秦巴山區(qū)黃牛群體的微衛(wèi)星DNA遺傳多樣性
本文選題:秦巴山區(qū)黃牛 + 微衛(wèi)星DNA; 參考:《農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào)》2016年02期
【摘要】:為分析秦巴山區(qū)西鎮(zhèn)牛、赤崖牛、隕巴牛和宣漢牛4個(gè)黃牛(Bos taurus)品種的遺傳多樣性,本研究以蜀宣花牛和郟縣紅牛作對(duì)照,利用12對(duì)微衛(wèi)星引物對(duì)6個(gè)黃牛品種的289頭黃牛個(gè)體進(jìn)行了遺傳多樣性檢測(cè),統(tǒng)計(jì)了各品種的等位基因及頻率、有效等位基因數(shù)、遺傳雜合度、多態(tài)信息含量及各群體間遺傳距離,并對(duì)其進(jìn)行聚類(lèi)分析。結(jié)果表明,6個(gè)黃牛品種在12個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)共發(fā)現(xiàn)110個(gè)等位基因,等位基因頻率為0.001 6~0.517 3,總?cè)后w各位點(diǎn)平均有效等位基因數(shù)為2.787 7~7.132 6;各位點(diǎn)多態(tài)信息含量為0.519 2~0.895 3;平均雜合度為0.667 2~0.724 1。群體間發(fā)現(xiàn)特有等位基因11個(gè),基因頻率為0.008 1~0.381 6;優(yōu)勢(shì)等位基因(P0.4)19個(gè),基因頻率為0.403 2~0.820 0;共有等位基因41個(gè),占全部等位基因的37.27%,僅有13個(gè)共有等位基因?yàn)閮?yōu)勢(shì)等位基因(P0.4),占37.71%。群體間Nei's遺傳一致度為0.596 5~0.840 8,標(biāo)準(zhǔn)遺傳距離(Ds)為0.173 5~0.524 7。聚類(lèi)分析結(jié)果顯示,6個(gè)黃牛品種聚為3類(lèi),隕巴牛與宣漢牛首先聚在一起,然后同西鎮(zhèn)牛聚在一類(lèi);赤崖牛與郟縣紅牛聚為一類(lèi);蜀宣花牛自成一類(lèi)。研究結(jié)果表明,12對(duì)微衛(wèi)星標(biāo)記可用于秦巴山區(qū)黃牛遺傳多樣性的分析,秦巴山區(qū)各黃牛品種遺傳多樣性豐富,選育程度不同,4個(gè)黃牛品種雖然地理分布格局相近,自然環(huán)境相似,但親緣關(guān)系并非相近,應(yīng)為來(lái)源不同的品種。因此,西鎮(zhèn)牛、赤崖牛、隕巴牛和宣漢牛不宜合并為1個(gè)品種。本研究所揭示的秦巴山區(qū)黃牛品種的遺傳分化特點(diǎn)及親緣關(guān)系,為研究品種的遺傳共適應(yīng)特點(diǎn),預(yù)測(cè)雜交優(yōu)勢(shì),制定育種戰(zhàn)略等提供了科學(xué)依據(jù)。
[Abstract]:For the analysis of Qinba Mountain West Town Red Cliff cattle, cattle, cattle and Xuanhan cattle Pakistan from 4 cattle (Bos taurus) a variety of breeds, in this study, Shu Xuan cattle and Jiaxian Red Bull as control, the genetic diversity detection by using 12 pairs of microsatellite primers of 6 cattle breeds 289 the head of cattle, the varieties and the allele frequencies, effective number of alleles, heterozygosity, polymorphism information content and genetic distance among the populations, and carries on the cluster analysis. The results showed that 6 cattle breeds were found 110 alleles in 12 microsatellite loci, etc. the allele frequency of 0.001 6~0.517 3, the total population the average effective number of alleles was 2.787 7~7.132 6; the polymorphism information content was 0.519 2~0.895 3; the average heterozygosity was 0.667 2~0.724 between the 1. groups found specific allele 11, gene frequency was 0.008 1~0.381 6; advantage Allele (P0.4) 19, gene frequency was 0.403 2~0.820 0; a total of 41 alleles, allele accounted for 37.27%, only a total of 13 alleles was the dominant allele (P0.4), 37.71%. group Nei's genetic identity was 0.596 5~0.840 8 standard. Transmission distance (Ds) results showed that 0.173 5~0.524 7. cluster analysis, 6 cattle breeds were clustered into 3 groups, the Pakistan Xuanhan cattle and clustered together firstly, and then with the town of West cattle gathered in a class; the red cliff Jiaxian cattle and Red Bull clustered; Shu Xuan is a type of cattle. The results showed that 12 pairs of microsatellite markers can be used to analyze the diversity of Qinba mountain cattle genetic, Qinba mountain cattle breeds the abundant genetic diversity and breeding in different degrees, 4 cattle breeds although geographical distribution patterns are similar, similar to the natural environment, but the relationship is not close to the source should be so different varieties. West Town, cattle, Red Cliff cattle, meteorite cattle and Xuanhan cattle should not be combined into 1 varieties. The genetic differentiation characteristics and genetic relationships of yellow cattle breeds revealed in this study provide scientific basis for the study of genetic co adaptability, prediction of crossbreeding strength and establishment of breeding strategy.
【作者單位】: 西北農(nóng)林科技大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院;漢中職業(yè)技術(shù)學(xué)院農(nóng)林系;國(guó)家肉牛改良中心;鎮(zhèn)巴縣畜牧獸醫(yī)工作站;
【基金】:國(guó)家高技術(shù)研究發(fā)展計(jì)劃(863計(jì)劃)(No.2013AA102505和No.2011AA100307-02) 國(guó)家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系(No.CARS-38) 陜西省科技統(tǒng)籌創(chuàng)新工程計(jì)劃(No.2014KTZB02-02) 陜西省科學(xué)技術(shù)研究發(fā)展計(jì)劃項(xiàng)目(No.2012NY2-17)
【分類(lèi)號(hào)】:S823.81
【參考文獻(xiàn)】
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本文編號(hào):1761704
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