多重PCR對(duì)禽分枝桿菌亞種鑒定的初步應(yīng)用
本文選題:禽分枝桿菌 + 亞型鑒定; 參考:《中國(guó)獸藥雜志》2017年10期
【摘要】:為建立禽分枝桿菌多重PCR鑒定方法,根據(jù)國(guó)外報(bào)道的診斷方法設(shè)計(jì)4對(duì)特異性引物,選用我國(guó)禽結(jié)核參考菌株(CVCC 68201)基因組DNA為模板,優(yōu)化了退火溫度,測(cè)定了DNA最小檢測(cè)量,并進(jìn)行了特異性檢驗(yàn)。采用優(yōu)化好的多重PCR體系,對(duì)國(guó)家獸醫(yī)微生物菌種保藏中心保存的禽分枝桿菌標(biāo)準(zhǔn)菌株進(jìn)行檢測(cè)和分類。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,禽結(jié)核參考菌株(CVCC 68201)能很好的擴(kuò)增出577 bp(IS901基因片段)、385 bp(IS1245基因片段)和140 bp(dna J基因片段)三條目的條帶,基因組DNA的最小檢測(cè)量為0.38 ng/μL,目的條帶在退火溫度50℃~62℃之間均能得到有效擴(kuò)增。對(duì)23株禽分枝桿菌菌株檢測(cè),并設(shè)立牛分枝桿菌作為陰性對(duì)照,最終將禽分枝桿菌菌株分為三大類:禽亞種/森林土壤亞種、副結(jié)核亞種、人豬亞種,與國(guó)家獸醫(yī)微生物菌種保藏中心的分類結(jié)果相比不僅一致且更加詳盡而有臨床意義。因此,基于分子生物學(xué)方法建立的多重PCR方法可以對(duì)禽分枝桿菌亞型進(jìn)行快速鑒定并對(duì)禽結(jié)核病的診斷提供參考。
[Abstract]:In order to establish multiple PCR identification methods for Mycobacterium avian Mycobacterium, 4 pairs of specific primers were designed according to the diagnostic methods reported abroad, and the genomic DNA of China's avian tuberculosis reference strain (CVCC 68201) was selected as the template. The annealing temperature was optimized. The minimum detection amount of DNA was measured and the specificity test was tested. The optimized multiple PCR system was used for the national veterinarian. The experimental results showed that the reference strain of avian tuberculosis (CVCC 68201) could well amplify 577 BP (IS901 gene fragment), 385 BP (IS1245 gene fragment) and 140 BP (DNA J gene fragment), and the minimum detection amount of genomic DNA was 0.38 ng/. L, the target band can be effectively amplified between the annealing temperature of 50 C ~62 C and the detection of 23 strains of Mycobacterium avian Mycobacterium and the establishment of Mycobacterium bovis as negative control. Finally, the Mycobacterium avian Mycobacterium strain is divided into three categories: avian subspecies / forest soil subspecies, subspecies subspecies, human pig subspecies, and national veterinary microorganism Preservation Center The classification results are not only consistent and more detailed but also have clinical significance. Therefore, the multiple PCR method based on molecular biological methods can be used to quickly identify the subtypes of Mycobacterium avian Mycobacterium and provide reference for the diagnosis of avian tuberculosis.
【作者單位】: 中國(guó)獸醫(yī)藥品監(jiān)察所;山東農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院;
【基金】:國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃(2016YFD0500902)
【分類號(hào)】:S852.618
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,本文編號(hào):1983606
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