速激肽（Tachykinins,TKs）屬于激肽類家族成員,研究表明,速激肽通過下丘腦神經(jīng)元影響促性腺激素釋放激素（GnRH）的釋放,從而影響動(dòng)物發(fā)情、排卵和妊娠等一系列生殖過程。目前認(rèn)為,有兩個(gè)主要通路調(diào)控哺乳動(dòng)物繁殖現(xiàn)象,一是受外界光照的影響,松果體分泌褪黑激素直接作用于垂體峽部結(jié)節(jié)部,調(diào)控促甲狀腺素,然后促甲狀腺激素把信息反饋至下丘腦來調(diào)控哺乳動(dòng)物相應(yīng)的生殖功能;另外一個(gè)通路是垂體通過調(diào)節(jié)催乳素（PRL）節(jié)律性釋放來調(diào)節(jié)哺乳動(dòng)物的季節(jié)性繁殖現(xiàn)象,這個(gè)通路中的重要信號(hào)物質(zhì)可能包括速激肽在內(nèi)的一系列低分子量肽。因此,研究速激肽及其受體基因在山羊下丘腦、垂體和卵巢等組織器官內(nèi)的表達(dá)量變化與長(zhǎng)短光照之間的聯(lián)系,為探究其參與山羊繁殖過程調(diào)控下丘腦-垂體-性腺軸作用機(jī)理提供理論依據(jù)。本試驗(yàn)以飼養(yǎng)在河南科技大學(xué)周山校區(qū)牧場(chǎng)的20只河南槐山羊空懷母羊?yàn)檠芯繉?duì)象,母羊平均年齡一周歲,平均體重37.75kg。羊只的光照處理分為短光照時(shí)期（8 h光照:16 h黑暗）和長(zhǎng)光照時(shí)期（16 h光照:8 h黑暗）,短光照期為六周,長(zhǎng)光照期為四周。利用Primer Premier 6.0引物設(shè)計(jì)軟件,設(shè)計(jì)目的基... 

【文章來源】：河南科技大學(xué)河南省

【文章頁(yè)數(shù)】：95 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

RNA提取結(jié)果凝膠電泳圖

處理與參考基因組的比對(duì)分析裝軟件 Trinity 對(duì)下丘腦轉(zhuǎn)錄組從頭組裝[78]。首先使用 SOAPdens（芯片上每個(gè)反應(yīng)讀出的短序列）通過片段重疊連成更長(zhǎng)的再將 Contig 連在 起得到兩端不能再延長(zhǎng)的序列 Unigene，再對(duì)理，進(jìn) 步拼接（Tophat2 軟件[80]）。利用 Cufflinks[81]對(duì) TopHat進(jìn) 行 組 裝 ， 并 將 處 理 后 的 高 質(zhì) 量 reads 與 參 考 基01704415.1，包含 28404 注釋基因）進(jìn)行比對(duì)，獲得各樣品 read reads 在基因組上的位置信息。lean Reads 與參考基因組的序列比對(duì)，以獲得在參考基因組或基（圖 3-2），定位區(qū)域分為 Exon（外顯子）、Intron（內(nèi)含子（基因間區(qū)）。由比對(duì)到參考基因組上的 Reads（Mapped Reaads 的百分比表明，所選參考基因組組裝可以滿足信息分析的需求

圖 3-3 不同實(shí)驗(yàn)組差異基因火山圖Fig.3-3 Different gene volcanoes in different experimental groups注：橫坐標(biāo)代表基因在不同樣本中表達(dá)倍數(shù)變化，縱坐標(biāo)代表基因表達(dá)量變化差異的統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性；差異表達(dá)顯著的基因用紅點(diǎn)（上調(diào)）和綠點(diǎn)（下調(diào)）表示。差異表達(dá)不顯著的基因用藍(lán)點(diǎn)表示。Note:The horizontal coordinates represent multiple changes in the expression of genes in differentsamples and the difference of gene expression was statistically significant. The differentiallyexpressed genes were indicated by red dots (up-regulation) and green dots (down-regulation).Genes that are not differentially expressed are represented by blue dots差異基因聚類分析結(jié)果表明，E2F2 與 O1P1 兩實(shí)驗(yàn)組的差異基因表達(dá)譜相近，而 G2H2 與 L1M1 兩實(shí)驗(yàn)組的差異基因表達(dá)譜相近（圖 3-4）。

【參考文獻(xiàn)】：
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