香豬FSHR基因外顯子10的多態(tài)性及其與產(chǎn)仔數(shù)間的關(guān)聯(lián)分析
本文選題:FSHR基因 + 多態(tài)性 ; 參考:《中國畜牧獸醫(yī)》2017年03期
【摘要】:促卵泡激素(follicle-stimulating hormone,FSH)是垂體前葉分泌的一種糖蛋白,可通過卵泡刺激素受體(follicle-stimulating hormone receptor,FSHR)調(diào)節(jié)卵巢的功能。為了研究香豬FSHR基因外顯子10的多態(tài)性及其與產(chǎn)仔數(shù)的關(guān)系,試驗(yàn)以從江香豬為研究對(duì)象,采用PCR產(chǎn)物直接測序方法檢測基因的多態(tài)性,分析基因型與香豬產(chǎn)仔數(shù)間的關(guān)系。對(duì)8個(gè)候選位點(diǎn)進(jìn)行群體檢測證實(shí)其中2個(gè)為SNPs位點(diǎn),分別是rs322800083(C276T)和rs332115220(T601C),且新發(fā)現(xiàn)1個(gè)SNP位點(diǎn)novel 1(G-92A);rs322800083和rs332115220位點(diǎn)構(gòu)成4種單倍型,其中C-T為香豬群體的主要單倍型(45.0%),且在香豬群體中緊密連鎖(r2=0.334)。分析4種單倍型與香豬產(chǎn)仔數(shù)間的關(guān)系,在香豬的二胎產(chǎn)仔數(shù)中,單倍型C-T的總產(chǎn)仔數(shù)(total number born,TNB)最高,單倍型C-C的TNB最低,兩者之間的TNB相差0.99頭(P0.05);在香豬的三胎產(chǎn)仔數(shù)中,單倍型C-T的TNB最高,與單倍型T-C、C-C間的TNB分別相差1.61和2.33頭(P0.01)。rs332115220位點(diǎn)的基因型與香豬的三胎產(chǎn)仔數(shù)呈弱的正相關(guān)關(guān)系(ρ=0.429)。本研究結(jié)果提示,單倍型C-T可以作為分子標(biāo)記應(yīng)用于香豬產(chǎn)仔數(shù)性狀的輔助選育。
[Abstract]:Follicle-stimulating hormone (FSH) is a glycoprotein secreted by the anterior pituitary gland, which regulates ovarian function through follicle-stimulating hormone receptor (FSHR). In order to study the polymorphism of exon 10 of FSHR gene in Xiang pig and its relationship with litter size, the polymorphism of gene was detected by direct sequencing of PCR products in Congjiang Xiang pig, and the relationship between genotype and litter size was analyzed. Two of the 8 candidate loci were identified as SNPs loci, rs322800083 (C276T) and rs332115220 (T601CU). One SNP locus, novel 1G -92A, rs322800083, and rs332115220 locus were found to form four haplotypes. C-T was the main haplotype of Xiang pig population. By analyzing the relationship between four haplotypes and piglets, the total litter size of haplotype C-T was the highest, and the TNB of haplotype C-C was the lowest, the difference of TNB between them was 0.99 and 0.99, respectively, and in the third litter size of Xiang pig, the total litter size of C-T was the highest and the TNB of haplotype C-C was the lowest. The TNB of haplotype C-T was the highest, and the TNB of haplotype C-T was 1.61 and 2.33, respectively. There was a weak positive correlation between the genotype of P0.01U. Rs332115220 and the third litter size of Xiang pig. The results suggested that haplotype C-T could be used as a molecular marker in assisted breeding of piglets litter size traits.
【作者單位】: 貴州大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;貴州大學(xué)農(nóng)業(yè)生物工程研究院;貴州大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院;銅仁學(xué)院;
【基金】:國家高技術(shù)研究發(fā)展計(jì)劃(863計(jì)劃)課題(2013AA102503) 貴州省農(nóng)業(yè)攻關(guān)項(xiàng)目(黔科合NY[2013]3073號(hào)) 貴州省"百"層次創(chuàng)新型人才項(xiàng)目(黔科合人才2016-4012號(hào)) 國家自然科學(xué)基金(31672390)
【分類號(hào)】:S828
【參考文獻(xiàn)】
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【共引文獻(xiàn)】
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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】
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本文編號(hào):1940455
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