miR-126-5p在沙子嶺豬睪丸組織差異表達(dá)分析及功能預(yù)測
本文選題:沙子嶺豬 + miR--p; 參考:《家畜生態(tài)學(xué)報(bào)》2017年07期
【摘要】:利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR(Real-time PCR)檢測miR-126-5p在沙子嶺豬睪丸組織8個(gè)不同發(fā)育時(shí)期(E90、D1、D30、D60、D90、D120、D150、D180)表達(dá)量,以了解其在動(dòng)物睪丸發(fā)育及精子生成中的作用。利用miRanda、TargetScan和mirWalk 3個(gè)數(shù)據(jù)庫預(yù)測miR-126-5p靶基因并取交集,利用David在線軟件分析miR-126-5p靶基因的生物功能。結(jié)果表明,miR-126-5p在胚胎期(E90-D1)睪丸組織中高表達(dá),而在生長期(D1-D90)表達(dá)量下調(diào),但在沙子嶺豬性成熟(D120)后表達(dá)量又上調(diào),其中D1表達(dá)量最高,D90表達(dá)量最低,且二者與其他7個(gè)時(shí)期均差異極顯著(P0.01);D30、E90、D180相互之間差異不顯著(P0.05),且分別與其余各時(shí)期差異極顯著(P0.01);D120與D30差異顯著(P0.05),與其余各時(shí)期差異極顯著(P0.01);D150與D60之間差異不顯著(P0.05),二者分別與其余各時(shí)期差異極顯著(P0.01)。miR-126-5p靶基因參與細(xì)胞增殖、凋亡、分化、細(xì)胞通訊、遷移及蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)等生物學(xué)過程(P0.001);靶基因分子功能包括蛋白二聚體活性、配體依賴性核受體活性(P0.001);KEGG分析顯示miR-126-5p靶基因參與TGF-β、MAPK、細(xì)胞黏附等信號(hào)通路(P0.01)。結(jié)合miR-126-5p在睪丸組織不同發(fā)育時(shí)期表達(dá)差異結(jié)果及其靶基因功能預(yù)測結(jié)果,miR-126-5p可能參與沙子嶺豬生殖細(xì)胞分化及精子生成調(diào)控,本研究為miR-126-5p在動(dòng)物精子生中的作用及其調(diào)控機(jī)制的研究提供依據(jù)。
[Abstract]:The expression of miR-126-5p in 8 different development stages of testis of Shailing pig was detected by real-time fluorescence quantitative PCR real-time PCRR. The expression of miR-126-5p was studied in order to understand the role of miR-126-5p in testicular development and spermatogenesis. The miR-126-5p target gene was predicted and intersected by three databases of miRandaScan and mirWalk, and the biological function of miR-126-5p target gene was analyzed by David online software. The results showed that the expression of miR-126-5p was highly expressed in the testis of E90-D1 at embryonic stage, but down-regulated in the growth stage of D1-D90. However, the expression level was up-regulated after sexual maturation of SHALING pig (D120). The highest expression of D1 and the lowest of the expression of D90 were observed. There were significant differences between the two groups and the other seven periods. There was no significant difference between the two groups and other periods, and there was no significant difference between P0.01D120 and D30, and there was no significant difference between P0.01D150 and D60. There were significant differences between the two groups and other stages. The target genes of P0.01N. MiR-126-5p were involved in cell proliferation. The biological processes of apoptosis, differentiation, cell communication, migration and protein transport are as follows: the target gene functions include protein dimer activity, ligand dependent nuclear receptor activity P0.001 and KEGG analysis shows that miR-126-5p target gene is involved in TGF- 尾 MAPK and cell adhesion signal pathway P0.01. Combined with the results of differential expression of miR-126-5p at different stages of testicular development and prediction of target gene function, miR-126-5p may be involved in the regulation of germ cell differentiation and spermatogenesis in Shailing pig. This study provides evidence for the study of the role of miR-126-5p in animal spermatogenesis and its regulatory mechanism.
【作者單位】: 湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)技術(shù)學(xué)院;畜禽遺傳改良湖南省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;湘潭市畜牧水產(chǎn)局;
【基金】:國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)資金(CARS-36)
【分類號(hào)】:S828
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,本文編號(hào):2030134
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