捻轉(zhuǎn)血矛線蟲丙硫咪唑耐藥相關(guān)基因篩選及其分子調(diào)控機(jī)制初探
【學(xué)位單位】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類】:S858.27
【部分圖文】:
Fig.邋1邋Life邋cycle邋of邋Haemonchus邋contortus逡逑矛線蟲的流行逡逑線蟲在我國(guó)流行較廣泛,額葉勒德格等(2018)通過化道線蟲感染情況進(jìn)行流行病學(xué)調(diào)查,結(jié)果顯示,該十分普遍,感染率達(dá)到84.3%%孔令杰(2015)通蟲流行病學(xué)調(diào)查,發(fā)現(xiàn)該地區(qū)捻轉(zhuǎn)血矛線蟲感染率較(2018)通過對(duì)湖北省部分地區(qū)山羊重要寄生蠕蟲轉(zhuǎn)血矛線蟲感染率最高,且為優(yōu)勢(shì)蟲種[9]。由于該病流行病學(xué)調(diào)查中捻轉(zhuǎn)血矛線蟲感染情況有明顯差異性,原因的說法不一[10]。春季萬物復(fù)蘇,溫度適宜,感染宿主進(jìn)食時(shí)經(jīng)口感染,導(dǎo)致該病的爆發(fā);捻轉(zhuǎn)血矛線的重要原因之一,大量的蟲體在宿主體內(nèi)停滯發(fā)育,°C死亡,待春季時(shí)期,大量的滯育期蟲體發(fā)育為成蟲,致“春潮”現(xiàn)象[|1]。逡逑
質(zhì)內(nèi)游離態(tài)微管蛋白的主要形式,同時(shí)也是微管組裝的基本單位,在機(jī)體的正常逡逑活動(dòng)中起到重要的作用,如參與細(xì)胞內(nèi)物質(zhì)運(yùn)輸、維持細(xì)胞形態(tài)及輔助完成染色逡逑體運(yùn)動(dòng)等丙硫咪唑可以在寄生蟲微管蛋白聚合之前與微管蛋白結(jié)合(見圖2),逡逑阻止微管蛋白組裝,引起蛋白代謝障礙,從而終止細(xì)胞周期,導(dǎo)致蟲體死亡[471。逡逑研究發(fā)現(xiàn),捻轉(zhuǎn)血矛線蟲對(duì)丙硫咪唑耐藥性與P-微管蛋白同種I型基因的單逡逑核苷酸多態(tài)性有關(guān)。Kwa邋(1994)等w在研究捻轉(zhuǎn)血矛線蟲耐藥株時(shí),首次發(fā)現(xiàn)逡逑了P-微管蛋白同種I型基因的單核苷酸多態(tài)性(single邋nucleotide邋polymorphisms,逡逑SNP),由苯丙氨酸變成酪氨酸,即F200Y邋(TTC至TAC)。Drogemuller邋(2004)逡逑等[491發(fā)現(xiàn)了耐藥株P-微管蛋白同種I型基因在丨67位點(diǎn)的SNP,即F167Y邋(TTC至逡逑TAC)。Ghisi邋(2007)等網(wǎng)報(bào)道了耐藥蟲株P-微管蛋白同種I型基因在198位點(diǎn)的逡逑SNP,即E198A邋(GAA至GCA)。F200Y是丙硫咪唑產(chǎn)生耐藥性的主要因素,呈逡逑全球性分布
在cDNA兩端加上測(cè)序接頭,利用高通量測(cè)序儀進(jìn)行測(cè)序,直至獲得逡逑足夠的序列,所得序列比對(duì)到參考基因組(有參轉(zhuǎn)錄組)或進(jìn)行從頭組裝(de邋novo逡逑assembly邋(無參轉(zhuǎn)錄組)形成全基因組范圍內(nèi)的轉(zhuǎn)錄譜(見圖3)。所謂有參轉(zhuǎn)錄逡逑組是指在有參考基因組的分析中,基于己知物種的基因組信息,把測(cè)序得到的逡逑reads比對(duì)到參考基因組上,然后計(jì)算出己知注釋基因的表達(dá)量,或?qū)Ω信d趣的逡逑一類基因在不同組織或不同狀態(tài)下的表達(dá)量進(jìn)行研宄。另外,通過轉(zhuǎn)錄組測(cè)序可逡逑以發(fā)現(xiàn)一些新的轉(zhuǎn)錄本,鑒定新的基因和新的IncRNA,也可以通過與參考基因逡逑組進(jìn)行比對(duì),進(jìn)而發(fā)現(xiàn)SNP位點(diǎn)及可變剪切位點(diǎn)[73】。逡逑RNA片段化處砰逡逑|邋反轉(zhuǎn)求介成cDNA文片逡逑|邋DN邋A'闡序接頭連接逡逑、邐'公}、…逡逑I邋K’R擴(kuò)增文庫逡逑T邐??邐逡逑-'mum逡逑'、、邐'邋^mam逡逑|深度M序逡逑mmm逡逑WUKBSUS邋9WMSKK&S9邋9HRS8M^t邋88Mmm逡逑KNAR?列信總逡逑圖3邋RNA-Seq實(shí)驗(yàn)流程[74]逡逑Fig.3邋RNA-Seq邋experimental邋procedure逡逑隨著測(cè)序技術(shù)在生命科學(xué)領(lǐng)域的發(fā)展,傳統(tǒng)的Sanger法測(cè)序遠(yuǎn)遠(yuǎn)不能滿足新逡逑型分子生物學(xué)技術(shù)對(duì)測(cè)序技術(shù)的的需要,越來越多的功能和表型之間的內(nèi)在聯(lián)系逡逑有待通過“組學(xué)”測(cè)序技術(shù)去揭示。與此同時(shí)
【參考文獻(xiàn)】
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