一株雞源呼腸孤病毒的分離鑒定及防污染RT-LAMP檢測法的建立
發(fā)布時(shí)間:2020-12-22 20:45
禽呼腸孤病毒(avian reovirus,ARV)屬于呼腸孤病毒科正呼腸孤病毒屬,可引起雞的病毒性關(guān)節(jié)炎、矮小綜合征、呼吸道疾病、腸道疾病、免疫抑制等。導(dǎo)致肉雞飼料轉(zhuǎn)化率低、增重下降、生長不齊,蛋雞除跛行外還會(huì)引起產(chǎn)蛋量下降、孵化率下降等,增加了養(yǎng)殖成本。自1985年我國首次報(bào)道禽呼腸孤病毒感染以來,此后多個(gè)省市地區(qū)均出現(xiàn)了該病的報(bào)道,感染情況日益加重,嚴(yán)重危害養(yǎng)禽業(yè)的發(fā)展。深化該病的研究對(duì)于我國養(yǎng)雞產(chǎn)業(yè)的健康和穩(wěn)定發(fā)展具有積極的意義。本研究從疑似ARV感染的免疫肉雞體內(nèi)分離得到一株ARV,對(duì)該毒株進(jìn)行了序列分析及理化性質(zhì)的研究。同時(shí)建立了一種快速可消除攜帶污染的UDG-RT-LAMP檢測方法,并對(duì)該方法的反應(yīng)條件進(jìn)行了優(yōu)化,為ARV感染的防控及快速檢測提供了理論依據(jù)和新思路。本研究分別利用SPF雞胚和雞胚肝細(xì)胞(CEL)對(duì)山東濰坊地區(qū)疑似ARV感染的免疫肉雞關(guān)節(jié)病料進(jìn)行了病毒病原的分離,將分離株命名為WF株,對(duì)分離毒株進(jìn)行了序列的測定與分析、毒力的測定、動(dòng)物回歸試驗(yàn)、理化性質(zhì)的測定等試驗(yàn)。雞胚和CEL細(xì)胞接種病料處理液后出現(xiàn)的特征性病變均與報(bào)道相符。分別提取RNA,RT-PCR反應(yīng)...
【文章來源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁數(shù)】:58 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
LAMP引物模式圖(江彥增,2008)
FIP 中的 F2 首先與靶 DNA 的 F2c 互補(bǔ)結(jié)合(圖2-a),合成互補(bǔ)的 DNA 鏈(圖 2-b)。之后 F3 與靶 DNA 的 F3c 結(jié)合(圖 2-c),合成一條新的互補(bǔ) DNA 鏈,同時(shí) Bst DNA 聚合酶將 FIP 引導(dǎo)合成的 DNA 鏈置換解離出去(圖2-d)。被解離出的 DNA 鏈 5'的 F1c 和 F1 發(fā)生堿基自我互補(bǔ)配對(duì),形成了環(huán)狀結(jié)構(gòu)(圖2-e),BIP 中的 B2 與解離 DNA 鏈的 B2c 互補(bǔ)結(jié)合,此時(shí)環(huán)狀結(jié)構(gòu)被重新打開,合成了新的互補(bǔ) DNA 鏈(圖 2-f)。同時(shí) B3 從 B1c 段 5'端插入,引導(dǎo)合成了另一條互補(bǔ) DNA鏈
掛宰隕砦?0澹??F1 的 3'端開始進(jìn)行自我引導(dǎo)延伸(圖3-h)。同時(shí),F(xiàn)IP 中的 F2 與 F2c 互補(bǔ)結(jié)合,合成一條新的互補(bǔ) DNA 鏈,并將由 F1 引導(dǎo)自我延伸成的 DNA 單鏈置換解離出去,并在一端形成環(huán)狀結(jié)構(gòu)(圖 3-i)。之后 B1又啟動(dòng)了自我引導(dǎo)延伸,合成了長度為靶 DNA 兩倍的 DNA 鏈(圖 3-j),同時(shí)將 FIP 引導(dǎo)合成的 DNA 鏈置換解離出去,由于其兩端存在堿基自我互補(bǔ)配對(duì)的區(qū)域,于是形成了與結(jié)構(gòu) h 互補(bǔ)的啞鈴結(jié)構(gòu)(圖 3-k)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]雞傳染性喉氣管炎病毒可視化LAMP快速診斷方法的建立和應(yīng)用[J]. 謝晶,于吉鋒,周瀧,曹冶,林毅,李興玉,肖璐,葉勇剛,潘夢,康潤敏. 中國畜牧獸醫(yī). 2019(02)
[2]LAMP在臨床微生物檢測中的應(yīng)用及進(jìn)展[J]. 郭綺,楊甦慶. 國際檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志. 2019(01)
[3]雞病毒性關(guān)節(jié)炎最新研究進(jìn)展[J]. 張寧,胡曉悅,韓昱,盧軍霞,趙志強(qiáng),趙博偉. 今日畜牧獸醫(yī). 2018(11)
[4]禽呼腸孤病毒納米PCR檢測方法的建立與應(yīng)用[J]. 鄭麗,任衛(wèi)科,路超,田向?qū)W,王利麗,李秀麗,鄢明華. 中國獸醫(yī)科學(xué). 2018(06)
[5]禽呼腸孤病毒強(qiáng)毒株和弱毒疫苗株感染雞肝癌細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析[J]. 黃莉,謝芝勛,謝麗基,黃嬌玲,謝志勤,范晴,鄧顯文,羅思思,張艷芳,曾婷婷,王盛,張民秀. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2017(11)
[6]雞病毒性關(guān)節(jié)炎的研究進(jìn)展[J]. 王興和. 中國動(dòng)物保健. 2016(11)
[7]環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)的常見問題分析與研究進(jìn)展[J]. 胡宗悅,須周恒,盧亦愚. 病毒學(xué)報(bào). 2016(05)
[8]禽呼腸孤病毒分子生物學(xué)診斷方法研究進(jìn)展[J]. 李天芝,于新友,王金良. 養(yǎng)禽與禽病防治. 2016(07)
[9]LAMP-LFD技術(shù)及其在生物快檢方面應(yīng)用[J]. 黃海龍,朱鵬,楊浩. 中國生物工程雜志. 2015(12)
[10]環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)改進(jìn)的研究進(jìn)展[J]. 初亞男,封利穎,張婕妤,鄒秉杰,周國華. 微生物學(xué)通報(bào). 2015(04)
碩士論文
[1]滑液囊支原體環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)檢測方法的建立與初步應(yīng)用[D]. 寇艷利.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2018
[2]禽呼腸孤病毒流行株的進(jìn)化及致病性研究[D]. 鐘麗.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2017
[3]改良型環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增法檢測金黃色葡萄球菌的研究[D]. 張濤濤.陜西科技大學(xué) 2014
[4]禽呼腸孤病毒和傳染性支氣管炎病毒的環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增檢測方法的研究[D]. 馬利.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[5]禽呼腸孤病毒檢測方法的建立及病毒分離鑒定[D]. 孫美玉.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2012
[6]非洲豬瘟病毒環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增快速檢測方法的建立[D]. 江彥增.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2008
[7]禽呼腸孤病毒M組基因的克隆與序列分析[D]. 祁海波.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[8]環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)檢測嗜水氣單胞菌方法的建立[D]. 匡燕云.南昌大學(xué) 2007
[9]禽(雞源)呼腸孤病毒的分離與鑒定[D]. 梁英.福建農(nóng)林大學(xué) 2005
本文編號(hào):2932406
【文章來源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁數(shù)】:58 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
LAMP引物模式圖(江彥增,2008)
FIP 中的 F2 首先與靶 DNA 的 F2c 互補(bǔ)結(jié)合(圖2-a),合成互補(bǔ)的 DNA 鏈(圖 2-b)。之后 F3 與靶 DNA 的 F3c 結(jié)合(圖 2-c),合成一條新的互補(bǔ) DNA 鏈,同時(shí) Bst DNA 聚合酶將 FIP 引導(dǎo)合成的 DNA 鏈置換解離出去(圖2-d)。被解離出的 DNA 鏈 5'的 F1c 和 F1 發(fā)生堿基自我互補(bǔ)配對(duì),形成了環(huán)狀結(jié)構(gòu)(圖2-e),BIP 中的 B2 與解離 DNA 鏈的 B2c 互補(bǔ)結(jié)合,此時(shí)環(huán)狀結(jié)構(gòu)被重新打開,合成了新的互補(bǔ) DNA 鏈(圖 2-f)。同時(shí) B3 從 B1c 段 5'端插入,引導(dǎo)合成了另一條互補(bǔ) DNA鏈
掛宰隕砦?0澹??F1 的 3'端開始進(jìn)行自我引導(dǎo)延伸(圖3-h)。同時(shí),F(xiàn)IP 中的 F2 與 F2c 互補(bǔ)結(jié)合,合成一條新的互補(bǔ) DNA 鏈,并將由 F1 引導(dǎo)自我延伸成的 DNA 單鏈置換解離出去,并在一端形成環(huán)狀結(jié)構(gòu)(圖 3-i)。之后 B1又啟動(dòng)了自我引導(dǎo)延伸,合成了長度為靶 DNA 兩倍的 DNA 鏈(圖 3-j),同時(shí)將 FIP 引導(dǎo)合成的 DNA 鏈置換解離出去,由于其兩端存在堿基自我互補(bǔ)配對(duì)的區(qū)域,于是形成了與結(jié)構(gòu) h 互補(bǔ)的啞鈴結(jié)構(gòu)(圖 3-k)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]雞傳染性喉氣管炎病毒可視化LAMP快速診斷方法的建立和應(yīng)用[J]. 謝晶,于吉鋒,周瀧,曹冶,林毅,李興玉,肖璐,葉勇剛,潘夢,康潤敏. 中國畜牧獸醫(yī). 2019(02)
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[3]雞病毒性關(guān)節(jié)炎最新研究進(jìn)展[J]. 張寧,胡曉悅,韓昱,盧軍霞,趙志強(qiáng),趙博偉. 今日畜牧獸醫(yī). 2018(11)
[4]禽呼腸孤病毒納米PCR檢測方法的建立與應(yīng)用[J]. 鄭麗,任衛(wèi)科,路超,田向?qū)W,王利麗,李秀麗,鄢明華. 中國獸醫(yī)科學(xué). 2018(06)
[5]禽呼腸孤病毒強(qiáng)毒株和弱毒疫苗株感染雞肝癌細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析[J]. 黃莉,謝芝勛,謝麗基,黃嬌玲,謝志勤,范晴,鄧顯文,羅思思,張艷芳,曾婷婷,王盛,張民秀. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2017(11)
[6]雞病毒性關(guān)節(jié)炎的研究進(jìn)展[J]. 王興和. 中國動(dòng)物保健. 2016(11)
[7]環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)的常見問題分析與研究進(jìn)展[J]. 胡宗悅,須周恒,盧亦愚. 病毒學(xué)報(bào). 2016(05)
[8]禽呼腸孤病毒分子生物學(xué)診斷方法研究進(jìn)展[J]. 李天芝,于新友,王金良. 養(yǎng)禽與禽病防治. 2016(07)
[9]LAMP-LFD技術(shù)及其在生物快檢方面應(yīng)用[J]. 黃海龍,朱鵬,楊浩. 中國生物工程雜志. 2015(12)
[10]環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)改進(jìn)的研究進(jìn)展[J]. 初亞男,封利穎,張婕妤,鄒秉杰,周國華. 微生物學(xué)通報(bào). 2015(04)
碩士論文
[1]滑液囊支原體環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)檢測方法的建立與初步應(yīng)用[D]. 寇艷利.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2018
[2]禽呼腸孤病毒流行株的進(jìn)化及致病性研究[D]. 鐘麗.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2017
[3]改良型環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增法檢測金黃色葡萄球菌的研究[D]. 張濤濤.陜西科技大學(xué) 2014
[4]禽呼腸孤病毒和傳染性支氣管炎病毒的環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增檢測方法的研究[D]. 馬利.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[5]禽呼腸孤病毒檢測方法的建立及病毒分離鑒定[D]. 孫美玉.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2012
[6]非洲豬瘟病毒環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增快速檢測方法的建立[D]. 江彥增.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2008
[7]禽呼腸孤病毒M組基因的克隆與序列分析[D]. 祁海波.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
[8]環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)檢測嗜水氣單胞菌方法的建立[D]. 匡燕云.南昌大學(xué) 2007
[9]禽(雞源)呼腸孤病毒的分離與鑒定[D]. 梁英.福建農(nóng)林大學(xué) 2005
本文編號(hào):2932406
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