【摘要】：DNA甲基化在基因表達、X染色體的失活、細胞分化、染色質(zhì)結(jié)構(gòu)維持和胚胎發(fā)育中起著重要作用,DNA甲基化在卵巢活動中具有重要調(diào)控作用。本研究以關(guān)中奶山羊為研究對象,采用全基因組亞硫酸氫鹽測序(WGBS)和生物學信息分析方法,繪制奶山羊卵巢在發(fā)情期(ES)和發(fā)情間期(DS)全基因組DNA甲基化圖譜,經(jīng)過對比分析,得出以下結(jié)果:1.在ES和DS的卵巢中,發(fā)現(xiàn)了明顯的全基因組DNA甲基化模式。與DS組相比,ES組共有26910個區(qū)域的甲基化上調(diào),21453個區(qū)域的甲基化下調(diào)(P≤0.05,甲基化比例倍數(shù)變化≥2)。2.差異甲基化區(qū)域分析顯示,基因體區(qū)甲基化程度較低,上游與基因體連接區(qū)域甲基化程度較高。ES樣品中STAR、FGF2、FGF12、BMP5、SMAD6基因的甲基化率低于DS樣品組(P≤0.05,甲基化率倍數(shù)變化≥2)。與之相反,ES樣品組中EGFR、TGFBR2、IGF2BP1和MMD2基因的甲基化率均高于DS樣品組。3.在GnRH信號通路(KO04912)、卵巢類固醇發(fā)生通路(KO04913)、雌激素信號通路(KO04915)、催產(chǎn)素信號通路(KO04921)、胰島素分泌通路(KO04911)和MAPK信號通路(KO04010)中發(fā)現(xiàn)223個差異甲基化的基因。本研究對奶山羊發(fā)情期(ES)和發(fā)情間期(DS)卵巢高分辨率的DNA甲基化進行大規(guī)模比較,研究結(jié)果表明,NR5A2、STAR、FGF2和BMP5基因可能在調(diào)控奶山羊的發(fā)情行為中具有潛在的應(yīng)用價值。
【學位授予單位】：西北農(nóng)林科技大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2019
【分類號】：S827
【圖文】：

圖 1-1 卵巢的發(fā)育以及卵泡的形成Figure 1-1 Ovarian development and follicular formation（Smith , et al. 2014） 卵泡的功能泡的生長和退化、排卵、成熟卵泡細胞向黃體細胞的分化以及卵巢中黃后的消亡在生殖周期的短時間內(nèi)發(fā)生，并在女性生殖生命期間反ride , et al. 2012）。具體的卵泡形成圖見圖 1-1。卵巢的主要功能是促進胎干細胞中大約有 14%~28%在胎兒時期發(fā)育成了雌性生殖細胞。卵

西北農(nóng)林科技大學碩士學位論文進而會導致使新合成的 DNA 鏈未被甲基化，此過程被稱為 DNA 被動去甲基化；研究證明，被動去甲基化過程與 DNA 半保留復制存在聯(lián)系。有試驗已經(jīng)表明，存在著一種甲基結(jié)合蛋白 MBD2，具有去甲基能力，因此可以認為 MBD2 就是一種去甲基化的酶（Lee , et al. 2001, Sansom , et al. 2003）。依據(jù)真核生物 DNA 甲基化轉(zhuǎn)移酶的功能和序列的同源性差異，可將其分為四類：第一類，維持 DNA 甲基化轉(zhuǎn)移酶（DNMT1 或維持甲基化酶）；第二類，甲基化轉(zhuǎn)移酶 2（DNMT2）；第三類，從頭甲基化酶（DNMT3）；第四類，CMT（張永宏，2014）。如圖 1-2 所示即為 DNA 甲基化轉(zhuǎn)移酶家族成員的結(jié)構(gòu)示意圖（張永宏，2014）。

西北農(nóng)林科技大學碩士學位論文如圖 1-3 所示的正常細胞的完美表觀遺傳平衡（Rideout , et al. 1990）。癌細了復雜的變化。觀察到的表觀遺傳變異可概括為：(1)CpG 島啟動子高甲基化和去乙�；瘜σ职┗虻霓D(zhuǎn)錄沉默；(2)全基因組低甲基化；(3)印跡(LOI)事件的丟)表觀遺傳缺乏對基因組內(nèi)寄生蟲的抑制；(5)染色質(zhì)相關(guān)基因的遺傳缺陷的出現(xiàn)都是獨特但相互關(guān)聯(lián)的特征（Esteller M and Herman J G，2002）。

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