【摘要】：【目的】傳染性支氣管炎病毒(Infectious bronchitis virus,IBV)主要引起雞群呼吸道與腎臟疾病,是影響?zhàn)B禽業(yè)重要的病毒性病原之一。了解我國IBV的流行及基因重組情況�！痉椒ā渴占疓en Bank中我國2002-2016年間分離的92株IBV S1基因及55株IBV基因組序列,并對這些序列進行比對分析�！窘Y(jié)果】IBV S1基因序列分析結(jié)果表明,2002-2016年間我國流行的92株IBV可以分為13個基因型,包括QX、4/91、Mass、tl/CH/LDT3/03、CK/CH/LSC/99I、TW-I、TW-II、TC07-2、Ck/CH/LDL/97I、N1/62-associated、Arkansas、New-I及一個新鑒定的基因分支New-II。值得注意的是,屬于美國相關(guān)基因分支的ck/CH/LSD/110712已在我國出現(xiàn)。RDP4方法進行重組分析顯示,新出現(xiàn)的基因分支New-II病毒S1基因來源于tl/CH/LDT3/03型與QX型毒株重組,我國2002-2016年間流行的55株IBV中有52株IBV基因組存在重組事件,其中25個IBV分離株基因組中發(fā)現(xiàn)有疫苗型(Mass,tl/CH/LDT3/03及4/91型等)病毒基因組片段的重組,這一結(jié)果在Sim Plot分析中進一步得到確認�！窘Y(jié)論】根據(jù)生物信息學分析結(jié)果,證明流行于我國的IBV基因型眾多,疫苗毒株基因頻繁參與了IBV基因重組,導致IBV新的基因型或變異株出現(xiàn),提示在防控IB時要注意合理使用IBV疫苗。
[Abstract]:[objective] Infectious bronchitis virus (IBV) mainly causes respiratory and renal diseases in chickens and is one of the most important viral pathogens affecting poultry industry. To understand the prevalence and gene recombination of IBV in China. [methods] 92 IBV S1 genes and 55 IBV genomic sequences isolated from GenBank from 2002 to 2016 were collected. The results showed that the 92 IBV strains prevalent in China during 2002-2016 could be divided into 13 genotypes, including QXT 4 / 91 Masstl-r / CHLDT 3 / 03 / CHLSC99I / TW-IK / TW-IITC07-2CkP / CHLDL97IN 1 / 62-associated INA New-I and a newly identified gene branch New-II. It is worth noting that ck/ Ch / LSD / 110712, which belongs to the related gene branch of the United States, has been recombined with the. RDP4 method in China. The new gene branch, New-II virus S1 gene, originated from the recombination of tl/ Ch / LDT3 / 03 and QX strains. Among the 55 IBV strains prevalent in China from 2002 to 2016, 52 IBV genomes had recombinant events, of which 25 IBV isolates were found to have recombinant genome fragments of vaccine type (Masstlr / Ch / LDT _ 3 / 03 and 4 / 91, etc.). This result was further confirmed by Sim blot analysis. [conclusion] according to the results of bioinformatics analysis, there are many IBV genotypes prevalent in China, and the genes of vaccine strains frequently participate in the recombination of IBV genes. The emergence of new genotypes or variant strains of IBV suggests that the rational use of IBV vaccine should be paid attention to in the prevention and control of IB.
【作者單位】： 禽類預防醫(yī)學省部共建教育部重點實驗室揚州大學獸醫(yī)學院;
【基金】：國家基礎(chǔ)研究計劃項目(No.2013FY113300-4) 國家重點研發(fā)計劃項目(No.2016YFD0500803) 江蘇省優(yōu)勢學科項目 江蘇省動物重要疫病與人獸共患病防控協(xié)同創(chuàng)新中心項目~~
【分類號】：S852.65

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本文編號：2132993