菌2型二元信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng)ciaR基因敲除突變株的構(gòu)建及生物學(xué)功能研究[J]. 馮曉丹,程功,王晶,王長(zhǎng)軍,潘秀珍,唐家琪. 中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2009(03)
[6]細(xì)菌毒素-抗毒素系統(tǒng)的研究進(jìn)展[J]. 王曉蕾,趙龍旋,張俊杰. 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2008(09)
[7]鏈霉菌真核型絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶的研究進(jìn)展[J]. 楊旭,關(guān)東明,王勝蘭,楊克遷. 微生物學(xué)報(bào). 2008(01)
[8]遠(yuǎn)緣鏈球菌ftsK基因敲除菌株的構(gòu)建[J]. 金濤,吳補(bǔ)領(lǐng),蘇凌云,高杰. 牙體牙髓牙周病學(xué)雜志. 2005(05)
本文編號(hào):2962467
【文章來(lái)源】:南京師范大學(xué)江蘇省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:61 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
革蘭氏陽(yáng)性細(xì)菌中的絲氨酸/蘇氨酸激酵丨
UA159、化膿鏈球菌SF370具有同源性。其中豬鏈球菌stk與上述四種菌編碼基因的序列一致性分別為76%,73%, 74%,72%。噸與上述四種菌編碼基因的序列一致性分別為69%,69%, 67%,66%。將STP/STK氨基在Pfam蛋白質(zhì)家族數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì),結(jié)果表明豬鏈球菌STK為單次跨膜蛋N端激酶結(jié)構(gòu)域和C端4個(gè)青霉素結(jié)合蛋白和絲氧酸/蘇氨酸激酶相關(guān)結(jié)enicillin-binding protein and Ser/Thr kinase-associated domains, PASTA)。S內(nèi)蛋白,屬于金屬依賴型磷酸_(metal-dependent phosphatase, PPM)家C亞家族(圖2.2)。分別將STP、STK進(jìn)行多重序列比對(duì),從一級(jí)結(jié)構(gòu)上出STP的氨基酸序列具有相似性,因此該蛋白具有一定的保守性。STK序列的相似程度很高,說(shuō)明該蛋白的激酶結(jié)構(gòu)域具有高度的保守性(圖2.表2.2 stplstk基因注釋結(jié)果CDS name CDS length GC in CDS (%) Strand Annotation05SSU0427 810 42.22 + Serine/threonine phosphat05SSU0428 1992 43.38 + Serine/threonine kinase
第2章2型豬鏈球菌stp-stk轉(zhuǎn)錄操縱子鑒定及STP活性鑒定ZYH33基因組對(duì);操縱子的啟動(dòng)子區(qū)預(yù)測(cè)結(jié)果ROM在線工具預(yù)測(cè)stp和stk的啟動(dòng)子存在的可能基因區(qū)域。我們425上游150 bp片段內(nèi)可能存在啟動(dòng)子區(qū)域。-對(duì)A:基因操縱子的實(shí)驗(yàn)鑒定別提取05ZYH33全基因組DNA,RNA, RT-PCR將RNA逆轉(zhuǎn)錄為cDF1/R1,F(xiàn)2/R2, F3/R3引物對(duì)進(jìn)行PCR擴(kuò)增。以基因組DNA為模出相應(yīng)大小的DNA片段。以全菌RNA為模板,則擴(kuò)增不出相應(yīng)條取的RNA沒有基因組DNA的污染。以RNA反轉(zhuǎn)錄得到的cDNA為增出相應(yīng)條帶,則證明了於P和以及上游的兩個(gè)基因(分別編碼NA-甲醜基轉(zhuǎn)移酶和胞啼徒-C5-甲基化酶)處于同一個(gè)轉(zhuǎn)錄操縱子內(nèi)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]真核樣絲氨酸/蘇氨酸激酶在鏈球菌中的研究進(jìn)展[J]. 杜驍杰,潘秀珍. 中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2014(03)
[2]2型豬鏈球菌絲氨酸/蘇氨酸磷酸酶重組蛋白的制備及鑒定[J]. 杜驍杰,郭靜靜,王晶,李敏,王玲,王長(zhǎng)軍,潘秀珍. 醫(yī)學(xué)研究生學(xué)報(bào). 2014(02)
[3]豬鏈球菌真核樣絲氨酸/蘇氨酸激酶stk基因敲除株的構(gòu)建[J]. 杜驍杰,王玲,鄭峰,李敏,王晶,胡丹,李先富,王長(zhǎng)軍,潘秀珍. 中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2013(12)
[4]2型豬鏈球菌中國(guó)強(qiáng)毒株05ZYH33 sao基因敲除突變株的構(gòu)建及其生物學(xué)功能[J]. 劉文靜,潘秀珍,李先富,王長(zhǎng)軍,唐家琪. 微生物學(xué)通報(bào). 2010(12)
[5]豬鏈球菌2型二元信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng)ciaR基因敲除突變株的構(gòu)建及生物學(xué)功能研究[J]. 馮曉丹,程功,王晶,王長(zhǎng)軍,潘秀珍,唐家琪. 中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2009(03)
[6]細(xì)菌毒素-抗毒素系統(tǒng)的研究進(jìn)展[J]. 王曉蕾,趙龍旋,張俊杰. 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2008(09)
[7]鏈霉菌真核型絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶的研究進(jìn)展[J]. 楊旭,關(guān)東明,王勝蘭,楊克遷. 微生物學(xué)報(bào). 2008(01)
[8]遠(yuǎn)緣鏈球菌ftsK基因敲除菌株的構(gòu)建[J]. 金濤,吳補(bǔ)領(lǐng),蘇凌云,高杰. 牙體牙髓牙周病學(xué)雜志. 2005(05)
本文編號(hào):2962467
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