【摘要】：目的獲得通遼地區(qū)奶牛乳腺炎致病菌無乳鏈球菌相關(guān)菌毛島嶼BP基因序列并進行比對分析。方法根據(jù)DNAMAN分析基因庫中牛源無乳鏈球菌菌毛島嶼PI-2a的BP基因序列設(shè)計1對特異性引物,以無乳鏈球菌通遼分離株總DNA為模板,PCR擴增BP基因片段并進行序列比對分析。結(jié)果獲得了菌毛島嶼PI-2a的BP基因序列,目的基因為609bp,編碼203個氨基酸,其基因序列與GenBank上公布的牛源無乳鏈球菌菌毛島嶼PI-2a的BP基因(EU930008)同源性為100%。BP蛋白二級結(jié)構(gòu)的α螺旋在N端分布較多,β折疊較豐富且分布C端較多,無規(guī)則卷曲分布較均勻。BP蛋白的親水區(qū)分布較廣,遍布于整個蛋白區(qū),屬于親水性蛋白。BP蛋白分子表面可及性較高,區(qū)域占比達57.0%,且具有抗原性。結(jié)論獲得了奶牛乳腺炎無乳鏈球菌通遼分離株菌毛島嶼PI-2a骨架蛋白BP基因序列,該基因序列具有高度保守性,其編碼蛋白具有抗原表位,可作為奶牛無乳鏈球菌重組基因工程疫苗候選亞單位抗原。
[Abstract]:Objective to obtain the BP gene sequence of Streptococcus lactis related island in Tongliao area. Methods A pair of specific primers were designed according to the BP gene sequence of PI-2a from Streptococcus lactobacillus pili from DNAMAN gene bank. The total DNA of Streptococcus lactis Tongliao isolate was used as template, and the BP gene fragment was amplified by PCR and compared with the sequence analysis. Results the BP gene sequence of the pili island PI-2a was obtained. The target gene was 609 BP encoding 203 amino acids. The BP gene (EU930008) homologous to the BP gene (EU930008) of Streptococcus lactococcus pili PI-2a published on GenBank was found to be a 偽 helix with a secondary structure of 100%.BP protein. The 偽 -helix of 100%.BP protein was found to be more abundant in N terminal, rich in 尾 folding and more in C-terminal distribution. The hydrophilic region of BP protein was widely distributed in the whole protein region and belonged to hydrophilic protein. The surface accessibility of BP protein was high, and the area of Prida protein was 57.0 and antigenicity. Conclusion the sequence of PI-2a skeleton protein BP gene in the tuber island of Streptococcus lactis is highly conserved and its coding protein has antigenic epitopes. It can be used as candidate subunit antigen for recombinant genetic engineering vaccine of streptococcus acuminata in dairy cattle.
【作者單位】： 內(nèi)蒙古民族大學生命科學學院內(nèi)蒙古自治區(qū)乳源性致病菌防控工程技術(shù)研究中心內(nèi)蒙古民族大學乳源性致病菌研究所;
【基金】：國家自然科學基金項目(No.31560689) 內(nèi)蒙古自治區(qū)乳源性致病菌防控工程技術(shù)研究中心開放課題(No.MDK2016036)
【分類號】：S852.61

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本文編號：2306657