鴨腺病毒A型Hexon基因克隆與序列分析
本文選題:鴨腺病毒A型 + Hexon基因。 參考:《中國畜牧獸醫(yī)》2017年10期
【摘要】:為明確鴨腺病毒A型Hexon基因特征及其在腺病毒科病毒分類中的作用,本研究從前期分離鑒定的一株番鴨源鴨腺病毒A型分離株(JX2016株)中分段擴增獲得其Hexon基因編碼區(qū)。結(jié)果發(fā)現(xiàn),鴨腺病毒A型JX2016株Hexon基因編碼區(qū)為2 733 bp,編碼910個氨基酸,與鴨腺病毒A型(FJ12025株)核苷酸同源性最高,達99.8%;與其他分離株Hexon基因核苷酸同源性均在99.4%以上;與鴨腺病毒2型(GR株,未明確分類地位)同源性僅為54.5%;與禽腺病毒A型Phelps株(雞源)及P29株(鵝源)的核苷酸同源性分別為53.6%和55.2%。遺傳進化樹分析發(fā)現(xiàn),所有鴨腺病毒A型分離株在遺傳進化上均處于相同的亞分支,且與綿羊腺病毒D型(OAV287株)均處于富AT腺病毒屬遺傳進化分支。但鴨腺病毒2型(GR株)與禽腺病毒A型Phelps株(雞源)、P29株(鵝源)卻處于同一遺傳進化分支,均屬于禽腺病毒屬遺傳進化分支;贖exon蛋白的遺傳進化分析,建議將鴨腺病毒A型重新命名為鴨源富AT腺病毒A型,將鴨腺病毒2型重新命名為鴨源禽腺病毒。
[Abstract]:In order to identify the characteristics of Hexon gene of duck adenovirus A and its role in the classification of adenoviridae, the coding region of Hexon gene was amplified from a strain of Muscovy duck adenovirus A (JX2016 strain). The results showed that the coding region of Hexon gene of duck adenovirus type A JX2016 strain was 2 733 BP, encoding 910 amino acids, the highest nucleotide homology with duck adenovirus type A (FJ12025 strain) was 99.8%, and the nucleotide homology of Hexon gene with other isolates was over 99.4%. The homology was only 54.5% with duck adenovirus type 2 (gr strain), 53.6% with avian adenovirus A Phelps strain (chicken source) and 55.2% with P29 strain (goose source). Genetic phylogenetic tree analysis showed that all duck adenovirus A isolates were in the same subbranch in genetic evolution and were in the genetic evolution branch of AT rich adenovirus with sheep adenovirus type D (OAV287 strain). However, duck adenovirus type 2 (gr strain) and avian adenovirus type A Phelps strain (chicken source) P29 strain (goose source) are in the same genetic evolution branch, both belong to the genetic evolution branch of avian adenovirus. Based on the genetic and evolutionary analysis of Hexon protein, it is suggested to rename duck adenovirus type A to duck AT rich adenovirus type A and duck adenovirus type 2 to duck origin avian adenovirus.
【作者單位】: 福建省農(nóng)業(yè)科學院畜牧獸醫(yī)研究所 福建省畜禽疫病防治工程技術(shù)研究中心 福建省禽病防治重點實驗室;
【基金】:國家水禽產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系(CARS-43) 國家自然科學基金(31602068) 福建省農(nóng)業(yè)科學院畜牧獸醫(yī)研究所基金[MYQJ2015(S)-3] 福建省自然科學基金(2015J01114) 福建省農(nóng)業(yè)科學院“青年科技英才百人計劃”專項(YC2015-12)
【分類號】:S852.65
【相似文獻】
相關(guān)期刊論文 前7條
1 薛惠斌;施軍霞;朱文川;陳敏;錢其軍;;腺病毒CNHK200-hEndostatin質(zhì)量控制方法的研究[J];第二軍醫(yī)大學學報;2007年09期
2 范書才,黃建華,趙兵,肖璐;雞腺病毒的保存與鑒定[J];中國獸藥雜志;2002年04期
3 劉岳龍,崔治中,徐福洲,段玉友,孫懷昌,秦愛建,何良梅;鵝源腺病毒Y_(81)G_4株基因組末端倒置重復序列(ITR)的核酸鑒定和結(jié)構(gòu)分析[J];中國預防獸醫(yī)學報;2000年04期
4 于作;朱遠茂;蔡紅;高欲燃;董秀梅;呂闖;薛飛;;一株3型牛腺病毒的分離與鑒定[J];中國預防獸醫(yī)學報;2011年03期
5 李澤良;王華;楊月峰;肖鳳君;魯茁壯;王立生;;腺病毒-甲病毒雜合載體的構(gòu)建[J];軍事醫(yī)學科學院院刊;2010年05期
6 郝春秋;周永興;馮志華;李謹革;賈戰(zhàn)生;王平忠;;HCVC基因腺病毒表達載體骨架質(zhì)粒pAd.HCV-C的構(gòu)建、鑒定及表達[J];世界華人消化雜志;2001年06期
7 曹潔瑋;李小鷹;;重組5型腺病毒高效擴增的研究[J];中華老年心腦血管病雜志;2010年03期
相關(guān)碩士學位論文 前2條
1 王文彬;缺失E1區(qū)豬3型腺病毒包裝細胞系的構(gòu)建[D];西北農(nóng)林科技大學;2015年
2 張祖維;犬2型腺病毒活載體構(gòu)建的基礎(chǔ)研究[D];山西農(nóng)業(yè)大學;2004年
,本文編號:2077027
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/dongwuyixue/2077027.html