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廣東新型鴨呼腸孤病毒σB蛋白基因克隆及序列分析

發(fā)布時間:2019-04-11 12:21
【摘要】:為研究廣東新型呼腸孤病毒(NDRV)的基因變異及遺傳演化情況,本試驗(yàn)從廣東不同鴨場病死鴨肝臟、脾臟等組織臟器中分離到8株流行毒株,用RT-PCR方法進(jìn)行σB蛋白基因擴(kuò)增、克隆與序列分析,并與其他毒株σB蛋白的氨基酸特性、蛋白抗原和蛋白基因進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化比對分析。結(jié)果表明,廣東省鴨群中感染的NDRV與國內(nèi)其他地區(qū)報道的DRV核苷酸序列同源性很高,達(dá)96.6%~99.5%,而與禽呼腸孤病毒(ARV)和番鴨呼腸孤病毒(MDRV)的同源性則較低,分別為64.6%~66.5%和66.2%~67.1%;8株NDRV之間的核苷酸序列同源性高達(dá)97.7%~99.7%。與其他毒株比較結(jié)果顯示,本試驗(yàn)分離的NDRV毒株磷酸化位點(diǎn)均比參考毒株ARV和MDRV少,且大多數(shù)區(qū)域的抗原指數(shù)都較高,抗原性與MDRV較為接近,遺傳進(jìn)化分析結(jié)果表明,NDRV和國內(nèi)其他DRV處于獨(dú)立的進(jìn)化分支,ARV和MDRV則處于不同分支。結(jié)果表明,廣東省流行的NDRV毒株σB蛋白基因序列高度保守,且廣東地區(qū)分離的NDRV與國內(nèi)其他地區(qū)分離的DRV沒有明顯的地域差異。
[Abstract]:In order to study the genetic variation and genetic evolution of a new type of reovirus (NDRV) in Guangdong Province, 8 strains of epidemic strains were isolated from the liver, spleen and other tissues of dead ducks in different duck farms in Guangdong Province. The 蟽 B protein gene was amplified by RT-PCR, cloned and sequenced, and compared with the amino acid characteristics, protein antigen and protein gene of other strains. The results showed that the nucleotide sequences of NDRV infected in ducks in Guangdong province were highly homologous to those reported in other regions of China, reaching 96.6% and 99.5% respectively, while the homology with avian reovirus (ARV) and muscovy duck reovirus (MDRV) was lower than that of poultry reovirus (ARV) and muscovy duck reovirus (MDRV). 64.6% / 66.5% and 66.2% / 67.1%, respectively. The nucleotide sequence homology of 8 NDRV strains was as high as 97.7% and 99.7% respectively. Compared with other strains, the phosphorylated sites of NDRV strains isolated in this study were lower than those of reference strains ARV and MDRV, and the antigen index of most regions was higher, and the antigenicity was close to that of MDRV. NDRV and other domestic DRV are independent evolutionary branches, while ARV and MDRV are in different branches. The results showed that the 蟽 B protein gene sequence of NDRV strain was highly conserved in Guangdong province, and there was no obvious regional difference between the NDRV isolated from Guangdong region and the DRV isolated from other regions in China.
【作者單位】: 佛山科學(xué)技術(shù)學(xué)院生命科學(xué)與工程學(xué)院;
【基金】:基金項目:廣東省家禽重大傳染病控制技術(shù)研究(2012A020100001)
【分類號】:S852.65

【參考文獻(xiàn)】

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【二級參考文獻(xiàn)】

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本文編號:2456403


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