【摘要】：為掌握牛冠狀病毒(Bovine coronavirus,BCoV)BCV-Aks-01新疆南疆株的全基因組序列、分子結(jié)構(gòu)特征及遺傳變異情況。本研究以新疆南疆某牛場(chǎng)BCV-Aks-01陽(yáng)性樣本為基礎(chǔ),以GenBank中BCoV參考株設(shè)計(jì)擴(kuò)增引物和測(cè)序引物,提取樣本中病毒核酸,對(duì)BCV-Aks-01株進(jìn)行全基因組擴(kuò)增、測(cè)序、構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹及序列分析。結(jié)果表明,BCV-Aks-01新疆南疆株為BCoV,其全基因組長(zhǎng)為30 975bp,與GenBank收錄的參考株比較,核苷酸同源性高達(dá)98.8%,屬于β類冠狀病毒2a亞類,具有β類冠狀病毒共同結(jié)構(gòu)特征。首次獲得BCV-Aks-01新疆南疆株全基因組序列并闡明了其基因組分子結(jié)構(gòu)特征。
【圖文】：

ＢＣｏＶ型參考株（ＦＪ９３８０６４．１）全基因組比較，核苷酸同源性達(dá)到９８．８％。４冠狀病毒基因型及系統(tǒng)發(fā)生樹分析系統(tǒng)發(fā)生樹（圖１）分析：人冠狀病毒２２９Ｅ（Ｈｕ－ｍａｎｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓ２２９Ｅ，ＨＣｏＶ－２２９Ｅ）、犬冠狀病毒（Ｃａｎｉｎｅｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓｓｔｒａｉｎ，ＣＣｏＶ）、貓傳染性腹膜炎病毒（Ｆｅｌｉｎｅｉｎｆｅｃｔｉｏｕｓｐｅｒｉｔｏｎｉｔｉｓｖｉｒｕｓ，ＦＩＰＶ）、豬流行性腹瀉病毒（ＰｏｒｃｉｎｅｅｐｉｄｅｍｉｃｄｉａｒｒｈｅａｖｉｒｕｓＣＶ７７７，ＰＥＤＶ－ＣＶ７７７）、豬傳染性胃腸炎病毒（ＴｒａｎｓｍｉｓｓｉｂｌｅｇａｓｔｒｏｅｎｔｅｒｉｔｉｓｖｉｒｕｓｏｆｓｗｉｎｅＭｉｌｌ－ｅｒＭ６，ＴＧＥＶＭｉｌｌｅｒＭ６）、一些蝙蝠類冠狀病毒如菊頭蝠冠狀病毒（ＲｈｉｎｏｌｏｐｈｕｓｂａｔｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓＨＫＵ２，ＢａｔＣｏＶ－ＨＫＵ２）、長(zhǎng)翼蝠冠狀病毒（Ｍｉｎ－ｉｏｐｔｅｒｕｓｂａｔｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓＨＫＵ８，ＢａｔＣｏＶ－ＨＫＵ８）等位于同一進(jìn)化分支上，屬于α類冠狀病毒；人冠狀病毒（ＨｕｍａｎｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓＯＣ４３ｓｔｒａｉｎＡＴＣＣＶＲ－７５９，，ＨＣｏＶ－ＯＣ４３）、人冠狀病毒中國(guó)香港１（ＨｕｍａｎｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓＨＫＵ１，ＨＣｏＶ－ＨＫＵ１）、牛冠狀病毒（ＢｏｖｉｎｅｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓＥ－ＡＨ１８７－ＴＣ，ＢＣｏＶ－Ｅ；Ｂｏ－ｖｉｎｅｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓＥ－ＡＨ６５，ＢＣｏＶ－Ｅ－ＡＨ６５；ＢｏｖｉｎｅｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓＲ－ＡＨ６５，ＢＣｏＶ－Ｒ－Ａ

ＢＣｏＶ型參考株（ＦＪ９３８０６４．１）全基因組比較，核苷酸同源性達(dá)到９８．８％。４冠狀病毒基因型及系統(tǒng)發(fā)生樹分析系統(tǒng)發(fā)生樹（圖１）分析：人冠狀病毒２２９Ｅ（Ｈｕ－ｍａｎｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓ２２９Ｅ，ＨＣｏＶ－２２９Ｅ）、犬冠狀病毒（Ｃａｎｉｎｅｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓｓｔｒａｉｎ，ＣＣｏＶ）、貓傳染性腹膜炎病毒（Ｆｅｌｉｎｅｉｎｆｅｃｔｉｏｕｓｐｅｒｉｔｏｎｉｔｉｓｖｉｒｕｓ，ＦＩＰＶ）、豬流行性腹瀉病毒（ＰｏｒｃｉｎｅｅｐｉｄｅｍｉｃｄｉａｒｒｈｅａｖｉｒｕｓＣＶ７７７，ＰＥＤＶ－ＣＶ７７７）、豬傳染性胃腸炎病毒（ＴｒａｎｓｍｉｓｓｉｂｌｅｇａｓｔｒｏｅｎｔｅｒｉｔｉｓｖｉｒｕｓｏｆｓｗｉｎｅＭｉｌｌ－ｅｒＭ６，ＴＧＥＶＭｉｌｌｅｒＭ６）、一些蝙蝠類冠狀病毒如菊頭蝠冠狀病毒（ＲｈｉｎｏｌｏｐｈｕｓｂａｔｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓＨＫＵ２，ＢａｔＣｏＶ－ＨＫＵ２）、長(zhǎng)翼蝠冠狀病毒（Ｍｉｎ－ｉｏｐｔｅｒｕｓｂａｔｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓＨＫＵ８，ＢａｔＣｏＶ－ＨＫＵ８）等位于同一進(jìn)化分支上，屬于α類冠狀病毒；人冠狀病毒（ＨｕｍａｎｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓＯＣ４３ｓｔｒａｉｎＡＴＣＣＶＲ－７５９，ＨＣｏＶ－ＯＣ４３）、人冠狀病毒中國(guó)香港１（ＨｕｍａｎｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓＨＫＵ１，ＨＣｏＶ－ＨＫＵ１）、牛冠狀病毒（ＢｏｖｉｎｅｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓＥ－ＡＨ１８７－ＴＣ，ＢＣｏＶ－Ｅ；Ｂｏ－ｖｉｎｅｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓＥ－ＡＨ６５，ＢＣｏＶ－Ｅ－ＡＨ６５；ＢｏｖｉｎｅｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓＲ－ＡＨ６５，ＢＣｏＶ－Ｒ－Ａ
【作者單位】： 塔里木大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團(tuán)第一師畜牧獸醫(yī)工作站;塔里木大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院;
【基金】：新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團(tuán)科技局現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技攻關(guān)與成果轉(zhuǎn)化資助(項(xiàng)目號(hào):2016AC012),題目:規(guī)�；膛�(chǎng)犢牛主要呼吸道疫病流行病學(xué)調(diào)查及控制技術(shù)集成;新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團(tuán)第一師科技局資助項(xiàng)目(項(xiàng)目號(hào):2016XS03),題目:第一師規(guī)�；膛�(chǎng)犢牛腹瀉的流行病學(xué)調(diào)查及防控技術(shù)研究~~
【分類號(hào)】：S852.65

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本文編號(hào)：2521200