本文選題：綿羊 + 基于酶切的簡(jiǎn)化基因組測(cè)序��； 參考：《畜牧與獸醫(yī)》2017年09期

【摘要】：以基于酶切的簡(jiǎn)化基因組測(cè)序技術(shù)對(duì)3個(gè)綿羊品種(灘羊(TY)、蒙古羊(MGY)、湖羊(HY))進(jìn)行測(cè)定,通過(guò)序列比較發(fā)現(xiàn)品種間存在SNP,在分析品種群體遺傳參數(shù)的基礎(chǔ)上,建立系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)。結(jié)果表明,灘羊的SNP位點(diǎn)平均數(shù)為24 008個(gè),湖羊SNP位點(diǎn)平均數(shù)為23906個(gè),蒙古羊SNP位點(diǎn)平均數(shù)為23 306個(gè)。系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)分析表明,3個(gè)綿羊群體未能明確分類�；趥�(gè)體間的SNP差異程度,利用PCA分類成2個(gè)亞群,蒙古羊和湖羊聚為一類,灘羊單獨(dú)為一類。通過(guò)樣本的群體結(jié)構(gòu),推翻了3個(gè)綿羊群體來(lái)自于同一祖先的說(shuō)法。品種之間存在大量的SNP,該研究為地方綿羊識(shí)別和進(jìn)化提供依據(jù)。
[Abstract]:Three sheep breeds (TYT, MGYA, HYY) were determined by the simplified genomic sequencing technique based on enzyme digestion. SNPs were found among the breeds by sequence comparison. Phylogenetic tree was established on the basis of analyzing the genetic parameters of the breeds.The results showed that the average number of SNP loci was 24 008 in Tan sheep, 23 906 in Hu sheep and 23 306 in Mongolian sheep.Phylogenetic tree analysis showed that three sheep populations could not be classified clearly.Based on the degree of SNP difference among individuals, two subgroups were classified by PCA. Mongolian sheep and Hu sheep were clustered into one group, and Tan sheep were classified into two groups.The three sheep populations from the same ancestor were overturned by the population structure of the sample.A large number of SNPs exist among breeds, and this study provides evidence for the identification and evolution of local sheep.
【作者單位】： 寧夏農(nóng)林科學(xué)院動(dòng)物科學(xué)研究所;
【基金】：寧夏自治區(qū)農(nóng)業(yè)育種專項(xiàng)(2013NYYZ0404) 寧夏自然科學(xué)基金(NZ16099)
【分類號(hào)】：S826

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本文編號(hào)：1747197