【摘要】：豬的四肢骨骼長度不僅與背膘厚呈負相關(guān),還決定了后腿和眼肌的產(chǎn)肉量。如果四肢骨骼異常生長,還將導致肢蹄結(jié)構(gòu)性軟弱。另外,豬是研究人類復雜性狀的重要的大型模式動物。對豬四肢骨骼長度的遺傳解析,將有利于我們對人類身高遺傳基礎(chǔ)的了解。因此,豬的四肢骨骼長度是一個重要的經(jīng)濟性狀。直到現(xiàn)在,與豬四肢骨骼長度相關(guān)的研究報道較少,對其的遺傳機制知之甚少。本研究通過全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)及其薈萃分析,在四個實驗豬群中鑒別控制四肢骨骼長度的遺傳位點。本研究利用314頭萊蕪豬、331頭二花臉豬、434頭蘇太豬和925頭F2個體的肩胛骨、臂骨、前臂骨、股骨和尺骨5塊骨骼長度的表型數(shù)據(jù)以及它們60K芯片上62163個SNP的基因型,在這4個實驗群體中進行GWAS及GWAS薈萃分析。一共檢測到16個影響四肢骨骼長度的位點,其中12個位點達到建議顯著水平,另外4個達到基因組顯著水平,并且有4個位點是首次檢測到。有2個位點的信號很強,效應很大,且與5塊骨骼長度都顯著關(guān)聯(lián)。一個位點在7號染色體上一個924-kb的連鎖不平衡框內(nèi),另一個在4號染色體的中部。高遷移率族蛋白A1基因(High Mobility Group AT-hook 1,HMGA1)和多形性腺瘤基因1(Pleiomorphic Adenoma Gene 1,PLAG1)分別位于這兩個區(qū)域內(nèi),且有研究報道這兩個基因與人類、牛等的身高關(guān)聯(lián),因此HMGA1和PLAG1基因是影響豬四肢骨骼長度的強候選基因,值得更為深入的研究。由于5個骨骼長度相互之間的相關(guān)性很強,所以大部分位點與這5塊骨骼長度都關(guān)聯(lián),如7號染色體上的位點。但是也有一些位點只與一塊骨骼長度關(guān)聯(lián),例如2號染色體近端的位點只與肩胛骨長度相關(guān)聯(lián)。據(jù)我們所知,這是第一次對豬四肢骨骼長度的GWAS薈萃分析。結(jié)果顯示,相對單群體的GWAS,GWAS薈萃分析對于群體共有的位點有更高檢驗效率。
【學位授予單位】：江西農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2016
【分類號】：S828

【參考文獻】

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