【摘要】：豬的四肢骨骼長度不僅與背膘厚呈負(fù)相關(guān),還決定了后腿和眼肌的產(chǎn)肉量。如果四肢骨骼異常生長,還將導(dǎo)致肢蹄結(jié)構(gòu)性軟弱。另外,豬是研究人類復(fù)雜性狀的重要的大型模式動(dòng)物。對(duì)豬四肢骨骼長度的遺傳解析,將有利于我們對(duì)人類身高遺傳基礎(chǔ)的了解。因此,豬的四肢骨骼長度是一個(gè)重要的經(jīng)濟(jì)性狀。直到現(xiàn)在,與豬四肢骨骼長度相關(guān)的研究報(bào)道較少,對(duì)其的遺傳機(jī)制知之甚少。本研究通過全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)及其薈萃分析,在四個(gè)實(shí)驗(yàn)豬群中鑒別控制四肢骨骼長度的遺傳位點(diǎn)。本研究利用314頭萊蕪豬、331頭二花臉豬、434頭蘇太豬和925頭F2個(gè)體的肩胛骨、臂骨、前臂骨、股骨和尺骨5塊骨骼長度的表型數(shù)據(jù)以及它們60K芯片上62163個(gè)SNP的基因型,在這4個(gè)實(shí)驗(yàn)群體中進(jìn)行GWAS及GWAS薈萃分析。一共檢測(cè)到16個(gè)影響四肢骨骼長度的位點(diǎn),其中12個(gè)位點(diǎn)達(dá)到建議顯著水平,另外4個(gè)達(dá)到基因組顯著水平,并且有4個(gè)位點(diǎn)是首次檢測(cè)到。有2個(gè)位點(diǎn)的信號(hào)很強(qiáng),效應(yīng)很大,且與5塊骨骼長度都顯著關(guān)聯(lián)。一個(gè)位點(diǎn)在7號(hào)染色體上一個(gè)924-kb的連鎖不平衡框內(nèi),另一個(gè)在4號(hào)染色體的中部。高遷移率族蛋白A1基因(High Mobility Group AT-hook 1,HMGA1)和多形性腺瘤基因1(Pleiomorphic Adenoma Gene 1,PLAG1)分別位于這兩個(gè)區(qū)域內(nèi),且有研究報(bào)道這兩個(gè)基因與人類、牛等的身高關(guān)聯(lián),因此HMGA1和PLAG1基因是影響豬四肢骨骼長度的強(qiáng)候選基因,值得更為深入的研究。由于5個(gè)骨骼長度相互之間的相關(guān)性很強(qiáng),所以大部分位點(diǎn)與這5塊骨骼長度都關(guān)聯(lián),如7號(hào)染色體上的位點(diǎn)。但是也有一些位點(diǎn)只與一塊骨骼長度關(guān)聯(lián),例如2號(hào)染色體近端的位點(diǎn)只與肩胛骨長度相關(guān)聯(lián)。據(jù)我們所知,這是第一次對(duì)豬四肢骨骼長度的GWAS薈萃分析。結(jié)果顯示,相對(duì)單群體的GWAS,GWAS薈萃分析對(duì)于群體共有的位點(diǎn)有更高檢驗(yàn)效率。
【學(xué)位授予單位】：江西農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：S828

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2739883