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家禽屠宰場(chǎng)微生物分布特征及大腸桿菌耐藥性評(píng)估與ERIC-PCR分型研究

發(fā)布時(shí)間:2020-11-17 15:13
   隨著抗生素的濫用,作為危害嚴(yán)重食源性致病菌之一的大腸桿菌,其耐藥性不斷增強(qiáng),多重耐藥譜逐步變寬。肉雞作為大腸桿菌傳播的主要載體,在屠宰加工過(guò)程中容易通過(guò)食物鏈傳到人體,探究家禽屠宰場(chǎng)加工生產(chǎn)鏈中大腸桿菌的污染狀況,追蹤大腸桿菌污染的主要環(huán)節(jié)顯得尤為重要。本研究以浙江省某大型家禽屠宰場(chǎng)為采樣點(diǎn),檢測(cè)空氣沉降微生物的污染指標(biāo),評(píng)估屠宰場(chǎng)不同區(qū)域的微生物污染水平,以分離獲得的大腸桿菌為主要研究對(duì)象,檢測(cè)毒力基因并評(píng)估其耐藥性,通過(guò)ERIC-PCR分型探究分離株的親緣關(guān)系。(1)本實(shí)驗(yàn)取屠宰場(chǎng)廠(chǎng)房外部和內(nèi)部空氣沉降微生物,檢測(cè)其污染指標(biāo),并通過(guò)16S rRNA V3-V4的Illumina高通量測(cè)序方法分析其菌群結(jié)構(gòu)多樣性。結(jié)果顯示屠宰后八個(gè)車(chē)間的菌落總數(shù)、腸桿菌科、霉菌和酵母數(shù)量均有所增加,宰殺瀝血間菌落總數(shù)達(dá)到最高達(dá)到1100 cfu/皿,浸燙脫羽間腸桿菌科數(shù)達(dá)到最高1500cfu/皿,宰殺瀝血間霉菌、酵母數(shù)量分別最高達(dá)到175 cfu/皿、50cfu/皿。比較屠宰場(chǎng)廠(chǎng)房?jī)?nèi)外部的空氣沉降細(xì)菌菌群結(jié)構(gòu),從門(mén)的水平上來(lái)看,屠宰場(chǎng)廠(chǎng)內(nèi)和廠(chǎng)外優(yōu)勢(shì)門(mén)相同,均為厚壁菌門(mén)(Firmicute)、放線(xiàn)菌門(mén)(Actinobacteria)和變形菌門(mén)(Proteobacteria)。但從屬的水平上屠宰場(chǎng)廠(chǎng)房外和屠宰場(chǎng)廠(chǎng)內(nèi)優(yōu)勢(shì)屬幾乎都不相同,兩者存在不同屬類(lèi)別的細(xì)菌污染。屠宰場(chǎng)廠(chǎng)房?jī)?nèi)空氣中主要優(yōu)勢(shì)屬葡萄球菌屬(Staphylococcus),埃希氏菌屬(Escherichia),假單胞菌屬(Pseudomonas),而屠宰場(chǎng)廠(chǎng)房外空氣中主要優(yōu)勢(shì)屬是芽孢桿菌屬(Bacillus),(Phycicoccus),考克氏菌屬(Kocuria)。(2)本實(shí)驗(yàn)取屠宰場(chǎng)的存在水體,以及用無(wú)菌紗布擦拭各區(qū)域的地面和器械表面采集微生物進(jìn)行培養(yǎng)后,通過(guò)16S rRNA V3-V4的Illumina高通量測(cè)序方法分析其菌群結(jié)構(gòu)多樣性,并用PCR對(duì)細(xì)菌的9大類(lèi)24種耐藥基因進(jìn)行檢測(cè)。結(jié)果表明,屠宰場(chǎng)不同區(qū)域水體、地面和屠宰器械表面微生物均以變形菌門(mén)(Proteobacteria)、厚壁菌門(mén)(Firmicutes)和放線(xiàn)菌門(mén)(Actinobacteria)為主,其相對(duì)豐度分別為45.18%~87.74%、0.09%~33.46%、3.34%~28.09%;優(yōu)勢(shì)菌屬為不動(dòng)桿菌屬(Acinetobacter)、鏈球菌屬(Streptococcus)、嗜冷桿菌屬(Psychrobacter)、水棲菌屬(Enhydrobacter)、皮生球菌屬(Dermacoccus)、假單胞菌屬(Pseudomonas)、黃桿菌屬(Flavobacterium)、乳球菌屬(Tetragenococcus),金黃桿菌屬(Chryseobacterium)和弓形桿菌屬(Arcobacter),約占總類(lèi)群40%。各樣品中共檢測(cè)到21種耐藥基因,其中sulⅠ、sulⅡ、qnrS、blaTEM和aadA1的檢出率為100%,floR、tetA和ereA的檢出率為88.9%以上。(3)本實(shí)驗(yàn)從收集的屠宰場(chǎng)空氣沉降微生物、存在水體、地面、器械表面和冷鮮雞共240個(gè)樣品中分離大腸桿菌,檢測(cè)大腸桿菌的毒力基因并評(píng)估其耐藥性。結(jié)果顯示在預(yù)冷間的預(yù)冷水、外界的干凈屠宰用水、包裝間和冷藏間的空氣中未檢出大腸桿菌,但在其他區(qū)域均有檢測(cè)出大腸桿菌。大腸桿菌耐藥基因檢測(cè)結(jié)果表明,來(lái)源于冷鮮雞表面ESBL型大腸桿菌檢出率最高,對(duì)單環(huán)β內(nèi)酰胺類(lèi)的氨芐西林(62.0%)、磺胺類(lèi)的復(fù)方新諾明(55.4%)耐藥最明顯,多重耐藥菌株多達(dá)33株(35.9%),最多耐7種類(lèi)型的抗生素;除了青霉素類(lèi)基因(mecC)和多粘菌素類(lèi)基因(mcr-1)未檢出,耐藥基因pmrA(92.4%)、blaTEM(78.3%)和qnrS(53.3%)檢出率較高。此外,毒力基因檢測(cè)結(jié)果顯示腸毒素性大腸桿菌(ETEC)毒力基因est檢出率最高,高達(dá)31.5%?諝鈦(lái)源的大腸桿菌毒力基因檢出率種類(lèi)最多,檢測(cè)出stx、est、elt和aggR這四種毒力基因。(4)本實(shí)驗(yàn)對(duì)分離獲得的92株大腸桿菌進(jìn)行ERIC-PCR分型分析,結(jié)果顯示在以相似系數(shù)0.80的水平上,不同來(lái)源的家禽屠宰場(chǎng)大腸桿菌分離株可以分型為11種菌型(A~H),其中E型有32株,為優(yōu)勢(shì)菌型,來(lái)源包括雞肛門(mén)拭子、掛禽間冷鮮雞、凈膛間掛鉤紗布和預(yù)冷間空氣等不同環(huán)節(jié)的樣品,由此可見(jiàn)同一屠宰場(chǎng)的空氣、水體、器械、地面和冷鮮雞相互之間存在著大腸桿菌的交叉污染。
【學(xué)位單位】:中國(guó)計(jì)量大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類(lèi)】:S852.6
【部分圖文】:

路線(xiàn)圖,研究技術(shù),路線(xiàn),技術(shù)路線(xiàn)


研究技術(shù)路線(xiàn)

流程圖,屠宰加工,流程


掛禽間宰殺瀝血間浸燙脫羽間凈膛間2. 1 材料與方法2.1.1 實(shí)驗(yàn)儀器和試劑主要儀器如下表 2-1。表 2. 1 主要儀器Table 2.1 Main equipment儀器名稱(chēng) 生產(chǎn)廠(chǎng)家恒溫培養(yǎng)箱、烘箱 上海一恒科學(xué)儀器有限公司天平 北京賽多利斯天平有限公司主要試劑:平板計(jì)數(shù)瓊脂(PCA)培養(yǎng)基、孟加拉紅培養(yǎng)基、麥康凱培養(yǎng)基均由杭州微生物試劑有限公司提供。2.1.2 樣本的采集2.1.2.1 屠宰加工流程

屠宰場(chǎng),豐度,內(nèi)臟,預(yù)冷


16Figure 2.7 The top 10 phylum (A) and genus (B) of each sample in the external air ofslaughterhouse:BH,屠宰前掛禽間;BS,屠宰前宰殺瀝血間;BD,屠宰前浸燙脫羽間;BE,屠宰前;BPr,屠宰前預(yù)冷間;BPa,屠宰前包裝間;BRe,屠宰前冷藏間;BV,屠宰前內(nèi)臟間;宰前屠宰場(chǎng)廠(chǎng)房外四周;AH,屠宰后掛禽間;AS,屠宰后宰殺瀝血間;AD,屠宰后浸間;AE,屠宰后凈膛間;APr,屠宰后預(yù)冷間;APa,屠宰后包裝間;ARe,屠宰后冷,屠宰后內(nèi)臟間;AO,屠宰后屠宰場(chǎng)廠(chǎng)房外四周。te:BH,hanging district before slaughter;BS,slitting and blood draining district before slaug,scalding and dehairng district before slaughter;BE,eviscerating district before slaughter;-cooling district before slaughter;BPa,Packing district before slaughter;BRe,Refrigerated dfore slaughter;BV,Visceral district before slaughter;BO,around the factory before slau,hanging district after slaughter;AS,slitting and blood draining district after slaughter;lding and dehairng district after slaughte;AE,eviscerating district after slaughter;APr,Pre-ctrict after slaughter;APa,Packing district after slaughter;ARe,Refrigerated district after slaug,Visceral district after slaughter;AO,outside the factory after slaughter結(jié)構(gòu)
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