本文選題：新生仔豬腹瀉 + 病原學(xué)��； 參考：《中國(guó)畜牧獸醫(yī)》2017年06期

【摘要】：為了解粵北地區(qū)新生仔豬腹瀉病的主要病原,本試驗(yàn)采用實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR方法對(duì)2015年粵北地區(qū)6個(gè)規(guī)�；i場(chǎng)31份新生仔豬腹瀉樣品進(jìn)行了豬流行腹瀉病毒(PEDV)、豬傳染性胃腸炎病毒(TGEV)和豬輪狀病毒(PoRV)檢測(cè),并對(duì)5株P(guān)EDV流行毒株ORF3基因進(jìn)行測(cè)序分析。病原檢測(cè)結(jié)果顯示,83.87%(26/31)樣品為PEDV陽(yáng)性,沒(méi)有檢測(cè)到TGEV和PoRV陽(yáng)性樣品。對(duì)PEDV ORF3基因序列分析結(jié)果顯示,5個(gè)流行毒株ORF3基因全長(zhǎng)均為675bp,相互之間核苷酸同源性為98.7%~100.0%,與參考序列同源性為94.5%~100.0%,多個(gè)核苷酸位點(diǎn)發(fā)生了共同突變。系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析結(jié)果表明,PEDV可分為兩個(gè)基因群,粵北地區(qū)流行的PEDV與2013-2015年間在中國(guó)部分地區(qū)、東南亞、北美洲和歐洲流行的PEDV遺傳關(guān)系較近,位于基因1群中的同一個(gè)亞群,而2011-2012年中國(guó)流行的PEDV主要毒株及疫苗毒株則歸類(lèi)于另外兩個(gè)基因亞群。結(jié)果表明,粵北地區(qū)新生仔豬腹瀉主要是由PEDV感染引起的,PEDV基因隨著時(shí)間推移呈現(xiàn)不斷進(jìn)化和變異趨勢(shì)。
[Abstract]:In order to understand the main pathogens of diarrhea of newborn piglets in northern Guangdong, In this study, 31 neonatal piglets diarrhea samples from 6 large scale pig farms in North Guangdong were detected by real-time fluorescent quantitative RT-PCR for porcine epidemic diarrhea virus (PEDV), transmissible gastroenteritis virus (TGEV) and rotavirus (PoRV). The ORF3 gene of 5 PEDV strains were sequenced. The results showed that 83.87% (26 / 31) samples were PEDV positive, and no TGEV and PoRV positive samples were detected. The sequence analysis of the ORF3 gene of PEDV showed that the ORF3 gene was 675 BP in length, the nucleotide homology was 98.7100.0and the homology with the reference sequence was 94.5%. Phylogenetic tree analysis showed that PEDV could be divided into two gene groups. PEDV prevalent in northern Guangdong had a close genetic relationship with PEDV prevalent in parts of China, Southeast Asia, North America and Europe during 2013-2015, and was located in the same subgroup of gene group 1. The main PEDV strains and vaccine strains were classified into the other two gene subgroups in China from 2011 to 2012. The results showed that the diarrhea of newborn piglets in northern Guangdong was mainly caused by PEDV infection. The PEDV gene showed a trend of evolution and variation over time.
【作者單位】： 韶關(guān)學(xué)院動(dòng)物疫病實(shí)驗(yàn)室;粵北生豬生產(chǎn)及疫病防控協(xié)同創(chuàng)新發(fā)展中心;韶關(guān)學(xué)院英東農(nóng)業(yè)科學(xué)與工程學(xué)院;
【基金】：廣東省科技計(jì)劃項(xiàng)目(2016A040402038、2013B020306008) 廣東省現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技創(chuàng)新聯(lián)盟建設(shè)項(xiàng)目(2016LM1141) 韶關(guān)市科技計(jì)劃項(xiàng)目(2013CX/N09) 韶關(guān)學(xué)院校級(jí)科研項(xiàng)目(SY2016KJ24)
【分類(lèi)號(hào)】：S858.28

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2106763