【摘要】：為掌握牛冠狀病毒(Bovine coronavirus,BCoV)BCV-Aks-01新疆南疆株的全基因組序列、分子結構特征及遺傳變異情況。本研究以新疆南疆某牛場BCV-Aks-01陽性樣本為基礎,以GenBank中BCoV參考株設計擴增引物和測序引物,提取樣本中病毒核酸,對BCV-Aks-01株進行全基因組擴增、測序、構建系統(tǒng)發(fā)生樹及序列分析。結果表明,BCV-Aks-01新疆南疆株為BCoV,其全基因組長為30 975bp,與GenBank收錄的參考株比較,核苷酸同源性高達98.8%,屬于β類冠狀病毒2a亞類,具有β類冠狀病毒共同結構特征。首次獲得BCV-Aks-01新疆南疆株全基因組序列并闡明了其基因組分子結構特征。
【圖文】：

ＢＣｏＶ型參考株（ＦＪ９３８０６４．１）全基因組比較，核苷酸同源性達到９８．８％。４冠狀病毒基因型及系統(tǒng)發(fā)生樹分析系統(tǒng)發(fā)生樹（圖１）分析：人冠狀病毒２２９Ｅ（Ｈｕ－ｍａｎｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓ２２９Ｅ，ＨＣｏＶ－２２９Ｅ）、犬冠狀病毒（Ｃａｎｉｎｅｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓｓｔｒａｉｎ，ＣＣｏＶ）、貓傳染性腹膜炎病毒（Ｆｅｌｉｎｅｉｎｆｅｃｔｉｏｕｓｐｅｒｉｔｏｎｉｔｉｓｖｉｒｕｓ，ＦＩＰＶ）、豬流行性腹瀉病毒（ＰｏｒｃｉｎｅｅｐｉｄｅｍｉｃｄｉａｒｒｈｅａｖｉｒｕｓＣＶ７７７，ＰＥＤＶ－ＣＶ７７７）、豬傳染性胃腸炎病毒（ＴｒａｎｓｍｉｓｓｉｂｌｅｇａｓｔｒｏｅｎｔｅｒｉｔｉｓｖｉｒｕｓｏｆｓｗｉｎｅＭｉｌｌ－ｅｒＭ６，ＴＧＥＶＭｉｌｌｅｒＭ６）、一些蝙蝠類冠狀病毒如菊頭蝠冠狀病毒（ＲｈｉｎｏｌｏｐｈｕｓｂａｔｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓＨＫＵ２，ＢａｔＣｏＶ－ＨＫＵ２）、長翼蝠冠狀病毒（Ｍｉｎ－ｉｏｐｔｅｒｕｓｂａｔｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓＨＫＵ８，ＢａｔＣｏＶ－ＨＫＵ８）等位于同一進化分支上，屬于α類冠狀病毒；人冠狀病毒（ＨｕｍａｎｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓＯＣ４３ｓｔｒａｉｎＡＴＣＣＶＲ－７５９，，ＨＣｏＶ－ＯＣ４３）、人冠狀病毒中國香港１（ＨｕｍａｎｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓＨＫＵ１，ＨＣｏＶ－ＨＫＵ１）、牛冠狀病毒（ＢｏｖｉｎｅｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓＥ－ＡＨ１８７－ＴＣ，ＢＣｏＶ－Ｅ；Ｂｏ－ｖｉｎｅｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓＥ－ＡＨ６５，ＢＣｏＶ－Ｅ－ＡＨ６５；ＢｏｖｉｎｅｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓＲ－ＡＨ６５，ＢＣｏＶ－Ｒ－Ａ

ＢＣｏＶ型參考株（ＦＪ９３８０６４．１）全基因組比較，核苷酸同源性達到９８．８％。４冠狀病毒基因型及系統(tǒng)發(fā)生樹分析系統(tǒng)發(fā)生樹（圖１）分析：人冠狀病毒２２９Ｅ（Ｈｕ－ｍａｎｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓ２２９Ｅ，ＨＣｏＶ－２２９Ｅ）、犬冠狀病毒（Ｃａｎｉｎｅｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓｓｔｒａｉｎ，ＣＣｏＶ）、貓傳染性腹膜炎病毒（Ｆｅｌｉｎｅｉｎｆｅｃｔｉｏｕｓｐｅｒｉｔｏｎｉｔｉｓｖｉｒｕｓ，ＦＩＰＶ）、豬流行性腹瀉病毒（ＰｏｒｃｉｎｅｅｐｉｄｅｍｉｃｄｉａｒｒｈｅａｖｉｒｕｓＣＶ７７７，ＰＥＤＶ－ＣＶ７７７）、豬傳染性胃腸炎病毒（ＴｒａｎｓｍｉｓｓｉｂｌｅｇａｓｔｒｏｅｎｔｅｒｉｔｉｓｖｉｒｕｓｏｆｓｗｉｎｅＭｉｌｌ－ｅｒＭ６，ＴＧＥＶＭｉｌｌｅｒＭ６）、一些蝙蝠類冠狀病毒如菊頭蝠冠狀病毒（ＲｈｉｎｏｌｏｐｈｕｓｂａｔｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓＨＫＵ２，ＢａｔＣｏＶ－ＨＫＵ２）、長翼蝠冠狀病毒（Ｍｉｎ－ｉｏｐｔｅｒｕｓｂａｔｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓＨＫＵ８，ＢａｔＣｏＶ－ＨＫＵ８）等位于同一進化分支上，屬于α類冠狀病毒；人冠狀病毒（ＨｕｍａｎｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓＯＣ４３ｓｔｒａｉｎＡＴＣＣＶＲ－７５９，ＨＣｏＶ－ＯＣ４３）、人冠狀病毒中國香港１（ＨｕｍａｎｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓＨＫＵ１，ＨＣｏＶ－ＨＫＵ１）、牛冠狀病毒（ＢｏｖｉｎｅｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓＥ－ＡＨ１８７－ＴＣ，ＢＣｏＶ－Ｅ；Ｂｏ－ｖｉｎｅｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓＥ－ＡＨ６５，ＢＣｏＶ－Ｅ－ＡＨ６５；ＢｏｖｉｎｅｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓＲ－ＡＨ６５，ＢＣｏＶ－Ｒ－Ａ
【作者單位】： 塔里木大學生命科學學院;新疆生產建設兵團第一師畜牧獸醫(yī)工作站;塔里木大學動物科學學院;
【基金】：新疆生產建設兵團科技局現(xiàn)代農業(yè)科技攻關與成果轉化資助(項目號:2016AC012),題目:規(guī)�；膛鰻倥Ｖ饕粑酪卟×餍胁W調查及控制技術集成;新疆生產建設兵團第一師科技局資助項目(項目號:2016XS03),題目:第一師規(guī)�；膛鰻倥８篂a的流行病學調查及防控技術研究~~
【分類號】：S852.65

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本文編號：2521200