產(chǎn)氣莢膜梭菌腸毒素cpe陽性雙重?zé)晒舛縋CR方法的建立及應(yīng)用
本文選題:產(chǎn)氣莢膜梭菌 + 外毒素cpa��; 參考:《黑龍江畜牧獸醫(yī)》2017年01期
【摘要】:為了建立一種雙重?zé)晒舛縋CR方法檢測腸毒素cpe陽性的產(chǎn)氣莢膜梭菌,試驗(yàn)通過對部分發(fā)表在NCBI中的產(chǎn)氣莢膜梭菌序列進(jìn)行比對,找到其α毒素和腸毒素cpe相對保守的序列,根據(jù)保守序列設(shè)計(jì)合成2對引物和1對探針,以構(gòu)建的含有α毒素和cpe序列的克隆載體作為標(biāo)準(zhǔn)品,進(jìn)行系列條件優(yōu)化及特異性、靈敏性和重復(fù)性試驗(yàn)。結(jié)果表明:該方法具有很好的特異性和重復(fù)性,外毒素cpa的靈敏度為1.5×10~(-2)ng/m L,且在1.5×104~1.5×10~(-2)ng/m L內(nèi)Ct值與陽性質(zhì)粒濃度的對數(shù)值呈很好的線性關(guān)系,R2值達(dá)到0.991;腸毒素cpe的靈敏度為1.8×10~(-2)ng/m L,且在1.8×103~1.8×10~(-2)ng/m L內(nèi)Ct值與陽性質(zhì)粒濃度的對數(shù)值呈很好的線性關(guān)系,R2值達(dá)到0.996;該方法對大腸桿菌、沙門氏菌、巴氏桿菌等細(xì)菌核苷酸無交叉反應(yīng);批間和批內(nèi)重復(fù)性良好;同時(shí)對實(shí)驗(yàn)室保存的臨床分離的疑似菌株用建立的熒光定量方法進(jìn)行檢測,結(jié)果臨床分離菌株均為A型產(chǎn)氣莢膜梭菌。說明該雙重?zé)晒舛縋CR方法靈敏度高、特異性強(qiáng)和重復(fù)性好。
[Abstract]:In order to establish a double fluorescence quantitative PCR method for the detection of Clostridium perfringens positive for enterotoxin cpe, the sequence of Clostridium perfringens published in NCBI was compared and the relative conservative sequences of 偽 toxin and cpe were found. Two pairs of primers and one pair of probes were designed and synthesized according to the conserved sequence. The cloned vector containing 偽 toxin and cpe sequence was used as the standard, and a series of optimization conditions, specificity, sensitivity and repeatability tests were carried out. The results show that the method has good specificity and reproducibility. The sensitivity of exotoxin cpa is 1.5 脳 10~(-2)ng/m L, and the logarithmic relationship between Ct value and positive plasmid concentration in 1.5 脳 10 4 10~(-2)ng/m L is very good. R2 is 0.991.The sensitivity of enterotoxin cpe is 1.8 脳 10~(-2)ng/m L, and the logarithm of Ct value and positive plasmid concentration in 1.8 脳 10 3 脳 10~(-2)ng/m L is obtained. The value of R2 was 0.996. The method was applied to the treatment of Escherichia coli. Salmonella, Pasteurella and other bacteria have no cross-reaction with nucleotides, good reproducibility between batches and within batches, and detection of suspected strains of clinical isolates kept in laboratory with established fluorescence quantitative method. Results the clinical isolates were all type A Clostridium perfringens. The results showed that the double fluorescence quantitative PCR method was sensitive, specific and reproducible.
【作者單位】: 湖北省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所/動(dòng)物胚胎工程及分子育種湖北省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:公益性行業(yè)(農(nóng)業(yè))科研專項(xiàng)(201303044) 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)(CARS-42-G11) 湖北省農(nóng)業(yè)科學(xué)院青年科學(xué)基金項(xiàng)目(2014NKYJJ15) 動(dòng)物胚胎工程及分子育種湖北省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室項(xiàng)目(2016ZD108)
【分類號】:S852.61
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,本文編號:1965422
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