基于線粒體COXⅠ基因變異探討國內(nèi)外豬種的遺傳多樣性及系統(tǒng)進化研究
發(fā)布時間:2018-06-26 17:19
本文選題:豬 + 線粒體細胞色素C氧化酶Ⅰ亞基。 參考:《浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報》2017年08期
【摘要】:基于mtDNA COXⅠ基因,探討了6個豬種687個樣本(大白豬、長白豬、杜洛克、藏豬、甘肅黑豬和八眉豬)的遺傳多樣性和各豬種間的親緣關(guān)系。對各豬種樣本mtDNACOXⅠ基因構(gòu)建混合池,并利用直接測序技術(shù)獲得6個豬種COXⅠ基因的序列,采用MEGA 6.0分析軟件基于Kimurk雙參數(shù)模型應(yīng)用鄰接法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹。結(jié)果表明,6個豬種mtDNA COXⅠ基因序列共存在21個突變位點,其中8個突變?yōu)楦魅后w特有。長白豬與杜洛克豬的多態(tài)性較豐富,含有13個相同位點的突變,核苷酸的轉(zhuǎn)換數(shù)(si)和顛換數(shù)(sv)的比值(R)分別為12和15,序列替換遠未達到飽和。而藏豬、黑豬和八眉豬的多態(tài)性較貧乏。系統(tǒng)進化樹和遺傳距離分析顯示,6個豬種及野豬先聚為一支而后與同屬為偶蹄目的牛、羊聚為一支,3個地方豬種間遺傳距離較近。外來豬種引入中國后主要是用作父本以提高生產(chǎn)速度和瘦肉率等,對本地豬種未有母系貢獻,線粒體COXⅠ基因可有效區(qū)別6個豬種的親緣關(guān)系,在一定程度上為中國地方豬品種的有效保護和合理利用提供理論依據(jù)。
[Abstract]:Based on the mtDNA Cox 鈪,
本文編號:2070810
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