發(fā)布時間：2018-11-09 12:08

【摘要】：旨在鑒定分析水牛乳腺泌乳期和非泌乳期miRNA的表達譜和差異作用機制。采集水牛泌乳期和非泌乳期乳腺組織,利用Solexa測序技術(shù)構(gòu)建2個時期miRNAs表達譜,鑒定前體miRNAs、成熟miRNAs和新miRNAs,分析miRNAs的第一偏好性核苷酸和染色體分布,發(fā)掘水牛泌乳期和非泌乳期高表達及差異表達miRNAs。結(jié)果顯示,本研究構(gòu)建了水牛泌乳期和非泌乳期乳腺組織2個miRNA表達譜,分別獲得12 768 110和12 569 467條18~31nt的高質(zhì)量序列。測序確認了歸屬259個miRNAs家族的359個成熟miRNAs和363個pre-miRNAs及5個水牛特有的miRNAs。U是19和25nt miRNAs的5′端最普遍的核苷酸。bbu-let-7b、bbu-let-7a、miR-26a和miR-21等miRNAs在2個時期均呈現(xiàn)高表達;bbu-miR-148a、143、200c、200a和bbu-let-7f等miRNAs在非泌乳期特異性高表達。bbu-miR-125b、29a和bbu-let-7c等miRNAs在泌乳期特異性高表達。bbu-miR-148a、143、200a、141和30a-5p等miRNAs在泌乳期的表達量下降為非泌乳期的1/2以下。而bbu-miR-26a、29a、125b、99a和bbulet-7c等miRNAs在泌乳期表達量大于或等于2倍非泌乳期豐度。本研究構(gòu)建了水牛泌乳期以及非泌乳期乳腺組織2個miRNAs表達譜,測序確認了259個水牛miRNAs家族的359個成熟miRNAs和363個前體miRNAs,5個水牛特有miRNAs和10個高差異表達miRNAs,為進一步闡明奶水牛泌乳關(guān)鍵miRNAs作用機制奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:To identify and analyze the expression profile and differential mechanism of miRNA in buffalo mammary gland during lactation and non-lactation. The breast tissues of buffalo during lactation and non-lactation were collected, and miRNAs expression profiles of two stages were constructed by Solexa sequencing technique. The precursor miRNAs, mature miRNAs and new miRNAs, were used to identify the first preferred nucleotide and chromosome distribution of miRNAs. Overexpression and differential expression of miRNAs. in buffalo during lactation and non-lactation The results showed that two miRNA expression profiles of buffalo breast tissues during lactation and non-lactation were constructed and the high quality sequences of 12 768 110 and 12 569,467 18~31nt were obtained respectively. Sequencing confirmed that 359 mature miRNAs and 363 pre-miRNAs and 5 buffalo specific miRNAs.U belonging to 259 miRNAs families were the most common nucleotides at the 5 'end of 19 and 25nt miRNAs. Bbu-let-7b,bbu-let-7a, MiRNAs such as miR-26a and miR-21 showed high expression in both periods. MiRNAs such as bbu-miR-148a,143200c,200a and bbu-let-7f were specifically overexpressed in non-lactation period, miRNAs such as bbu-miR-125b,29a and bbu-let-7c were specifically overexpressed in lactation period. Bbu-miR-148a,143200a, The expression of miRNAs such as 141 and 30a-5p in lactation stage decreased to less than 1 / 2 of that in non-lactation stage. However, the expression of miRNAs such as bbu-miR-26a,29a,125b,99a and bbulet-7c in lactation stage was more than or equal to 2 times the abundance of non-lactation stage. In this study, two miRNAs expression profiles were constructed in buffalo breast tissues during lactation and in non-lactation stage. The sequence confirmed that 359 mature miRNAs and 363 precursor miRNAs, of 259 buffalo miRNAs family were unique to buffalo miRNAs and 10 highly differentially expressed miRNAs,. It lays a foundation for further elucidation of the mechanism of key miRNAs action in milk production of milk buffalo.
【作者單位】： 廣西大學(xué)亞熱帶農(nóng)業(yè)生物資源保護與利用國家重點實驗室;廣西壯族自治區(qū)畜牧研究所;
【基金】：國家863重點項目課題(2013AA102504) 廣西科技廳項目(桂科合14125008-2-13;桂科AD17129043;桂科AA16380026)
【分類號】：S823.83

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本文編號：2320370