【摘要】：試驗旨在研究浦東白豬現存群體的遺傳多樣性及其繁殖性能變化的原因。利用全基因組范圍內的遺傳標記(SNPs),對比6個太湖流域地方品種及3個西方引進品種,對浦東白豬的遺傳多樣性進行了分析。同時利用落入繁殖候選基因內的SNPs,分析了群體的多樣性及結構。結果顯示,相較于本研究中所選擇的太湖流域地方品種及西方引進品種,浦東白豬的遺傳多樣性較太湖流域地方品種低;除楓涇豬外,浦東白豬繁殖相關SNPs的多態(tài)性標記的比例、期望雜合度最低,等位基因豐度僅高于杜洛克豬;主成分分析(PCA)結果揭示浦東白豬繁殖相關SNPs位點仍具有其群體獨特性。研究結果揭示了浦東白豬現存群體遺傳多樣性較低,繁殖性能的退化可能是由于一些有利等位基因的滅絕、繁殖相關基因多態(tài)性及個體雜合性的降低所致。但是浦東白豬仍然攜帶一定數量的有利等位基因且依舊具有其群體獨特性,暗示浦東白豬仍具有較高的保種價值。本研究為浦東白豬后期的選育、保種和開發(fā)利用提供了一定的參考。
[Abstract]:The aim of the experiment was to study the genetic diversity and reproductive performance of Pudong White Pig. Genetic diversity of Pudong White Pigs was analyzed by using genomic (SNPs), to compare 6 local breeds and 3 imported varieties in Taihu Basin. At the same time, the diversity and structure of the population were analyzed by using SNPs which fell into the breeding candidate gene. The results showed that the genetic diversity of Pudong White Pig was lower than that of Taihu River Basin, except for Fengjing Pig. The proportion of polymorphic markers of reproductive related SNPs in Pudong white pigs was the lowest and the allelic abundance was only higher than that in Duroc pigs. Principal component analysis (PCA) showed that the SNPs loci of Pudong white pigs were still unique in population. The results showed that the genetic diversity of the existing population of Pudong white pigs was low, and the degradation of reproductive performance might be due to the extinction of some favorable alleles, the decrease of polymorphism of breeding related genes and the decrease of individual heterozygosity. However, Pudong White Pig still carries a certain number of favorable alleles and still has its own unique population, suggesting that Pudong White Pig still has a high conservation value. This study provides some references for breeding, conservation, development and utilization of Pudong White Pig.
【作者單位】： 上海交通大學農業(yè)與生物學院;上海市獸醫(yī)生物技術重點實驗室;上海市南匯區(qū)種畜場;
【基金】：上海市科技興農重點攻關課題(滬農科推字(2016)第1-4號、滬農科產字(2014-2016)第6號) 十二五農村領域國家科技計劃課題:優(yōu)異地方豬種資源收集和品種保護策略集成(2015BAD03B01-02)
【分類號】：S828

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6 徐崇榮;牦牛品種及遺傳多樣性利用[J];畜禽業(yè);1998年05期

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9 歐江濤,鐘金城,白文林,趙素君;中國牦牛的遺傳多樣性[J];黃牛雜志;2002年04期

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6 黃種彬;鐘志新;高輝;李慧芳;;福建4個家鴨品種的分子遺傳多樣性[A];2009中國肉鴨產業(yè)發(fā)展高層論壇論文集[C];2009年

7 馬長書;葉俊華;楊前勇;馬巍;楊利國;;應用AFLP分析國內7個警用犬種的遺傳多樣性[A];中國畜牧獸醫(yī)學會養(yǎng)犬學分會第十二次全國養(yǎng)犬學術研討會論文集[C];2007年

8 何超;聶慶華;張細權;;用Z染色體SNP標記分析雞的遺傳多樣性[A];第十次全國畜禽遺傳標記研討會論文集[C];2006年

9 虞德兵;杜文興;王利剛;馬杰;劉紅林;;應用微衛(wèi)星DNA標記分析中國部分地方鵝種的遺傳多樣性[A];中國畜牧獸醫(yī)學會2004學術年會暨第五屆全國畜牧獸醫(yī)青年科技工作者學術研討會論文集（上冊）[C];2004年

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1 卞晨光;保護家畜遺傳多樣性刻不容緩[N];中國畜牧獸醫(yī)報;2012年

2 張桂香;中國地方水牛的遺傳多樣性[N];農民日報;2004年

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5 郝家勝;鵝的部分品種和有關野雁的分子系統(tǒng)學和遺傳多樣性研究[D];南京師范大學;1997年

6 何大乾;中國主要地方鴨種線粒體DNA部分序列的遺傳多樣性及其起源進化研究[D];四川農業(yè)大學;2007年

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8 曾盛誠;利用20個微衛(wèi)星標記分析國內外11個雞群體的遺傳多樣性[D];中國農業(yè)科學院;2009年

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10 榮敏;利用微衛(wèi)星標記分析中國家兔的遺傳多樣性[D];中國農業(yè)科學院;2006年

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本文編號：2164505