本文選題：豬品種 + CD基因��； 參考：《中國畜牧獸醫(yī)》2017年04期

【摘要】：基于香豬全基因組重測序數(shù)據(jù),在白細胞表面抗原CD53基因中篩選到一個結(jié)構(gòu)變異(structure variant,SV)184,為了探索不同豬品種間此結(jié)構(gòu)變異是否存在多態(tài)性變化,本試驗選擇香豬、大白豬、糯谷豬、柯樂豬、江口蘿卜豬和榮昌豬作為試驗動物,采用PCR方法對豬群中SV184的分布頻率進行比較研究,應(yīng)用RT-PCR技術(shù),分析CD53基因的原初轉(zhuǎn)錄本序列結(jié)構(gòu),研究SV184對CD53基因的轉(zhuǎn)錄是否有直接影響。結(jié)果顯示,6個豬品種中SV184的分布頻率存在明顯差異,香豬以VN基因型為主,其他5個豬品種是NN基因型占優(yōu)勢;計算兩種等位基因的頻率,香豬以缺失的V等位基因為主,其他5個豬品種以正常的N等位基因為主。選擇3種基因型個體的血液樣本,逆轉(zhuǎn)錄后分析CD53基因的原初轉(zhuǎn)錄本的序列,從中檢測到缺失型和不缺失的兩種轉(zhuǎn)錄本形式,提示SV184對CD53基因的轉(zhuǎn)錄無直接影響。SV184可作為分子標記用于區(qū)分香豬和其他豬品種。
[Abstract]:Based on the whole genome resequencing data of Xiang pig, a structural variation structure variant CD53 gene was screened from white blood cell surface antigen (WSA) gene. In order to explore whether there is a polymorphic variation in this variation among different pig breeds, Xiang pig and big white pig were selected in this experiment. As experimental animals, the distribution frequency of SV184 in pigs was studied by PCR method, and the original transcription sequence structure of CD53 gene was analyzed by RT-PCR technique. To study whether SV184 has a direct effect on the transcription of CD53 gene. The results showed that there was significant difference in the distribution frequency of SV184 among the six pig breeds, the VN genotype was dominant in Xiang pig, the NN genotype was dominant in the other five pig breeds, the frequency of the two alleles was calculated, and the missing V allele was the main allele in Xiang pig. Normal N alleles were the main alleles in the other 5 pig breeds. The original transcripts of CD53 gene were sequenced by reverse transcription from blood samples of three genotypes, and the deletion and non-deletion transcripts were detected. These results suggest that SV184 has no direct effect on the transcription of CD53 gene. SV184 can be used as a molecular marker to distinguish Xiang pig from other pig breeds.
【作者單位】： 貴州大學(xué)動物科學(xué)學(xué)院;貴州大學(xué)農(nóng)業(yè)工程研究院;
【基金】：國家高技術(shù)研究發(fā)展計劃(863計劃)課題(2013AA102503) 貴州省農(nóng)業(yè)攻關(guān)項目(黔科合NY[2013]3073號) 貴州省“百”層次創(chuàng)新型人才項目(黔科合人才2016-4012號) 國家自然科學(xué)基金(31672390)
【分類號】：S828

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本文編號：1889979