發(fā)布時間：2018-11-23 07:16

【摘要】：為了解山西省豬圓環(huán)病毒2型(PCV2)的遺傳變異情況,本試驗采用PCR方法對山西省分離的4株豬圓環(huán)病毒流行株(SXXZ1株、SXXZ2株、SXTY株和SXJZ株)的全基因組進行了擴增、克隆和測序,并將其全基因組序列與國內(nèi)外34株主要流行毒株進行核苷酸同源性與系統(tǒng)進化樹分析。結(jié)果顯示,4株P(guān)CV2山西流行株全基因組核酸序列全長SXJZ株為1 768bp,其余均為1 767bp,分別占25%和75%。4株毒株核苷酸同源性為95.9%~100.0%,與國內(nèi)外34株參考株同源性為94.5%~99.9%,與國產(chǎn)疫苗株同源性為95.6%~99.8%;PCV2全基因組序列進化分析表明,本研究分離的SXXZ1株、SXXZ2株和SXTY株屬于PCV-2b基因型,SXJZ株屬于PCV-2e基因型,其中SXXZ1株和SXXZ2株與廣東QY株的進化關(guān)系最近,SXTY與奧地利AUT5株的進化關(guān)系最近,SXJZ與福建FJ株的進化關(guān)系最近;而SXXZ1株、SXXZ2株和SXTY株與山西PCV2疫苗DBN-SX07-2株的進化關(guān)系較近,SXJZ株與國內(nèi)PCV2疫苗LG株的進化關(guān)系較近。從而證實在山西省流行的PCV2毒株以PCV-2b為主,同時還分離出了PCV-2e亞型,表明山西省存在PCV-2e亞型毒株。本試驗結(jié)果為山西省PCV2的分子流行病學、遺傳變異及防控奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:In order to understand the genetic variation of porcine circovirus type 2 (PCV2) in Shanxi Province, the whole genome of four porcine circovirus epidemic strains (SXXZ1, SXXZ2, SXTY and SXJZ) were amplified by PCR method. The nucleotide homology and phylogenetic tree analysis were carried out by cloning and sequencing the whole genome sequence with 34 major epidemic strains at home and abroad. The results showed that the whole genome nucleic acid sequence of 4 strains of PCV2 in Shanxi province was 1 768 BP, while the rest was 1 767 BP, accounting for 25% and 75. 4% of the total nucleotide homology of 5. 59% and 75. 4%, respectively, and the nucleotide homology was 95. 9% and 10. 0%, respectively. The homology was 94.5% with 34 reference strains at home and abroad, 99.9 with domestic vaccine strains, and 99.8% with domestic vaccine strains. The phylogenetic analysis of PCV2 genome showed that the isolated SXXZ1 strains, SXXZ2 strains and SXTY strains belonged to PCV-2b genotypes, SXJZ strains belonged to PCV-2e genotypes, and SXXZ1 and SXXZ2 strains had the closest evolutionary relationship with QY strains in Guangdong. The evolutionary relationship between SXTY and Austrian AUT5 strain was the most recent, and that between SXJZ and Fujian FJ strain was the most recent. However, the evolutionary relationship among SXXZ1, SXXZ2 and SXTY strains was close to Shanxi PCV2 vaccine DBN-SX07-2 strain, and that of SXJZ strain was close to that of domestic PCV2 vaccine LG strain. It was confirmed that PCV-2b was the main PCV2 strain in Shanxi province, and PCV-2e subtype was also isolated, which indicated that PCV-2e subtype existed in Shanxi province. The results laid a foundation for molecular epidemiology, genetic variation and prevention and control of PCV2 in Shanxi Province.
【作者單位】： 山西省農(nóng)業(yè)科學院畜牧獸醫(yī)研究所;陵川縣畜牧獸醫(yī)局;
【基金】：山西省科技攻關(guān)項目(20130311026-4)
【分類號】：S852.651

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本文編號：2350740