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營(yíng)養(yǎng)誘導(dǎo)舍飼哈薩克羊非繁殖季節(jié)卵巢組織中miRNAs差異表達(dá)分析

發(fā)布時(shí)間:2018-05-29 15:17

  本文選題:哈薩克羊 + 發(fā)情期 ; 參考:《畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào)》2017年04期


【摘要】:旨在利用Solexa測(cè)序技術(shù)分析、挖掘營(yíng)養(yǎng)誘導(dǎo)非繁殖季節(jié)綿羊發(fā)情期和乏情期卵巢組織micro RNAs(miRNA),為進(jìn)一步研究特定miRNA參與非繁殖季節(jié)綿羊發(fā)情的分子調(diào)控機(jī)制提供理論基礎(chǔ)。以不同營(yíng)養(yǎng)水平飼喂的哈薩克綿羊作為研究對(duì)象,在非繁殖季節(jié)前后分別屠宰已鑒定的3只發(fā)情(EN)和乏情(AN)母羊,分別采集卵巢(O)組織,構(gòu)建兩個(gè)小片段RNA文庫(kù)(OEN和OAN),進(jìn)行高通量測(cè)序和生物信息學(xué)分析,實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qRT-PCR)驗(yàn)證差異表達(dá)的miRNAs在哈薩克羊卵巢中表達(dá)水平。結(jié)果顯示,兩文庫(kù)分別獲得8 665 978(發(fā)情期)和9 071 102條(乏情期)clean reads,且絕大多數(shù)小RNA序列長(zhǎng)度為21~23nt。兩文庫(kù)相比較,發(fā)現(xiàn)有9個(gè)已知和104個(gè)未知miRNAs表達(dá)差異顯著(P0.01)。利用qRT-PCR隨機(jī)選擇的6個(gè)顯著差異表達(dá)的miRNAs進(jìn)行驗(yàn)證,其表達(dá)水平和測(cè)序分析結(jié)果一致。KEGG通路分析表明,這些差異miRNAs的靶基因主要參與了甘氨酸、絲氨酸和蘇氨酸代謝,氨基糖和核苷酸糖代謝,精氨酸和鳥氨酸代謝及甘油磷脂代謝等營(yíng)養(yǎng)調(diào)控通路。結(jié)合靶基因預(yù)測(cè)及通路富集分析,推測(cè)差異表達(dá)的miRNAs是通過(guò)營(yíng)養(yǎng)代謝通路對(duì)綿羊的非季節(jié)性發(fā)情起重要作用。
[Abstract]:The aim of this study was to explore the micro RN AsmiRNAs in oestrus and oestrous stage of ovaries induced by nutrition in order to provide a theoretical basis for further study on the molecular regulation mechanism of specific miRNA in estrus of non-reproductive season sheep. Three identified estrous en and anestrous ANN ewes were slaughtered before and after non-breeding season in Kazak sheep fed with different nutritional levels. Two small RNA libraries were constructed for high throughput sequencing and bioinformatics analysis. The differential expression of miRNAs in Kazak ovaries was verified by real-time quantitative PCR qRT-PCRR. The results showed that 8 665.978 (estrus) and 9 071,102 (estrous) were obtained from the two libraries, and the vast majority of small RNA sequences were 21 ~ (23) nt. There were 9 known and 104 unknown miRNAs expression differences between the two libraries. Six differentially expressed miRNAs were randomly selected by qRT-PCR. The expression level was consistent with the results of sequencing analysis. KEGG pathway analysis showed that the target genes of these differentially expressed miRNAs were mainly involved in the metabolism of glycine, serine and threonine. Amino sugar and nucleotide metabolism, arginine and ornithine metabolism, glycerol phospholipid metabolism and other nutritional regulation pathways. Combined with target gene prediction and pathway enrichment analysis, it was speculated that differentially expressed miRNAs may play an important role in non-seasonal estrus of sheep through nutrient metabolic pathway.
【作者單位】: 石河子大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院;石河子大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31260537)
【分類號(hào)】:S826

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):1951350

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