閩西地區(qū)新流行豬偽狂犬病病毒gB基因分子特征分析
本文選題:豬偽狂犬病病毒 + gB基因; 參考:《中國獸醫(yī)學(xué)報(bào)》2017年04期
【摘要】:為了解2013-2015年閩西地區(qū)豬偽狂犬病病毒(PRV)流行株的現(xiàn)狀、分子生物學(xué)特征和遺傳演化規(guī)律,收集閩西不同地區(qū)的24株P(guān)RV分離株,并對(duì)其gB基因進(jìn)行遺傳變異分析。結(jié)果表明:24株P(guān)RV分離株與2012年國內(nèi)不同省份分離的7株P(guān)RV變異株核苷酸及氨基酸的同源性較高,分別為99.7%~100.0%和99.3%~100.0%;而與4株國外PRV經(jīng)典株的核苷酸及氨基酸同源性相對(duì)較低,分別為98.3%~98.7%和96.6%~97.7%。氨基酸多序列比對(duì)結(jié)果發(fā)現(xiàn),24株P(guān)RV分離株與7株2012年國內(nèi)不同省份分離的PRV變異株gB基因氨基酸序列同源性較高,在幾個(gè)部位均發(fā)生了一致性的變化,有很多相同的特征性氨基酸缺失與替換。遺傳進(jìn)化樹分析結(jié)果表明,24株P(guān)RV分離株與7株P(guān)RV變異株處于一個(gè)相對(duì)獨(dú)立的亞遺傳分支,親緣關(guān)系較近。而與Bartha疫苗株等4株國外經(jīng)典毒株位于不同的大分支中,親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。預(yù)測(cè)的抗原表位表明PRV閩西分離株與Bartha疫苗株相比發(fā)生了抗原漂移,該差異是否預(yù)示閩西地區(qū)流行株正在向遠(yuǎn)離疫苗株的方向變異尚需待進(jìn)一步研究。
[Abstract]:In order to understand the status quo, molecular biological characteristics and genetic evolution of porcine pseudorabies virus (PRV) epidemic strains from 2013 to 2015 in western Fujian, 24 PRV isolates from different regions of western Fujian were collected and their GB gene genetic variation was analyzed. The results showed that the nucleotide and amino acid homology of PRV isolates from 24 strains of PRV was higher than that of 7 strains of PRV mutants isolated from different provinces of China in 2012, which were 99.70.0% and 99.3%, respectively, while the nucleotide and amino acid homology with 4 foreign classical strains of PRV were relatively low. 98.3% and 96.6% respectively. The results of amino acid multiple sequence alignment showed that the amino acid sequence of GB gene of 24 PRV isolates and 7 PRV mutant strains isolated from different provinces in China in 2012 had high homology, and the amino acid sequence was consistent in several parts. There are many identical characteristic amino acid deletions and substitutions. Genetic phylogenetic tree analysis showed that 24 PRV isolates and 7 PRV variants were in a relatively independent subgenetic branch, and the genetic relationship was close. However, four foreign classical strains, such as Bartha vaccine strain, were located in different branches, and were closely related to each other. The predicted epitopes indicated that the PRV isolates from Minxi showed antigen drift compared with the Bartha vaccine strains. Whether the difference indicates that the prevalent strains in the west of Fujian are mutating away from the vaccine strains need to be further studied.
【作者單位】: 龍巖學(xué)院生命科學(xué)學(xué)院;福建省生豬疫病防控工程技術(shù)研究中心;
【基金】:國家自然科學(xué)基金青年科學(xué)基金資助項(xiàng)目(31602048) 福建省農(nóng)業(yè)科技重大專項(xiàng)資助項(xiàng)目(2014NZ0002-3) 福建省科技廳自然科學(xué)基金面上資助項(xiàng)目(2016J01712) 龍巖學(xué)院產(chǎn)學(xué)研合作資助項(xiàng)目(LC2015010)
【分類號(hào)】:S852.65
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本文編號(hào):1950700
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