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中國荷斯坦牛CSN3、ACACA基因多態(tài)性及其與泌乳性狀的關聯(lián)性分析

發(fā)布時間:2019-01-22 17:59
【摘要】:本試驗以中國荷斯坦牛為研究材料,選取CSN3(κ-酪蛋白)、ACACA(乙酰輔酶A羧化酶α)2個與泌乳性狀相關的候選基因,通過PCR結(jié)合產(chǎn)物直接測序的方法來檢測突變位點,并依此確定基因型;根據(jù)SNP發(fā)生頻率,使用POPGENE軟件計算遺傳參數(shù);使用HAPLOVIEW軟件對發(fā)現(xiàn)的2個基因的SNP位點進行連鎖不平衡分析及單倍型分析。通過SPSS軟件分別對兩個基因的多態(tài)性與泌乳性狀進行相關性分析。本試驗旨在利用候選基因的方法篩選出對中國荷斯坦牛泌乳性狀有重要影響的分子標記位點,確定影響泌乳性狀的主效基因,為中國荷斯坦牛標記輔助育種及其泌乳性狀遺傳改良提供理論依據(jù)。研究結(jié)果表明:1.本試驗在中國荷斯坦牛CSN3基因上共檢測到4個SNPs位點,分別為g.463GA,g.1012AC,g.2015TA和g.2396GT,除了g.2396GT外,其余3個SNPs位點在乳成分方面與中國荷斯坦牛密切相關。具體來說,在g.463GA處的突變可以極顯著影響乳脂率(P0.01),不同基因型對乳蛋白率也有顯著影響(P0.05),g.1012AC處的突變可以極顯著影響乳脂率(P0.01),而g.2015TA處的突變對乳脂率和乳蛋白率都有極顯著的影響(P0.01)。對CSN3基因的4個SNPs位點進行雙倍型關聯(lián)性分析發(fā)現(xiàn),H14H14(ACAG-ACAG)在乳脂率方面顯著高于其他雙倍型(P0.05)。由于CSN3基因編碼的κ-酪蛋白是乳蛋白的主要組成部分,SNP位點的不同基因型的CSN3基因會出現(xiàn)差異性表達最終影響泌乳性狀。2.本試驗在中國荷斯坦牛ACACA基因上檢測到2個SNPs(g.43569TC,g.43617TG),兩個SNPs位點都對中國荷斯坦牛泌乳性狀有一定影響。其中,g.43569TC處的突變可以極顯著影響乳蛋白率和乳糖率(P0.01),顯著影響乳脂率(P0.05);g.43617TG處的突變顯著影響乳蛋白率和乳糖率(P0.05)。雙倍型關聯(lián)性分析發(fā)現(xiàn),H1H1(CG-CG)在乳脂率方面極顯著高于其余雙倍型(P0.01),在乳糖率方面顯著高于其他雙倍型(P0.05)。由于ACACA基因在乳腺組織中脂肪酸合成方面發(fā)揮重要作用,SNP位點的不同基因型的ACACA基因會出現(xiàn)差異性表達最終影響泌乳性狀。因此可以嘗試將CSN3、ACACA基因作為影響泌乳性狀的主效基因用于標記輔助選擇,為中國荷斯坦牛選育工作提供科學依據(jù)。
[Abstract]:Two candidate genes of CSN3 (魏 -casein), ACACA (acetyl coenzyme A carboxylase 偽) associated with lactation traits were selected from Chinese Holstein cattle. The mutation sites were detected by direct sequencing of PCR binding products. The genotypes were determined by this method. According to the frequency of SNP occurrence, genetic parameters were calculated by POPGENE software, linkage disequilibrium analysis and haplotype analysis of SNP loci of two genes were performed by HAPLOVIEW software. The relationship between the polymorphism of two genes and lactation traits was analyzed by SPSS software. The aim of this study was to screen out the molecular marker sites that have important influence on the lactation traits of Chinese Holstein cattle by using candidate genes, and to identify the major genes that affect the lactation traits. It provides a theoretical basis for marker-assisted breeding and genetic improvement of lactation traits in Chinese Holstein cattle. The results show that: 1. In this study, four SNPs loci were detected on the CSN3 gene of Chinese Holstein cattle, namely, g.463GAAg-1012ACG. 2015TA and g.2396GT.The other three SNPs loci were closely related to the milk composition of Chinese Holstein cattle except for g.2396GT. Specifically, the mutation at g.463GA could significantly affect the milk fat rate (P0.01), different genotypes also had a significant effect on the milk protein rate (P0.05), and the mutation at the g.1012AC site could significantly affect the milk fat rate (P0.01). The mutation at g.2015TA had a significant effect on the milk fat rate and milk protein rate (P0.01). The results of diploidy analysis of 4 SNPs loci of CSN3 gene showed that H14H14 (ACAG-ACAG) was significantly higher in milk fat rate than that in other diploids (P0.05). Because the 魏-casein encoded by CSN3 gene is the main component of lactoprotein, the differential expression of CSN3 gene in different genotypes of SNP locus will ultimately affect lactation traits. 2. In this study, two SNPs (g.43569TCng. 43617TG) were detected on the ACACA gene of Chinese Holstein cattle. Both SNPs loci had some influence on lactation traits of Chinese Holstein cattle. Among them, the mutation at g.43569TC can significantly affect the milk protein rate and lactose rate (P0.01), significantly affect the milk fat rate (P0.05); g.43617TG mutation significantly affected the milk protein rate and lactose rate (P0.05). The results of association analysis showed that H1H1 (CG-CG) was significantly higher in milk fat rate than that in other diploids (P0.01), and lactose rate was significantly higher than that of other diploids (P0.05). Because ACACA gene plays an important role in the synthesis of fatty acids in breast tissues, the differential expression of ACACA genes in different genotypes of SNP loci will ultimately affect lactation traits. Therefore, we can try to use CSN3,ACACA gene as the main gene affecting lactation traits for marker-assisted selection, and provide scientific basis for the breeding of Chinese Holstein cattle.
【學位授予單位】:西北農(nóng)林科技大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2017
【分類號】:S823

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本文編號:2413432

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