發(fā)布時間：2018-07-08 17:23

  本文選題：古菌 + 金華豬　； 參考：《動物營養(yǎng)學(xué)報》2017年06期

【摘要】：本試驗旨在比較肥胖型的金華豬和瘦肉型的長白豬腸道古菌結(jié)構(gòu)的差異,分析菌群移植小鼠腸道古菌結(jié)構(gòu)。采集金華豬和長白豬的新鮮糞便,通過灌胃移植到經(jīng)廣譜抗生素處理過的小鼠腸道中,提取2種豬糞便及其移植小鼠的盲腸內(nèi)容物總基因組DNA,使用古菌通用引物對古菌16S rRNA的V4區(qū)進(jìn)行PCR擴(kuò)增,通過Illumina Hiseq測序平臺對擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行高通量測序,使用QIIME等軟件對測序序列進(jìn)行分析統(tǒng)計。結(jié)果表明:金華豬和長白豬糞便及其移植小鼠盲腸內(nèi)容物中的古菌主要包含3個門,分別為奇古菌門(Thaumarchaeota)、廣古菌門(Euryarchaeota)和泉古菌門(Crenarchaeota),其中金華豬糞便中廣古菌門的豐度高于長白豬;在屬水平上主要包含4個已知屬,優(yōu)勢屬為餐古菌屬(Cenarchaeum)。二者移植小鼠的盲腸內(nèi)容物古菌結(jié)構(gòu),在門水平上,移植小鼠的奇古菌門比例占70%以上;奇古菌門的古菌幾乎全部來源于餐古菌屬;在門和屬的水平上,金華豬和長白豬糞便移植小鼠的盲腸古菌結(jié)構(gòu)無顯著差異(P0.05),但基于操作分類單元(OTU)水平的主成分分析顯示出很好的組內(nèi)聚集。由此可見,奇古菌門的餐古菌屬是金華豬和長白豬糞便和其移植小鼠盲腸中的優(yōu)勢古菌;金華豬糞便中廣古菌門的豐度高于長白豬糞便,且二者移植小鼠盲腸內(nèi)容物之間古菌結(jié)構(gòu)在OTU水平上存在一定的差異。
[Abstract]:The purpose of this experiment was to compare the structure of intestinal ancient bacteria between the obese Jinhua pig and the lean Landrace pig, and to analyze the structure of the intestinal ancient bacteria in mice transplanted with the microflora. Fresh feces from Jinhua pig and Landrace pig were collected and transplanted into the intestine of mice treated with broad-spectrum antibiotics. The total genomic DNA of cecum contents of two kinds of pig feces and their transplanted mice were extracted. The V4 region of 16s rRNA was amplified by using the universal primer of archaea, and the high throughput sequencing was carried out by Illumina Hiseq sequencing platform. QIIME and other software were used to analyze the sequence. The results showed that the ancient bacteria in the feces of Jinhua pig and Landrace pig and the caecum contents of transplanted mice mainly contained three phylum, Thaumarchaeota, Euryarchaeota and Crenarchaeota, respectively. The abundance of Phaeophyta in Jinhua pig's feces was higher than that in Landrace. At the generic level, there are mainly 4 known genera, and the dominant genus is Cenarchaeum. The structure of the cecum contents of the two transplanted mice was more than 70% at the gate level, and almost all of the ancient bacteria of the phylum came from the genus Cyanophora; at the level of phylum and genus, the percentage of the bacteria in the gravida was more than 70%, and at the level of phylum and genus, There was no significant difference in the structure of Cecum archaea between Jinhua pig and Landrace pig faecal transplantation mice (P0.05), but the principal component analysis based on the operating classification unit (OTU) level showed a good intra-group aggregation. It can be seen from this that the genus Phaeophora is the dominant ancient bacteria in the feces of Jinhua pig and Landrace pig and the cecum of the transplanted mice, and the abundance of the phylum Ganguopsis in the feces of Jinhua pig is higher than that of the feces of Landrace pigs. There were some differences in the structure of Archaea between the two transplanted mice caecum contents at the level of OTU.
【作者單位】： 浙江農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)研究所;北京食品營養(yǎng)與人類健康高精尖創(chuàng)新中心;中國農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科技學(xué)院;
【基金】：浙江省自然科學(xué)基金重點(diǎn)項目(LZ15C170001) 北京食品營養(yǎng)與人類健康高精尖創(chuàng)新中心開放基金 國家自然科學(xué)基金(31402083)
【分類號】：S828

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本文編號：2108165