【摘要】：為了研究與灘羊羊毛纖維粗細(xì)及彎曲度和特定花穗構(gòu)成相關(guān)的差異蛋白,試驗(yàn)應(yīng)用同位素標(biāo)記相對(duì)和絕對(duì)定量(iTRAQ)蛋白質(zhì)組學(xué)方法,聯(lián)合多維液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜(LC-MS/MS)技術(shù)對(duì)灘羊、內(nèi)蒙古蘇尼特羊、中衛(wèi)山羊和新吉細(xì)毛羊的羊皮膚蛋白進(jìn)行鑒定和篩選,并應(yīng)用Proteome Discoverer 1.4軟件進(jìn)行定量分析,結(jié)合數(shù)據(jù)庫搜索,鑒定出差異蛋白;最后應(yīng)用生物信息學(xué)技術(shù)對(duì)差異蛋白進(jìn)行GO分析和Pathway分析。4種羊皮膚中共鑒定到1 161個(gè)蛋白,其中內(nèi)蒙古蘇尼特羊與灘羊比對(duì)發(fā)現(xiàn)30個(gè)差異蛋白,中衛(wèi)山羊與灘羊比對(duì)發(fā)現(xiàn)112個(gè)差異蛋白,新吉細(xì)毛羊與灘羊比對(duì)發(fā)現(xiàn)107個(gè)差異蛋白,對(duì)各比對(duì)組的皮膚差異蛋白進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)14-3-3蛋白σ亞型、KRT25、KRT34、KRT85、TCHH、KAP6和KAP11.1可能與灘羊羊毛纖維粗細(xì)及彎曲度和特定花穗形狀的形成有關(guān)。本研究可為灘羊優(yōu)質(zhì)二毛裘皮選育研究提供科學(xué)依據(jù)。
【圖文】：

分析。將各比對(duì)組的差異蛋白與上述數(shù)據(jù)庫中的蛋白序列進(jìn)行比對(duì)，根據(jù)相似性原理，具有相似序列的蛋白可能也具有相似的功能，將ＢＬＡＳＴ所得的同源蛋白的注釋信息轉(zhuǎn)嫁到４種羊皮膚的差異蛋白上，從而研究差異蛋白可能行使的主要生物學(xué)功能和參與的代謝或信號(hào)通路。２結(jié)果２．１ＳＤＳ－ＰＡＧＥ電泳用ＢＣＡ蛋白質(zhì)定量法對(duì)４種羊８份皮膚樣品進(jìn)行定量，其樣品上樣量為２０μｇ，經(jīng)ＳＤＳ－ＰＡＧＥ電泳分離后，發(fā)現(xiàn)其樣品蛋白質(zhì)條帶較為均一，平行度良好（圖１）。圖１４種羊樣品ＳＤＳ－ＰＡＧＥ電泳圖Ｆｉｇ．１ＴｈｅｓａｍｐｌｅＳＤＳ－ＰＡＧＥｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓｏｆｆｏｕｒｓｈｅｅｐｂｒｅｅｄｓ２．２蛋白質(zhì)鑒定結(jié)果及整體分布分析利用ｉＴＲＡＱ技術(shù)對(duì)脫鹽后的灘羊、中衛(wèi)山羊、內(nèi)蒙古蘇尼特羊和新吉細(xì)毛羊的皮膚樣品經(jīng)質(zhì)譜分析及Ｍａｓｃｏｔ查庫，最終鑒定到４９７３個(gè)肽段（ｐｅｐ－ｔｉｄｅ），，鑒定到的蛋白質(zhì)組（ｐｒｏｔｅｉｎｇｒｏｕｐ）有１１６１個(gè)。對(duì)鑒定到的１１６１個(gè)蛋白依據(jù)其質(zhì)量進(jìn)行統(tǒng)計(jì)，結(jié)果見圖２Ａ。由圖２Ａ可知，其大部分蛋白分子質(zhì)量在２０～８０ｋｕ之間。對(duì)４種羊８份皮膚樣品鑒定蛋白進(jìn)行主成分分析，結(jié)果見圖２Ｂ。由圖２Ｂ可知，同種羊皮膚鑒定蛋白有較好的重復(fù)性，不同種羊皮膚蛋白的主成分存在較為顯著的差異。２．３各組顯著性差異蛋白定量結(jié)果分析用內(nèi)蒙古蘇尼特（Ｎ）、中衛(wèi)山羊（Ｓ）和新吉細(xì)毛羊（Ｘ）分別與灘羊（Ｔ）的皮膚蛋白進(jìn)行差異蛋白分析，各組比較的差異蛋白數(shù)量統(tǒng)計(jì)結(jié)果見表２。由表２可知，內(nèi)蒙古蘇尼特羊與灘

圖４差異蛋白ＫＥＧＧ富集分析Ｆｉｇ．４ＫＥＧＧｅｎｒｉｃｈｍｅｎｔａｎａｌｙｓｉｓｏｆｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｐｒｏｔｅｉｎ
【作者單位】： 寧夏大學(xué)農(nóng)學(xué)院;寧夏農(nóng)林科學(xué)院;內(nèi)蒙古自治區(qū)農(nóng)牧業(yè)科學(xué)院;吉林省農(nóng)業(yè)科學(xué)院動(dòng)物營養(yǎng)所;
【基金】：寧夏農(nóng)業(yè)育種專項(xiàng)“灘羊品系選育”項(xiàng)目(2013NYYZ0402)
【分類號(hào)】：S826

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本文編號(hào)：2551772