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豬流行性腹瀉病毒陜西渭南株的遺傳變異

發(fā)布時間:2020-03-12 17:50
【摘要】:從陜西省渭南某規(guī);i場采集疑似豬流行性腹瀉(PED)仔豬病料進行病毒檢測,旨在從基因遺傳變異方面分析疾病發(fā)生的可能原因。通過RT-PCR從疑似仔豬20份小腸樣品中檢測到9份PED病毒陽性樣品,并擴增出PED病毒M、ORF3和S基因的部分序列。序列分析結果表明,與CV777疫苗株對比,樣品渭南(WN)株PEDV M基因高度保守,同源性為98.2%;ORF3基因存在11處堿基突變,同源性為98.2%;S基因突變較大,存在4個插入?yún)^(qū)域,分別是164~166、177~179、181~186和416~418nt,內分核心中和表位區(qū)(COE,499~638位氨基酸)存在9個氨基酸突變位點。遺傳分析顯示,WN株M基因與中國近期分離毒株親緣關系較近;ORF3基因與同處在G1群中的中國毒株親緣關系較近,而與CV777疫苗株親緣關系較遠;S基因與中國早期分離毒株及CV777疫苗株親緣性較遠,與當前的流行株親緣關系密切。這些結果表明,WN株與CV777疫苗株相比,有明顯的遺傳變異傾向,可能導致目前PEDV疫苗免疫效果下降,PED疫情大規(guī)模流行。

【相似文獻】

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