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禽致病性大腸桿菌信號(hào)分子AI-2受體檢測(cè)方法建立及其靶蛋白鑒定

發(fā)布時(shí)間:2019-09-20 17:32
【摘要】:禽致病性大腸桿菌(Avian pathogenic Escherichia coli,APEC)可感染雞、鴨、火雞和其他禽類,使宿主出現(xiàn)氣囊炎、蜂窩組織炎、輸卵管炎、腹膜炎等癥狀,是養(yǎng)禽業(yè)最常見(jiàn)的致病菌之一。LuxS/AI-2型密度感應(yīng)系統(tǒng)廣泛存在于革蘭氏陽(yáng)性和陰性細(xì)菌中,可產(chǎn)生種間通用信號(hào)分子AI-2,并調(diào)控細(xì)菌的多種生理功能。AI-2信號(hào)由胞外轉(zhuǎn)運(yùn)至胞內(nèi)需要借助于細(xì)胞的AI-2受體,目前哈維氏弧菌的LuxP型受體和鼠傷寒沙門的LsrB型受體已被證實(shí)存在多種細(xì)菌中。但關(guān)于APEC的AI-2受體,目前尚缺乏相關(guān)報(bào)道。本研究旨在通過(guò)建立APEC的AI-2受體檢測(cè)方法,運(yùn)用蛋白組學(xué)技術(shù),篩選AI-2調(diào)控的靶蛋白,為進(jìn)一步探究LuxS/AI-2型密度感應(yīng)系統(tǒng)在APEC中的調(diào)控通路及鑒定AI-2受體提供參考,從而為從細(xì)菌群體角度防治APEC提供新的思路。1.AI-2受體蛋白檢測(cè)的方法建立為了建立AI-2受體檢測(cè)方法,本研究首先通過(guò)基因缺失的方法,構(gòu)建大腸桿菌BL21(DE3)的luxS基因缺失株,成功獲得不能產(chǎn)生AI-2的BL21(DE3)缺失株,并命名為BL21(DE3)?luxS。運(yùn)用pColdTF質(zhì)粒構(gòu)建了鼠傷寒沙門氏菌LsrB蛋白的原核表達(dá)載體pColdTF-lsrB,并分別轉(zhuǎn)化至BL21(DE3)?luxS和BL21(DE3)中,經(jīng)體外誘導(dǎo)表達(dá),成功獲得具有生物學(xué)活性的Lsr B蛋白。運(yùn)用純化的LsrB對(duì)AI-2分子進(jìn)行了結(jié)合與釋放實(shí)驗(yàn)。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明LsrB對(duì)AI-2分子具有結(jié)合能力,且結(jié)合能力是建立在LsrB的活性結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)上;活性結(jié)構(gòu)喪失后的LsrB不能夠結(jié)合AI-2,并釋放已結(jié)合AI-2。通過(guò)建立AI-2受體的檢測(cè)方法,為進(jìn)一步開(kāi)展APEC的AI-2受體篩選奠定基礎(chǔ)。2.運(yùn)用蛋白組學(xué)技術(shù)篩選APEC中AI-2的靶蛋白對(duì)APEC內(nèi)化外源性AI-2的動(dòng)力學(xué)研究表明,加入AI-2后第3 h時(shí),APEC對(duì)AI-2內(nèi)化效率最高(72%)。但運(yùn)用熒光定量PCR(qPCR)技術(shù),對(duì)APEC內(nèi)化外源性AI-2后luxS、pfs、iss和tsh的轉(zhuǎn)錄水平檢測(cè)結(jié)果表明,AI-2內(nèi)化5h時(shí),上述基因轉(zhuǎn)錄水平變化最顯著(p0.001)。上述研究結(jié)果表明從APEC對(duì)AI-2的內(nèi)化和AI-2對(duì)APEC的基因調(diào)控是不同步的。為了研究AI-2對(duì)APEC的靶蛋白的調(diào)控作用,本研究結(jié)合APEC內(nèi)化外源性AI-2的內(nèi)化動(dòng)力學(xué)結(jié)果,選擇AI-2加入APEC中5 h時(shí)的菌體,運(yùn)用非標(biāo)記定量蛋白組學(xué)方法檢測(cè)受AI-2調(diào)控靶蛋白,同時(shí)設(shè)立不加AI-2的APEC對(duì)照組,比較兩者蛋白表達(dá)差異,篩選APEC中受AI-2調(diào)控的靶蛋白。非標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)結(jié)果顯示共檢測(cè)到受AI-2調(diào)控的顯著性差異蛋白質(zhì)479個(gè),對(duì)差異蛋白的生物信息分析結(jié)果表明,受AI-2調(diào)控的靶蛋白主要參與APEC的代謝和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)過(guò)程。3.AI-2靶基因缺失株的構(gòu)建及生物學(xué)特性分析對(duì)運(yùn)用蛋白組學(xué)技術(shù)篩選到的AI-2靶蛋白進(jìn)行分析,選取5個(gè)受AI-2調(diào)控的靶蛋白基因(3630、tufB、phoH、kgtP和yjaE),運(yùn)用Red同源重組的方法,成功獲得上述基因的缺失株。對(duì)構(gòu)建的缺失株進(jìn)行AI-2內(nèi)化檢測(cè),結(jié)果表明,與野生株相比,上述基因的缺失,并不能顯著影響AI-2的內(nèi)化。本文推測(cè)選取的5個(gè)AI-2靶基因,不是APEC的AI-2受體基因,不參與APEC對(duì)AI-2的內(nèi)化。對(duì)缺失株的LD50檢測(cè)結(jié)果表明,缺失株對(duì)櫻桃谷鴨的致病能力未呈現(xiàn)明顯變化(出現(xiàn)10倍或以上的LD50變化可認(rèn)為毒力改變),表明本研究選取的5個(gè)AI-2靶基因,不參與對(duì)APEC的毒力調(diào)控。本研究結(jié)果表明,選定的該5個(gè)AI-2調(diào)控基因可能參與APEC中的某些受LuxS/AI-2型密度感應(yīng)調(diào)控的其他生理過(guò)程,具體的機(jī)制仍有待深入研究。本研究通過(guò)建立AI-2受體檢測(cè)方法、鑒定AI-2調(diào)控的靶蛋白和構(gòu)建靶基因的缺失株并開(kāi)展相關(guān)的生物學(xué)研究,為進(jìn)一步開(kāi)展APEC中AI-2受體及其調(diào)控作用提供參考。
【圖文】:

路線圖,路線,革蘭氏陽(yáng)性菌,革蘭氏陰性菌


圖 1:細(xì)菌密度感應(yīng)(QS)信號(hào)的四個(gè)典型傳導(dǎo)路線[17]Fig 1: Canonical bacterial quorum-sensing (QS) circuitsA:革蘭氏陽(yáng)性菌 QS 系統(tǒng)的 AIP 分子雙組分信號(hào)傳導(dǎo);B:革蘭氏陽(yáng)性菌 QS 系統(tǒng)的 AIP 結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子傳導(dǎo);C:在革蘭氏陰性菌 QS 系統(tǒng)的 LuxI/LuxR 型小分子傳導(dǎo)系統(tǒng);D:在革蘭氏陰性菌 QS 系統(tǒng)的雙組分信號(hào)傳遞。革蘭氏陽(yáng)性菌產(chǎn)生的自誘導(dǎo)物是一種小肽,被稱為自誘導(dǎo)肽(Autoinducingpeptides, AIPs)。革蘭氏陽(yáng)性菌的 QS 系統(tǒng)通過(guò)對(duì) AIPs 的產(chǎn)生、識(shí)別和生理反應(yīng)的控制,來(lái)實(shí)現(xiàn)其調(diào)控作用。在許多革蘭氏陽(yáng)性菌中,寡肽信號(hào)分子 AIPs 是由膜上的雙組分信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng)識(shí)別(圖 1A)[19-21]。革蘭氏陽(yáng)性菌的 QS 系統(tǒng)的 AIPs 通常是先形成前體(proAIPs),而編碼 proAIPs的基因大多分散在基因組中[19, 22-27]。AIPs 在胞內(nèi)產(chǎn)生,隨即被傳遞并外排出胞膜。當(dāng) AIP 的胞外濃度高時(shí)(發(fā)生于 HCD),它會(huì)與胞膜上一種雙組分組氨酸激酶受體結(jié)合。通常,AIP 結(jié)合后激活受體的激酶活性,使其磷酸化,并將磷酸基團(tuán)傳遞給胞質(zhì)內(nèi)的相應(yīng)調(diào)控分子。這種一系列的磷酸化反應(yīng)能夠調(diào)節(jié)與激活 QS 系統(tǒng)中的基因轉(zhuǎn)錄(圖 1A)。在某些革蘭氏陽(yáng)性細(xì)菌的 QS 中,AIPs 會(huì)被輸送回進(jìn)細(xì)胞的細(xì)胞質(zhì),進(jìn)而與胞質(zhì)中的轉(zhuǎn)錄因子相互作用,以調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄因子的活性,進(jìn)而調(diào)節(jié)基因表達(dá)的變

同源蛋白,革蘭氏陰性菌,同系物,菌種


圖 2:革蘭氏陰性菌不同菌種產(chǎn)生的 AHL 同系物Fig 2: Homoserine lactone autoinducers produced by different Gram-negative bacteria注:LuxI、LuxM、RhlI、LasL 均為 LuxR 的同源蛋白當(dāng)前已有一些 AHL 介導(dǎo)的群體感應(yīng)系統(tǒng)被研究的很深入,如綠膿桿菌的LasI/LasR-RhlI/RhlR 系統(tǒng)被證實(shí)控制毒力因子基因的表達(dá)和生物被膜的形成[54-57],根瘤農(nóng)桿菌的 TraI/TraR 系統(tǒng)控制著向植物宿主傳送致癌 Ti 質(zhì)粒[44, 58, 59],玉米細(xì)菌性枯萎病菌的 EsaI/EsaR 系統(tǒng)控制多糖的合成、粘附和對(duì)宿主細(xì)胞的定植[60, 61]。2.2 細(xì)菌種間的密度感應(yīng)系統(tǒng)—LuxS/AI-2 型密度感應(yīng)系統(tǒng)雖然 LuxI/LuxR 型系統(tǒng)已在大多數(shù)革蘭氏陰性被證實(shí),但對(duì)某些弧菌(如哈維弧菌和霍亂弧菌)的研究發(fā)現(xiàn)它們的 QS 系統(tǒng)不符合 LuxI/LuxR 型系統(tǒng)的特性。這兩種弧菌(哈維弧菌和霍亂弧菌)既沒(méi)有 LuxI 同源基因,也不存在 LuxR 同源基因。然而,哈維弧菌和霍亂弧菌卻存在群體感應(yīng)系統(tǒng)所需的組件,,并且兩者高度類似[62-66],這提示可能存在其他類型的 QS 系統(tǒng)。起初,人們?cè)趯?duì)哈維弧菌的生物發(fā)光研究中首次發(fā)現(xiàn)了 AI-2[67]。進(jìn)一步研究表明 AI-2 廣泛存在于革蘭氏陽(yáng)性和革蘭氏陰性細(xì)菌以及在
【學(xué)位授予單位】:安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:S852.61

【相似文獻(xiàn)】

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