牛ANGPTL5基因遺傳多態(tài)性分析及對牛乳腺上皮和前體脂肪細胞甘油三脂含量的影響
【學位單位】:吉林大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2019
【中圖分類】:S823
【部分圖文】:
圖 1.1 血液基因組 DNA 瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果注:1~6.中國荷斯坦奶牛血液基因組 DNAThe agarose electrophoresis result of bovine blood genNote:1~6. The genomic DNA of Chinese Holstein cow blood增結(jié)果取基因組 DNA 為模板,用設(shè)計的 6 對引物進行擴增2、3、4、6 泳道 PCR 產(chǎn)物長度與預期相符,條帶均 泳道 PCR 產(chǎn)物有兩條帶,引物特異性不好,產(chǎn)生非續(xù)膠回收測序,結(jié)果見圖 1.2。
PTL5 基因中國荷斯坦奶�;斐啬0� PCR 產(chǎn)物瓊脂糖注:M.DL2000Marker, 1~6.PCR 產(chǎn)物。he result of PCR amplification of ANGPTL5 gene in Chindairy cowsNote: M. DL2000 marker, 1~6. Production of PCR.斯坦奶牛群體中 ANGPLT5 基因 SNPs 位點篩查 PCR 擴增后送金唯智測序,通過分析混池測序結(jié)果R 產(chǎn)物中存在一處明顯的雙峰,是 I1-1776 處的 G>A 荷斯坦奶牛群體中,ANGPTL5 基因在這兩個位點具果見圖 1.3,引物 6 擴增的 PCR 產(chǎn)物中存在兩處明顯 處的 A>C 顛換和 I5-2757 處的 T>C 轉(zhuǎn)換,由此可得,和 SNPs 位點篩查測序,在中國荷斯坦奶牛群體中針對個 SNPs 位點。
圖 1.3 中國荷斯坦牛 ANGPTL5 基因混池 PCR 產(chǎn)物測序結(jié)果注:A. I1-1776 G>A 位點測序圖,B. I5-2743A>C 位點測序圖,C .I5-2757 T>C 位點測序圖。Fig 1.3 The sequencing results of ANGPTL5 gene for Chinese Holstein dairy cowssamplesNote: A. I1-1776 G>A sequencing result, B.I5-2743 A>C locus sequencing result, C.I5-2757 T>Clocus sequencing result.基于在混池測序結(jié)果中發(fā)現(xiàn),在引物 E6 擴增的 PCR 產(chǎn)物中存在兩個 SNPs位點,而且片段大小適中,能夠通過一個測序反應同時對兩個位點進行檢測,因此選用直接測序的方法來檢測該中國荷斯坦奶牛群體的 SNP。進行該群體單個樣品 PCR 擴增后,將部分產(chǎn)物進行瓊脂糖凝膠電泳實驗,選取電泳條帶清晰均一,無二聚體和抹帶的PCR產(chǎn)物送測序,共對103個樣本進行測序。最終,I5-2743A>C位點獲得 96 個有效結(jié)果,I5-2757T>C 位點也獲得了 96 個有效結(jié)果。對引物 2擴增的PCR產(chǎn)物也采取直接測序的方法,共對116個樣本進行測序,最終,I1-1776G>A 位點獲得 113 個有效結(jié)果。各 SNPs 不同基因型部分測序結(jié)果如圖 1.4 所示。
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本文編號:2816652
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