【摘要】：水牛是我國重要的役用家畜。目前,對于水牛起源進(jìn)化的研究在考古學(xué)、形態(tài)學(xué)與分子遺傳學(xué)方面均有涉及,大量線粒體DNA的研究雖能提供水牛母系起源的證據(jù),但仍需Y染色體分子遺傳多樣性方面的研究來提供水牛父系起源的遺傳學(xué)證據(jù)。本研究以10個中國沼澤型水牛品種共196頭公牛為研究對象,利用已發(fā)表的42對黃牛Y染色體微衛(wèi)星(Y-STR)標(biāo)記,采用常規(guī)的銀染Y-STR分型技術(shù),篩選出更多的水牛Y-STR多態(tài)標(biāo)記,并用國際先進(jìn)的熒光Y-STR分型技術(shù)加以驗(yàn)證,以獲得可靠的水牛Y-STR多態(tài)標(biāo)記。牦牛是一個我國古老的牛種,在青藏高原地區(qū)畜牧業(yè)經(jīng)濟(jì)中有著有不可替代的生態(tài)經(jīng)濟(jì)地位,是重要的自然資源、生態(tài)資源和經(jīng)濟(jì)資源,同時也是�？萍倚蠡驇斓闹匾M成部分。對不同牦牛品種進(jìn)行遺傳多樣性研究從Y染色體角度對不同牦牛品種分子遺傳多樣性研究具有重大意義。本研究以2個青海高原牦牛類群和大通牦牛共108頭公牛為研究對象,對8對黃牛的Y-STR標(biāo)記進(jìn)行篩選,以獲得可靠的牦牛Y-STR多態(tài)標(biāo)記。中國擁有世界上最豐富的馬品種遺傳資源,居世界第一位,但從父系遺傳(即Y染色體)角度對馬品種分子遺傳多樣性的研究報道較少,中國馬Y-SNP研究更不多,還沒有發(fā)現(xiàn)Y-SNP。揭示馬品種的Y染色體分子遺傳多樣性狀況,將為馬品種分子遺傳多樣性數(shù)據(jù)庫的建立、育種改良提供理論依據(jù)。本研究對13個中國馬品種在4對Y染色體SNP標(biāo)記中的分子遺傳多樣性進(jìn)行了分析。本研究對水牛、牦牛及馬Y染色體分子遺傳多樣性分析,獲得以下主要結(jié)果:1.水牛Y-STRs篩選與遺傳多樣性研究(1)選擇黃牛42對Y-STR標(biāo)記,對水牛群體進(jìn)行Y-STR標(biāo)記特異性與多態(tài)性篩選,初步發(fā)現(xiàn)35對Y-STR標(biāo)記為水牛Y染色體特異性標(biāo)記,其中12對(UMN0108、UMN2008、UMN0705、UMN0907、UMN1113、INRA126、BC1.2、UMN2713、UMN2908、PBR1F1、UMN2001、INRA189)在水牛中有多態(tài)性。另外7對Y-STR標(biāo)記(UMN2303、UMN2405、UMN0929、UMN0803、UMN0301、UMN1307、UMN1514)不是水牛Y染色體特異的微衛(wèi)星標(biāo)記。(2)熒光Y-STR分型結(jié)果表明,3對標(biāo)記(INRA189、PBR1F1和UMN2001)在水牛不同品種中存在多態(tài)性,表明采用常規(guī)銀染方法所篩選的Y-STR多態(tài)性標(biāo)記有一定的可靠性。(3)中國10個水牛品種具有較高的Y-STR多態(tài)性,聚類分析表明,中國水牛有2個父系起源。2.牦牛Y-STRs篩選與遺傳多樣性研究(1)采用常規(guī)銀染方法檢測了青海高原牦牛2個類群和大通牦牛8個Y-STR標(biāo)記的特異性,其中5個Y-STR標(biāo)記(BM861,BYM-1,INRA126,UMN0307和UMN0103)不是牦牛Y染色體特異微衛(wèi)星標(biāo)記;1個標(biāo)記(INRA124)在牦牛類群中無擴(kuò)增產(chǎn)物;2個標(biāo)記(INRA189和UMN2404)是牦牛Y染色體特異微衛(wèi)星標(biāo)記,且具有多態(tài)性。(2)熒光Y-STR分型結(jié)果表明,2個標(biāo)記(INRA189和UMN2404)是牦牛Y染色體特異微衛(wèi)星標(biāo)記,且具有多態(tài)性。首次證明UMN2404標(biāo)記能用于牦牛Y染色體遺傳多樣性研究。(3)青海高原牦牛2個類群和大通牦牛之間Y-STR多態(tài)性較低,2個類群和大通牦牛沒有明顯的遺傳分化。3.馬Y-SNP篩選及遺傳多樣性研究(1)首次在中國馬中發(fā)現(xiàn)3個Y-SNPs(Y-45701/997,G→T突變;Y-50869,T→A突變;Y-45288,T堿基缺失)。(2)在這3個Y-SNPs位點(diǎn)中,中國馬的Y-SNP多態(tài)性比歐洲及美洲馬低。中國西北地區(qū)的馬具有較高的Y-SNP多態(tài)性。
[Abstract]:The buffalo is an important domestic animal in our country. At present, research on the origin of buffalo has involved in the aspects of archaeology, morphology and molecular genetics. But it is still necessary to study the genetic diversity of the Y-chromosome molecule to provide the genetic evidence of the origin of the father of the buffalo. In this study, a total of 196 bulls were used as the research object in 10 Chinese swamp buffaloes, and the published 42 pairs of Y-STR markers were used to screen the Y-STR polymorphic markers of buffalo. And a reliable buffalo Y-STR polymorphic marker is obtained by using the international advanced fluorescent Y-STR typing technology. Yak is an ancient Chinese species, and has an irreplaceable ecological economic status in the animal husbandry economy of the Qinghai-Tibet Plateau. It is an important natural resource, ecological resource and economic resources, and is also an important part of the cattle gene bank of the cattle family. It is of great significance to study the genetic diversity of different yak breeds from the Y chromosome angle. In this study, the Y-STR markers of 8 yellow cattle were selected to obtain a reliable Y-STR polymorphic marker. China has the most abundant genetic resources in the world, ranking the first in the world, but the study of the genetic diversity of the species of the horse from the father's genetic (i.e., Y chromosome) angle is less, and the Chinese horse Y-SNP study is much less, and the Y-SNP is not found. The genetic diversity of the Y chromosome of the horse variety is revealed, which will provide a theoretical basis for the establishment of the genetic diversity database of the horse variety and the improvement of the breeding. The molecular genetic diversity of 13 Chinese horse breeds in 4 pairs of Y-chromosome SNP markers was analyzed. In this study, the molecular genetic diversity of buffalo, yak and horse Y was analyzed, and the following main results were obtained:1. The selection of Y-STRs and genetic diversity of water buffalo (1) selection of yellow cattle 42 to the Y-STR markers and the selection of Y-STR markers for buffalo groups, and the preliminary finding of 35 pairs of Y-STR markers for buffalo Y chromosome-specific markers,12 pairs (UMN0108, UMN2008, UMN0705, UMN0907, UMN1113, INRA126, BC1.2, UMN2713, UNU2908, PBR1F1, UMN2001, INRA189) were polymorphic in buffaloes. In addition,7 pairs of Y-STR markers (UMN2303, UMN2405, UMN0929, UMN0803, UMN0301, UMN1307, UMN1514) are not microsatellite markers specific to the Y chromosome of the buffalo. (2) The results of fluorescent Y-STR typing show that 3 pairs of markers (INRA189, PB1F1 and UMN2001) have a polymorphism in different varieties of buffalo, indicating that the Y-STR polymorphic marker screened by the conventional silver staining method has certain reliability. (3) Chinese buffalo had a high Y-STR polymorphism, and the cluster analysis showed that the Chinese buffalo had 2 paternal origins. The selection and genetic diversity of Yak Y-STRs (1) were used to test the specificity of 2 taxa and 8 Y-STR markers of Yak in Qinghai Plateau. The five Y-STR markers (BM861, BYM-1, INRA126, UMN0307 and UMN0103) were not specific microsatellite markers of Yak Y chromosome. One marker (INRA124) has no amplification product in yak group, and 2 markers (INRA189 and UMN2404) are specific microsatellite markers of Yak Y chromosome and have polymorphism. (2) The results of fluorescent Y-STR typing show that 2 markers (INRA189 and UMN2404) are specific microsatellite markers of Yak Y chromosome and have polymorphism. The first time that the UMN2404 marker can be used to study the genetic diversity of Y chromosome in Yak. (3) The Y-STR polymorphism between the two groups of Yak and the Yak in Qinghai plateau was lower, and there were no obvious genetic differentiation between the two groups. Three Y-SNPs (Y-45701/997, G-T mutation, Y-50869, T-A mutation, Y-45288, T-base deletion) were found in Chinese horses for the first time. (2) In these three Y-SNPs sites, the Y-SNP polymorphism of Chinese horse is lower than that in Europe and America. The horse in the northwest of China has a higher Y-SNP polymorphism.
【學(xué)位授予單位】：西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：S813.1

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本文編號：2502335