【摘要】：為探討瑯琊雞遺傳多樣性和系統(tǒng)進化,了解瑯琊雞母系起源,以30只瑯琊雞為素材,通過PCR擴增和測序技術,對mtDNA D-loop區(qū)全序列進行測序,并與GenBank中公布的D-loop區(qū)全序列的19條紅色原雞序列進行比對和分析。結果表明:瑯琊雞mtDNA D-loop區(qū)全長為1 231~1 232bp,1 231bp的個體在859bp處存在C堿基缺失;30只個體共發(fā)現(xiàn)25處單核苷酸多態(tài)位點,為13種單倍型,核苷酸多樣度(Pi)為0.006 47±0.005 13,單倍型多樣度(Hd)為0.887±0.038,平均核苷酸差異(K)為7.968;系統(tǒng)發(fā)育分析顯示,瑯琊雞具有多個母系起源,13種單倍型可分為A、B、C和E 4個分支,其中E分支為瑯琊雞的優(yōu)勢單倍型,與原雞印度亞種(Gallus gallus murghi)聚為一類。這一研究從分子水平為瑯琊雞遺傳資源保護和開發(fā)利用提供了參考。
[Abstract]:In order to study the genetic diversity and phylogeny of Langya chicken and understand the origin of matrilineal line of Langya chicken, 30 Langya chickens were used as materials, and the whole sequence of mtDNA D-loop region was sequenced by PCR amplification and sequencing. The results were compared with 19 red primordial chicken sequences of D-loop region published in GenBank. The results showed that there were 25 single nucleotide polymorphic loci (13 haplotypes) in 30 individuals with mtDNA D-loop region of 1231 231bp at 859bp site. The nucleotide diversity (Pi) was 0.006 47 鹵0.005 13, the haplotype diversity (HD) was 0.887 鹵0.038, and the average nucleotide difference (K) was 7.96.The phylogenetic analysis showed that Langya chicken had 13 haplotypes of multiple maternal origin. Among them, the E branch is the dominant haplotype of Langya chicken, which is clustered with the original chicken subspecies (Gallus gallus murghi). This study provides a reference for the conservation, development and utilization of genetic resources of Langya chicken at molecular level.
【作者單位】： 江蘇省家禽科學研究所;
【基金】：國家自然科學基金資助項目(31372277、31501917)
【分類號】：S831.2

【參考文獻】

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【共引文獻】

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本文編號：2118927