牛ANGPTL5基因遺傳多態(tài)性分析及對(duì)牛乳腺上皮和前體脂肪細(xì)胞甘油三脂含量的影響
【學(xué)位單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類】:S823
【部分圖文】:
圖 1.1 血液基因組 DNA 瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果注:1~6.中國(guó)荷斯坦奶牛血液基因組 DNAThe agarose electrophoresis result of bovine blood genNote:1~6. The genomic DNA of Chinese Holstein cow blood增結(jié)果取基因組 DNA 為模板,用設(shè)計(jì)的 6 對(duì)引物進(jìn)行擴(kuò)增2、3、4、6 泳道 PCR 產(chǎn)物長(zhǎng)度與預(yù)期相符,條帶均 泳道 PCR 產(chǎn)物有兩條帶,引物特異性不好,產(chǎn)生非續(xù)膠回收測(cè)序,結(jié)果見(jiàn)圖 1.2。
PTL5 基因中國(guó)荷斯坦奶;斐啬0 PCR 產(chǎn)物瓊脂糖注:M.DL2000Marker, 1~6.PCR 產(chǎn)物。he result of PCR amplification of ANGPTL5 gene in Chindairy cowsNote: M. DL2000 marker, 1~6. Production of PCR.斯坦奶牛群體中 ANGPLT5 基因 SNPs 位點(diǎn)篩查 PCR 擴(kuò)增后送金唯智測(cè)序,通過(guò)分析混池測(cè)序結(jié)果R 產(chǎn)物中存在一處明顯的雙峰,是 I1-1776 處的 G>A 荷斯坦奶牛群體中,ANGPTL5 基因在這兩個(gè)位點(diǎn)具果見(jiàn)圖 1.3,引物 6 擴(kuò)增的 PCR 產(chǎn)物中存在兩處明顯 處的 A>C 顛換和 I5-2757 處的 T>C 轉(zhuǎn)換,由此可得,和 SNPs 位點(diǎn)篩查測(cè)序,在中國(guó)荷斯坦奶牛群體中針對(duì)個(gè) SNPs 位點(diǎn)。
圖 1.3 中國(guó)荷斯坦牛 ANGPTL5 基因混池 PCR 產(chǎn)物測(cè)序結(jié)果注:A. I1-1776 G>A 位點(diǎn)測(cè)序圖,B. I5-2743A>C 位點(diǎn)測(cè)序圖,C .I5-2757 T>C 位點(diǎn)測(cè)序圖。Fig 1.3 The sequencing results of ANGPTL5 gene for Chinese Holstein dairy cowssamplesNote: A. I1-1776 G>A sequencing result, B.I5-2743 A>C locus sequencing result, C.I5-2757 T>Clocus sequencing result.基于在混池測(cè)序結(jié)果中發(fā)現(xiàn),在引物 E6 擴(kuò)增的 PCR 產(chǎn)物中存在兩個(gè) SNPs位點(diǎn),而且片段大小適中,能夠通過(guò)一個(gè)測(cè)序反應(yīng)同時(shí)對(duì)兩個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行檢測(cè),因此選用直接測(cè)序的方法來(lái)檢測(cè)該中國(guó)荷斯坦奶牛群體的 SNP。進(jìn)行該群體單個(gè)樣品 PCR 擴(kuò)增后,將部分產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳實(shí)驗(yàn),選取電泳條帶清晰均一,無(wú)二聚體和抹帶的PCR產(chǎn)物送測(cè)序,共對(duì)103個(gè)樣本進(jìn)行測(cè)序。最終,I5-2743A>C位點(diǎn)獲得 96 個(gè)有效結(jié)果,I5-2757T>C 位點(diǎn)也獲得了 96 個(gè)有效結(jié)果。對(duì)引物 2擴(kuò)增的PCR產(chǎn)物也采取直接測(cè)序的方法,共對(duì)116個(gè)樣本進(jìn)行測(cè)序,最終,I1-1776G>A 位點(diǎn)獲得 113 個(gè)有效結(jié)果。各 SNPs 不同基因型部分測(cè)序結(jié)果如圖 1.4 所示。
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