豬腦心肌炎病毒非結(jié)構(gòu)蛋白3C的原核表達(dá)及生物信息學(xué)分析
本文選題:腦心肌炎病毒 + C蛋白酶 ; 參考:《中國(guó)畜牧獸醫(yī)》2017年06期
【摘要】:為獲得豬腦心肌炎病毒(EMCV)3C蛋白并進(jìn)一步了解其結(jié)構(gòu),本研究以EMCV HB10株的RNA為模板,通過(guò)RT-PCR擴(kuò)增3C基因,將其克隆至pMD18-T載體,經(jīng)PCR、雙酶切和測(cè)序鑒定,挑選測(cè)序正確的質(zhì)粒經(jīng)雙酶切獲得目的片段并將其克隆至pET32a載體以構(gòu)建重組原核表達(dá)質(zhì)粒。將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至大腸桿菌TranSetta(DE3)感受態(tài)細(xì)胞,經(jīng)IPTG誘導(dǎo)后,SDS-PAGE檢測(cè)目的蛋白表達(dá)情況,Western blotting檢測(cè)純化后3C蛋白及其對(duì)EMCV的反應(yīng)原性。結(jié)果顯示,成功克隆3C基因,長(zhǎng)度為615bp,編碼205個(gè)氨基酸。SDS-PAGE結(jié)果顯示,3C蛋白主要以包涵體形式表達(dá),His-3C蛋白大小約為40ku。Western blotting分析可知,純化后His-3C蛋白條帶單一,同時(shí)3C蛋白與EMCV細(xì)胞毒有良好的反應(yīng)原性。經(jīng)生物分析軟件預(yù)測(cè)可知,EMCV 3C蛋白為非分泌蛋白,無(wú)跨膜區(qū),有多個(gè)磷酸化位點(diǎn),參與蛋白的水解過(guò)程。3C蛋白酶作為EMCV基因組編碼蛋白中唯一的蛋白酶,在病毒復(fù)制的過(guò)程中具有不可或缺的作用。本研究成功構(gòu)建了EMCV 3C蛋白原核表達(dá)載體并對(duì)其結(jié)構(gòu)進(jìn)行了預(yù)測(cè),為進(jìn)一步研究3C蛋白的作用及催化機(jī)理奠定基礎(chǔ)。
[Abstract]:In order to obtain the protein of porcine encephalomyocarditis virus (EMC V3 C) and further understand its structure, the RNA of EMCV HB10 strain was used as template, the 3C gene was amplified by RT-PCR, cloned into pMD18-T vector, and identified by PCR, double enzyme digestion and sequencing. The target fragment was obtained by double enzyme digestion and cloned into pET32a vector to construct the recombinant prokaryotic expression plasmid. The recombinant plasmid was transformed into E. coli tranSetta-DE3) competent cells. The expression of the target protein was detected by SDS-PAGE after IPTG induction. The purified 3C protein and its reactivity to EMCV were detected by Western blotting. The results showed that 3C gene was cloned successfully, the length was 615bpand encoded 205 amino acids. SDS-PAGE showed that the size of His-3C protein expressed mainly in inclusion body was about 40ku.Western blotting, and the His-3C protein band was single after purification. At the same time, 3C protein has good reactivity with EMCV cytotoxicity. According to the prediction of bioanalysis software, EMCV3C protein is a non-secretory protein with no transmembrane region, and there are many phosphorylation sites. The protease. 3C protease is the only protease in the EMCV genome coding protein. It plays an indispensable role in the process of virus replication. In this study, the prokaryotic expression vector of EMCV 3C protein was successfully constructed and its structure was predicted, which laid a foundation for further study on the function and catalytic mechanism of 3C protein.
【作者單位】: 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所;
【基金】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院創(chuàng)新工程項(xiàng)目(ASTIP-IAS15)
【分類號(hào)】:S852.651
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,本文編號(hào):1894696
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