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牛ANGPTL5基因遺傳多態(tài)性分析及對(duì)牛乳腺上皮和前體脂肪細(xì)胞甘油三脂含量的影響

發(fā)布時(shí)間:2020-09-11 12:06
   血管生成素樣蛋白5(ANGPTL5)為ANGPTLs家族成員,主要表達(dá)于心臟、脂肪組織。目前,研究顯示ANGPTL5參與體內(nèi)血管生成,同時(shí)其在調(diào)節(jié)脂質(zhì)合成與代謝方面也發(fā)揮著重要作用。本課題組前期研究結(jié)果顯示,在日本和牛內(nèi)臟脂肪和皮下脂肪中ANGPTL5表達(dá)水平存在顯著差異,表明ANGPTL5基因很可能參與并影響牛機(jī)體內(nèi)脂肪沉積。因此,本試驗(yàn)以ANGPTL5作為影響牛脂肪代謝的候選基因,在中國(guó)西門塔爾牛和中國(guó)荷斯坦奶牛群體中對(duì)ANGPTL5基因的遺傳多態(tài)性進(jìn)行檢測(cè),并統(tǒng)計(jì)分析ANGPTL5基因的SNPs位點(diǎn)與乳品質(zhì)性狀和肉品質(zhì)性狀的相關(guān)性。為進(jìn)一步研究ANGPTL5基因?qū)εV敬x的影響,通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR擴(kuò)增,檢測(cè)了牛脂肪組織、肌肉組織和各器官以及前體脂肪細(xì)胞中的表達(dá)水平。在細(xì)胞水平上,將構(gòu)建的p BI-CMV3-ANGPTL5基因過(guò)表達(dá)載體和sh RNA干擾載體分別轉(zhuǎn)染牛乳腺上皮和前體脂肪細(xì)胞,檢測(cè)ANGPTL5基因?qū)?xì)胞內(nèi)甘油三酯含量的影響。實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,在中國(guó)荷斯坦奶牛群體中共篩查到三個(gè)SNPs位點(diǎn),分別為I1-1776GA位點(diǎn)、I5-2743AC位點(diǎn)和I5-2757TC位點(diǎn)。其中,I5-2743AC和I5-2757TC位點(diǎn)與中國(guó)荷斯坦牛產(chǎn)奶和乳品質(zhì)性狀沒(méi)有相關(guān)關(guān)系;I1-1776GA位點(diǎn)與中國(guó)荷斯坦牛尿素氮含量顯著相關(guān)(p0.05)。在中國(guó)西門塔爾肉牛群體中,檢測(cè)到了四個(gè)SNPs位點(diǎn),分別為I1-1776GA、I2-77TC、I2-1505AT和I2-1391CT位點(diǎn)。其中,I1-1776GA位點(diǎn)與中國(guó)西門塔爾牛前蹄重、后蹄重、肝臟重、脾臟重、背膘厚呈顯著相關(guān)關(guān)系(p0.05);I2-1391CT位點(diǎn)與中國(guó)西門塔爾牛前蹄重、后蹄重、肝臟重、脾臟重、背膘厚呈顯著相關(guān)關(guān)系(p0.05);I2-1391CT和I2-1505AT位點(diǎn)與中國(guó)西門塔爾牛背膘厚呈顯著相關(guān)關(guān)系(p0.05)。ANGPTL5基因在心臟中的表達(dá)水平最高,肝臟中的表達(dá)水平最低。前體脂肪細(xì)胞中ANGPTL5表達(dá)水平,顯著低于乳腺上皮細(xì)胞的表達(dá)水平,皮下脂肪和內(nèi)臟脂肪中的基因表達(dá)水平顯著高于前體脂肪細(xì)胞。在過(guò)表達(dá)牛ANGPTL5基因的牛前體脂肪細(xì)胞和乳腺上皮細(xì)胞中甘油三酯的含量顯著升高(p0.05),而在ANGPTL5基因沉默的牛前體脂肪細(xì)胞中甘油三酯的含量顯著下降(p0.05),ANGPTL5基因沉默的牛乳腺上皮細(xì)胞中甘油三酯的含量顯著升高(p0.05)。綜上所述,本試驗(yàn)結(jié)果表明ANGPTL5基因內(nèi)含子區(qū)域的SNPs位點(diǎn)與牛肉質(zhì)、胴體和乳品質(zhì)性狀均存在顯著相關(guān)性;ANGPTL5基因表達(dá)促進(jìn)細(xì)胞內(nèi)甘油三酯合成。以上研究結(jié)果為解析ANGPTL5對(duì)脂肪代謝的功能提供研究基礎(chǔ),也為牛乳品質(zhì)和肉品質(zhì)改良以及分子育種提供功能基因和遺傳標(biāo)記。
【學(xué)位單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類】:S823
【部分圖文】:

瓊脂糖凝膠電泳,基因組,血液,中國(guó)荷斯坦奶牛


圖 1.1 血液基因組 DNA 瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果注:1~6.中國(guó)荷斯坦奶牛血液基因組 DNAThe agarose electrophoresis result of bovine blood genNote:1~6. The genomic DNA of Chinese Holstein cow blood增結(jié)果取基因組 DNA 為模板,用設(shè)計(jì)的 6 對(duì)引物進(jìn)行擴(kuò)增2、3、4、6 泳道 PCR 產(chǎn)物長(zhǎng)度與預(yù)期相符,條帶均 泳道 PCR 產(chǎn)物有兩條帶,引物特異性不好,產(chǎn)生非續(xù)膠回收測(cè)序,結(jié)果見(jiàn)圖 1.2。

荷斯坦奶牛,瓊脂糖凝膠電泳,模板,位點(diǎn)


PTL5 基因中國(guó)荷斯坦奶;斐啬0 PCR 產(chǎn)物瓊脂糖注:M.DL2000Marker, 1~6.PCR 產(chǎn)物。he result of PCR amplification of ANGPTL5 gene in Chindairy cowsNote: M. DL2000 marker, 1~6. Production of PCR.斯坦奶牛群體中 ANGPLT5 基因 SNPs 位點(diǎn)篩查 PCR 擴(kuò)增后送金唯智測(cè)序,通過(guò)分析混池測(cè)序結(jié)果R 產(chǎn)物中存在一處明顯的雙峰,是 I1-1776 處的 G>A 荷斯坦奶牛群體中,ANGPTL5 基因在這兩個(gè)位點(diǎn)具果見(jiàn)圖 1.3,引物 6 擴(kuò)增的 PCR 產(chǎn)物中存在兩處明顯 處的 A>C 顛換和 I5-2757 處的 T>C 轉(zhuǎn)換,由此可得,和 SNPs 位點(diǎn)篩查測(cè)序,在中國(guó)荷斯坦奶牛群體中針對(duì)個(gè) SNPs 位點(diǎn)。

中國(guó)荷斯坦牛,測(cè)序,基因,位點(diǎn)


圖 1.3 中國(guó)荷斯坦牛 ANGPTL5 基因混池 PCR 產(chǎn)物測(cè)序結(jié)果注:A. I1-1776 G>A 位點(diǎn)測(cè)序圖,B. I5-2743A>C 位點(diǎn)測(cè)序圖,C .I5-2757 T>C 位點(diǎn)測(cè)序圖。Fig 1.3 The sequencing results of ANGPTL5 gene for Chinese Holstein dairy cowssamplesNote: A. I1-1776 G>A sequencing result, B.I5-2743 A>C locus sequencing result, C.I5-2757 T>Clocus sequencing result.基于在混池測(cè)序結(jié)果中發(fā)現(xiàn),在引物 E6 擴(kuò)增的 PCR 產(chǎn)物中存在兩個(gè) SNPs位點(diǎn),而且片段大小適中,能夠通過(guò)一個(gè)測(cè)序反應(yīng)同時(shí)對(duì)兩個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行檢測(cè),因此選用直接測(cè)序的方法來(lái)檢測(cè)該中國(guó)荷斯坦奶牛群體的 SNP。進(jìn)行該群體單個(gè)樣品 PCR 擴(kuò)增后,將部分產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳實(shí)驗(yàn),選取電泳條帶清晰均一,無(wú)二聚體和抹帶的PCR產(chǎn)物送測(cè)序,共對(duì)103個(gè)樣本進(jìn)行測(cè)序。最終,I5-2743A>C位點(diǎn)獲得 96 個(gè)有效結(jié)果,I5-2757T>C 位點(diǎn)也獲得了 96 個(gè)有效結(jié)果。對(duì)引物 2擴(kuò)增的PCR產(chǎn)物也采取直接測(cè)序的方法,共對(duì)116個(gè)樣本進(jìn)行測(cè)序,最終,I1-1776G>A 位點(diǎn)獲得 113 個(gè)有效結(jié)果。各 SNPs 不同基因型部分測(cè)序結(jié)果如圖 1.4 所示。

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