應(yīng)用高通量測(cè)序技術(shù)檢測(cè)與豬甲狀腺激素調(diào)控相關(guān)的miRNA
本文選題:金華豬 + 約克夏豬; 參考:《農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào)》2017年09期
【摘要】:豬(Sus scrofa)是一種重要的經(jīng)濟(jì)動(dòng)物,研究發(fā)現(xiàn)瘦肉型豬的血清甲狀腺激素水平高于脂肪型豬。Micro RNA(miRNA)參與調(diào)控多種生物學(xué)過(guò)程,但其在豬甲狀腺激素調(diào)控中的作用尚不清楚。本研究以去勢(shì)的120日齡的金華豬(脂肪型)和約克夏豬(瘦肉型)為研究對(duì)象,利用高通量測(cè)序技術(shù)分析其甲狀腺組織中的miRNA表達(dá)情況,共檢測(cè)到353個(gè)miRNA,包括293個(gè)已知miRNA和60個(gè)新預(yù)測(cè)的miRNA。其中有15個(gè)miRNA在兩種豬的甲狀腺中都高表達(dá),這些miRNA被報(bào)道與甲狀腺的生物學(xué)功能關(guān)系緊密。金華豬相對(duì)于約克夏豬存在18個(gè)差異表達(dá)miRNA,包括12個(gè)上調(diào)和6個(gè)下調(diào)。對(duì)差異表達(dá)的miRNA進(jìn)行靶基因預(yù)測(cè),共獲得14 913個(gè)靶基因,經(jīng)靶基因功能分析發(fā)現(xiàn),這些miRNA主要參與了甲狀腺激素合成、內(nèi)吞作用、鈣信號(hào)通路、過(guò)氧化物酶體和溶酶體等甲狀腺激素調(diào)控相關(guān)的通路。本研究首次對(duì)豬甲狀腺中miRNA表達(dá)譜進(jìn)行了分析,將補(bǔ)充甲狀腺激素調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中miRNA的作用,并在miRNA水平上為瘦肉型豬和脂肪型豬的遺傳差異提供研究基礎(chǔ)。
[Abstract]:Sus scrofa (Sus scrofa) is an important economic animal. It has been found that the serum thyroid hormone level of lean pig is higher than that of fat type pig. Micro RNAmiRNAs are involved in many biological processes, but the role of Sus scrofa in the regulation of pig thyroid hormone is not clear. In this study, 120 day old Jinhua pig (fat type) and Yorkshire pig (lean meat type) were used to analyze the expression of miRNA in thyroid tissue by high throughput sequencing. A total of 353 miRNAs were detected, including 293 known miRNA and 60 newly predicted miRNAs. Fifteen of these miRNA were overexpressed in the thyroid gland of both breeds of pigs, and these miRNA were reported to be closely related to the biological function of the thyroid gland. There were 18 differentially expressed miRNAs between Jinhua pigs and Yorkshire pigs, including 12 up-regulated and 6 down-regulated miRNAs. The target genes of differentially expressed miRNA were predicted and 14 913 target genes were obtained. By functional analysis of target genes, it was found that these miRNA were mainly involved in thyroid hormone synthesis, endocytosis and calcium signaling pathway. Peroxisome and lysosome are involved in the regulation of thyroid hormones. In this study, the expression profile of miRNA in the thyroid gland of pigs was analyzed for the first time, which would supplement the role of miRNA in the thyroid hormone regulatory network and provide a basis for studying the genetic differences between lean and fat pigs at the level of miRNA.
【作者單位】: 浙江大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院;太原理工大學(xué)力學(xué)學(xué)院;
【基金】:國(guó)家科技支撐計(jì)劃(No.2015BAD03B01) 國(guó)家自然科學(xué)基金(No.31272424)
【分類號(hào)】:S828
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,本文編號(hào):1834913
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