本文選題：細毛羊 + 毛性狀��； 參考：《新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)》2015年碩士論文

【摘要】：本研究以中國美利奴羊(新疆型)為研究對象,應(yīng)用DNA混池重測序和MassArray技術(shù)篩選角蛋白基因(KRT26、KAP16)和FAIM基因的SNP,并對SNP遺傳效應(yīng)進行分析。結(jié)果如下:1.利用DNA混池重測序技術(shù)對KRT26、KAP16和FAIM基因進行序列比對分析,共檢測到29個SNPs,其中16個為同義突變,13個非同義突變。FAIM有2個外顯子取區(qū)域,有2非個同義突變。KRT26有4個外顯子區(qū)域,有2個非同義突變,6個同義突變。KAP16有4個外顯子區(qū)域,有9個非同義突變,10個同義突變。按照分型技術(shù)的要求最終篩選得到6個有用的SNPs,分別為C248582270T、C40544613G、C41006938T、A41009186G、T41006710C、A41007121C。C248582270T位點使外顯子2的第83個氨基酸由甘氨酸(Gly)變?yōu)楣劝彼?Glu);C40544613G和A41009186G位點使外顯子1的第59個氨基酸和第69個氨基酸分別由甘氨酸(Gly)變?yōu)榫彼?Arg)和纈氨酸(Val)變?yōu)楸彼?Ala);C41006938T、T41006710C和A41007121C位點使外顯子5的第375個、1451個和314個氨基酸分別由甘氨酸(Gly)變?yōu)榻z氨酸(Ser)、異亮氨酸(Ile)變?yōu)槔i氨酸(Val)、半胱氨酸(Cys)變?yōu)楦拾彼?Gly)。2.應(yīng)用MassArray技術(shù),對KRT26、KAP16和FAIM基因的SNPs進行分型,并采用SAS8.1軟件分析基因型跟毛性狀的關(guān)系,結(jié)果得到:C41006938T位點對剪毛后體重有極顯著的影響。A41009186G位點對彎曲數(shù)有顯著的影響。T41006710C位點對纖維直徑變異系數(shù)和鑒定時體重有顯著的影響。KAP16基因的C41006938T位點,CC基因型的剪毛后體重顯著低于CT和TT基因型。A41009186G位點,AA基因型的彎曲數(shù)顯著高于GA和GG基因型。A41006710C位點,CC基因型的纖維直徑變異系數(shù)和鑒定時體重顯著高于CT和TT基因型。3.利用Haploview version4.1軟件對6個SNP進行連鎖不平衡分析,其中4個SNP組成一個單倍型Block分別為C41006938T、A41009186G、T41006710C、A41007121C。T41006710C和C41006938T處于強連鎖不平衡狀態(tài);T41006710C和A41009186G、C41006938T和A41009186G處于連鎖不平衡狀態(tài)。C41006938T與A41009186G位點單倍型的變異系數(shù)和剪毛后體重顯著差異于其他單倍型。
[Abstract]:The results were as follows : 1 . The mutations of KRT26 , KAP16 and FAIM were screened by using DNA mixed - cell re - sequencing technique .
【學(xué)位授予單位】：新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：S826

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1 買爾哈巴·艾合麥提;角蛋白及FAIM基因?qū)毭蛎誀畹倪z傳效應(yīng)[D];新疆農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

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本文編號：1918049