【摘要】：藏豬是我國(guó)特色地方豬種,在原產(chǎn)地以半放牧方式飼養(yǎng),具有耐粗、抗逆和抗病等優(yōu)良特性,但這些優(yōu)良特性如何形成目前尚不清楚。本研究利用16S rRNA基因測(cè)序技術(shù)對(duì)66頭不同飼喂方式和不同海拔地區(qū)的藏豬腸道微生物組成進(jìn)行分析,鑒別藏豬腸道中特異性顯著富集的腸道菌群,探索這些腸道菌群對(duì)藏豬優(yōu)良種質(zhì)特性形成的影響。在藏豬腸道菌群組成方面,研究結(jié)果顯示:擬桿菌門和厚壁菌門是所有檢測(cè)藏豬腸道菌群的優(yōu)勢(shì)菌群。屬水平上,發(fā)現(xiàn)有9個(gè)高豐度的核心菌屬,共占據(jù)總測(cè)序reads的38.3%,其中Prevotella、Treponema和Succinivibrio的相對(duì)豐度位列前三。根據(jù)Spearman秩相關(guān)系數(shù)構(gòu)建網(wǎng)絡(luò),這9個(gè)核心菌都處于互作網(wǎng)絡(luò)的中心。采用ADSOINS分析飼喂方式、海拔和日齡等因素對(duì)藏豬腸道菌群組成的影響,其中飼喂方式對(duì)藏豬腸道菌群結(jié)構(gòu)影響最大,達(dá)極顯著水平,海拔和日齡的影響也達(dá)到顯著水平。本研究就三種不同飼養(yǎng)方式進(jìn)行比較,結(jié)果顯示:飼喂高纖維含量青飼料的藏豬腸道微生物Alpha多樣性最高,主要富集的是Bifidobacterium、RFN20、Allobaculum及Turicibacter等菌屬;而飼喂淀粉飼料的藏豬腸道菌群Alpha多樣性最低,主要富集的是Lachnospira、Faecalibacterium和Blautia等產(chǎn)生短鏈脂肪酸的菌屬;飼喂商品配合飼料的藏豬腸道菌群Alpha多樣性則介于兩者之間,主要富集的是Bacteroides、Oscillospira、Parabacteroides及YRC22等菌屬。海拔對(duì)藏豬腸道菌群組成也有顯著影響,飼養(yǎng)在海拔2146米的藏豬腸道微生物Alpha多樣性最高,海拔達(dá)到3000米以上的藏豬腸道菌群Alpha多樣性最低。OTU水平上有28個(gè)OUT豐度與海拔上升趨勢(shì)呈正相關(guān),屬水平上Anaeroplasma豐度隨海拔上升而增加。日齡對(duì)藏豬腸道微生物組成同樣具有顯著影響,四月齡藏腸道菌群的Alpha多樣性顯著低于成年藏豬。屬水平上Prevotella顯著富集于四月齡藏豬腸道菌群中。將藏豬與其他豬種(杜洛克、二花臉和巴馬香豬)的腸道菌群進(jìn)行比較,發(fā)現(xiàn)藏豬腸道菌群Alpha多樣性最高(香農(nóng)指數(shù)),并顯著富集了可能與抗病性相關(guān)的Verrucomicrobia、粗纖維代謝有關(guān)的Treponema和Succinivibrio等菌。腸道菌群功能預(yù)測(cè)分析也表明:藏豬群體特有的微生物或許與藏豬的抗逆、抗病和耐粗相關(guān)。這些研究結(jié)果有助于我們更好地探討藏豬抗病、抗逆和耐粗等優(yōu)良特性形成機(jī)理,為今后藏豬的開發(fā)利用提供新的參考。
【圖文】：

菌群影響基礎(chǔ)性神經(jīng)發(fā)育調(diào)控宿主行為[圖片來(lái)自 Gil Sharon 等（ut microbiome influence basic neurogenerative processes and modula影響宿主的營(yíng)養(yǎng)代謝、免疫調(diào)控和行為控制存在密切的關(guān)系，宿主之間保持著動(dòng)態(tài)平衡，一旦腸道菌群發(fā)生失調(diào)，將會(huì)的疾病。調(diào)易引發(fā)腸道疾病。腸易激綜合癥（IBS）就是由于腸道的一種疾病。與健康人相比，IBS 患者腸道內(nèi)變形菌門的高，并且患者直腸粘膜 IL-1β mRNA 以及腸嗜鉻細(xì)胞水平引起的慢性炎癥是誘發(fā) IBS 的重要因素[36, 37]。炎癥性腸常見疾病。有研究表明，病原菌（沙門氏菌）的感染是程度的關(guān)鍵因素，通過(guò)改變腸道菌群的組成、破壞腸上皮致 IBD 的發(fā)病[38]。腸道菌群失衡還可能會(huì)導(dǎo)致多種慢性稱非胰島素依賴型糖尿病，是一種以慢性高血糖為特征的明，特定腸道微生物與 II 型糖尿病相關(guān)。秦俊杰等人對(duì)

-2 小豬不同腸道部位微生物組成 [圖片來(lái)自 Looft（2014）ic classification of the sequence reads at phylum in piglets of icolon微生物組成的因素組成受多種因素的影響，隨著宿主的生長(zhǎng)、環(huán)境的變這個(gè)過(guò)程中，豬腸道菌群主要受飼料、日齡、地域環(huán)等因素的影響。素）是豬飼料中的一個(gè)重要組成部分，它的改變能影中的多糖主要通過(guò)影響豬腸道后端菌群的互作，，改變從而調(diào)控豬腸道后端的消化吸收[55, 56]。不同類型的飼到顯著水平。麥麩中的阿拉伯木聚糖能使腸道中乳酸大豆中的阿拉伯半乳糖則能使大腸桿菌的數(shù)目上升[54%的抗性淀粉能使結(jié)腸中的產(chǎn)丁酸柔嫩梭菌和瘤胃
【學(xué)位授予單位】：江西農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號(hào)】：S828

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

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本文編號(hào)：2536227