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靜原雞ELOVL2和ELOVL5基因組織表達(dá)特性及生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2021-01-02 01:18
  極長(zhǎng)鏈脂肪酸延伸酶家族基因(ELOVLs)是哺乳動(dòng)物脂肪酸合成的起始酶和限速酶,其中ELOVL2和ELOVL5主要參與合成對(duì)人體有特殊營(yíng)養(yǎng)價(jià)值的多不飽和脂肪酸。為了研究雞ELOVLs基因家族的遺傳多態(tài)性、組織表達(dá)特性及編碼蛋白的特性和高級(jí)結(jié)構(gòu),本研究以寧夏地方優(yōu)良品種靜原雞為研究對(duì)象,采用PCR-SSCP及DNA測(cè)序技術(shù)對(duì)靜原雞ELOVL2和ELOVL5基因所有外顯子和部分內(nèi)含子序列進(jìn)行遺傳多態(tài)性檢測(cè),利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qRT-PCR)技術(shù)對(duì)靜原雞肝臟、肌肉、心臟、睪丸、卵巢、腹脂6個(gè)組織中ELOVL2和ELOVL5基因的mRNA表達(dá)量進(jìn)行檢測(cè)、分析,通過(guò)生物信息學(xué)方法對(duì)ELOVL2和ELOVL5基因CDS區(qū)的理化性質(zhì)、信號(hào)肽、跨膜結(jié)構(gòu)域、親水性/疏水性、二級(jí)結(jié)構(gòu)以及磷酸化位點(diǎn)等進(jìn)行預(yù)測(cè)分析,研究結(jié)果表明:1.靜原雞ELOVL2和ELOVL5基因遺傳多態(tài)性 靜原雞ELOVL2基因外顯子7、8和內(nèi)含子2、4、6上均存在多態(tài)性,其中ELOVL2基因外顯子7(E2e7)和外顯子8(E2e8)分別存在c.708G>A和c.888T>C的突變,均屬于同義突變,兩個(gè)突變位點(diǎn)均未偏... 

【文章來(lái)源】:寧夏大學(xué)寧夏回族自治區(qū) 211工程院校

【文章頁(yè)數(shù)】:61 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

靜原雞ELOVL2和ELOVL5基因組織表達(dá)特性及生物信息學(xué)分析


圖2-1靜原雞全基因組DNA提取??Fig?2-1?the?genomic?DNA?extraction?of?Jingyuan?chicken??

序列比對(duì),等位基因,原雞,內(nèi)含子


2.2.4.2靜原雞基因內(nèi)含子2、內(nèi)含子4和內(nèi)含子6序列比對(duì)分析??與NCBI公布的原雞基因序列(NC_006089.4)比對(duì)后發(fā)現(xiàn),靜原雞E2I6引物擴(kuò)??增片段多態(tài)性是由內(nèi)含子6上的核苷酸點(diǎn)突變?cè)斐傻,等位基因序列比?duì)如圖2-6,等位基??因B4存在g.63388000+748G>C的顛換。靜原雞E2I2引物擴(kuò)增片段多態(tài)性是由內(nèi)含子2上??的核苷酸點(diǎn)突變?cè)斐傻,等位基因序列比?duì)如圖2-7,其中等位基因B3存在??g.63372228+4918G>A的轉(zhuǎn)換和g.63372228+5024T>C的轉(zhuǎn)換,等位基因A3存在??g.63372228+5024T>C?的轉(zhuǎn)換,等位基因?D3?存在?g.63372228+4918G>A?的轉(zhuǎn)換、??g.63372228+4928C>A的顛換和g.63372228+5025T>C的轉(zhuǎn)換。靜原雞E2I4引物擴(kuò)增片段多??態(tài)性是由內(nèi)含子區(qū)的核苷酸點(diǎn)突變?cè)斐傻,其中等位基因B5存在g.63386502+211A>G的轉(zhuǎn)??換,等位基因C5存在g.?63386502+165T>C的轉(zhuǎn)換和g.?63386502+211A>G的轉(zhuǎn)換(圖2-8)。??2.2.4.3靜原雞基因內(nèi)含子2序列比對(duì)分析??與NCBI公布的原雞說(shuō)OFZ5基因序列(NC_006090.4)進(jìn)行比對(duì),靜原雞E5I2引物擴(kuò)??增片段多態(tài)性是由第二內(nèi)含子的核苷酸點(diǎn)突變?cè)斐傻?

瓊脂,凝膠電泳,檢測(cè)結(jié)果,純度


論文?第三章靜原雞EL0VL2及ELOVL5基因mR析??度分析??NA利用2%瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果如圖3-1所示,28S、18S、5S,無(wú)明顯降解?偅遥危恋募兌韧ㄟ^(guò)分光光度OD260/OD280在1.8?2.0之間,說(shuō)明提取的RNA純度較高,

【參考文獻(xiàn)】:
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本文編號(hào):2952363

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